建立暗饲养模型并评估视觉功能
验证暗饲养是否成功诱导视觉功能障碍。
从出生起将小鼠置于完全黑暗环境中至P36,通过qOMR测试、OCT和ERG评估视觉功能。
Single-Cell Sequencing Analysis Reveals Dysregulated Energy Metabolism and Altered Synaptic Connectivity in the Mouse Retina Following Dark Rearing
包含scRNA-seq、qPCR、免疫荧光、Seahorse代谢分析、流式细胞术、ELISA及药理学抑制/挽救实验等多层级验证,并涵盖功能与机制验证。
C57BL/6J小鼠视网膜 暗饲养小鼠模型 Müller胶质细胞 感光细胞
小鼠品系:C57BL/6J,来源:Charles River Laboratories 暗饲养时间:出生至P36 药理学抑制:IOP剂量5 mg/kg/天,腹腔注射,P21-P36 T3补充:饮用水给药,浓度25 ng/mL,pH 6.5-7.5 ERG记录:暗适应过夜,闪光强度0.01、3.0、10.0 cd·s/m²
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证暗饲养是否成功诱导视觉功能障碍。
从出生起将小鼠置于完全黑暗环境中至P36,通过qOMR测试、OCT和ERG评估视觉功能。
识别暗饲养条件下各视网膜细胞类型的转录组改变。
分离视网膜,进行scRNA-seq,通过聚类、差异表达和功能富集分析。
验证暗饲养是否导致视网膜线粒体功能障碍和能量代谢失调。
通过qPCR检测Lars2、Hif1α等基因表达,Seahorse测量OCR,JC-1染色检测线粒体膜电位,并测量ATP和NAD+/NADH。
验证暗饲养是否影响双极细胞突触传递相关分子。
通过免疫荧光检测Munc13-1蛋白表达,分析突触相关基因表达。
评估暗饲养对全身和局部甲状腺激素水平的影响及Müller胶质细胞DIO2表达。
通过ELISA测量血清和视网膜T3/T4浓度,免疫荧光检测DIO2蛋白,qPCR检测Dio2 mRNA。
确定Müller胶质细胞来源的DIO2是否具有代偿保护作用。
使用IOP抑制DIO2,并给予T3补充,评估视网膜功能和结构。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与处理 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 视网膜细胞解离 | 木瓜蛋白酶 | -- | -- |
| 脱氧核糖核酸酶I | -- | -- | |
| 细胞活率检测 | AO/PI染色试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C2019A |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | -- | -- |
| 反转录 | HiScript IV All-in-One Ultra RT SuperMix 用于qPCR | Vazyme | R433-01 |
| qPCR | SYBR Green qPCR试剂盒 | TIANGEN Biotech | FP217 |
| CFX96实时荧光定量PCR检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| 代谢检测 | ATP检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | S0026 |
| NAD+/NADH检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | S0175 | |
| 线粒体功能检测 | Seahorse XFe24分析仪 | Agilent Technologies | -- |
| 胰岛捕获通量板 | Agilent Technologies | -- | |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1染色 | Beyotime Biotechnology | C2006 |
| DAPI | -- | -- | |
| 流式细胞术 | CytoFLEX S流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
| 免疫荧光 | LARS2一抗 | Proteintech | 17097-1-AP |
| PKCα一抗 | Santa Cruz | sc-8393 | |
| UNC13A一抗 | Proteintech | 55053-1-AP | |
| 谷氨酰胺合成酶一抗 | Proteintech | 11037-2-AP | |
| DIO2一抗 | HUABIO | ER1907-46 | |
| ELISA | T3 ELISA试剂盒 | RUIXIN Biotech | RXJ202660M |
| T4 ELISA试剂盒 | RUIXIN Biotech | RXJ202844M | |
| 药理学抑制 | 碘帕酸 | MedChemExpress | HY-B1664 |
| T3补充 | 三碘甲状腺原氨酸 | MedChemExpress | HY-A0070A |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系:C57BL/6J,暗饲养时间:出生至P36,饲养环境:12小时光照/黑暗循环,暗饲养组全程黑暗 阅读提示:Methods: Animals |
| ERG记录 | 暗适应时间:>12小时,麻醉和散瞳方法,刺激强度:0.01、3.0、10.0 cd·s/m²,记录电极:金环角膜电极 阅读提示:Methods: Electroretinogram |
| scRNA-seq | 样本数量:每组3个生物学重复,细胞解离条件:木瓜蛋白酶1 mg/mL,DNase I 0.2 mg/mL,20-30分钟,37°C,测序平台:10x Genomics,NovaSeq Xplus/DNBSEQ-T7 阅读提示:Methods: Retinal Cells Dissociation and scRNA-Seq |
| 线粒体功能检测 | Seahorse实验:FCCP 5 μM,鱼藤酮/抗霉素A 1 μM,注射顺序;JC-1染色浓度0.5 μM,孵育30分钟,流式细胞仪型号 阅读提示:Methods: Seahorse Assay, Mitochondrial Membrane Potential Assessment via Flow Cytometry |
| 免疫荧光 | 抗体稀释比例:LARS2 1:200, PKCα 1:100, UNC13A 1:400, GS 1:200, DIO2 1:100;切片厚度10 μm;封片剂 阅读提示:Methods: Immunofluorescence |
| 药理学干预 | IOP剂量5 mg/kg/天,腹腔注射,P21-P36;T3浓度25 ng/mL,饮用水给药,pH 6.5-7.5 阅读提示:Methods: Pharmacological Inhibition of DIO2 and T3 Supplementation |