单细胞测序分析揭示暗饲养小鼠视网膜中能量代谢失调和突触连接改变

Single-Cell Sequencing Analysis Reveals Dysregulated Energy Metabolism and Altered Synaptic Connectivity in the Mouse Retina Following Dark Rearing

作者信息Zehui Zhu, Er Mo, Sihan Dong, Yuanyuan Li, Siyan Li, Hongzhe Li, Xinyu Zhang, Yun-E Zhao
PMID42138518
发布时间2026-05-01
DOI10.1167/iovs.67.5.35

实验完整度

高

包含scRNA-seq、qPCR、免疫荧光、Seahorse代谢分析、流式细胞术、ELISA及药理学抑制/挽救实验等多层级验证,并涵盖功能与机制验证。

主要模型

C57BL/6J小鼠视网膜 暗饲养小鼠模型 Müller胶质细胞 感光细胞

重点核对

小鼠品系:C57BL/6J,来源:Charles River Laboratories 暗饲养时间:出生至P36 药理学抑制:IOP剂量5 mg/kg/天,腹腔注射,P21-P36 T3补充:饮用水给药,浓度25 ng/mL,pH 6.5-7.5 ERG记录:暗适应过夜,闪光强度0.01、3.0、10.0 cd·s/m²

摘要

目的:本研究将单细胞RNA测序(scRNA-seq)应用于暗饲养和正常饲养小鼠的视网膜,以解析在视觉剥夺下每种细胞类型对视网膜改变的贡献。方法:C57BL/6J小鼠从出生到出生后第36天(P36)在完全黑暗的环境中饲养,此时评估视觉功能和视网膜形态。在P36,分离视网膜进行scRNA-seq,随后进行转录组分析、细胞聚类、差异表达和细胞间通讯分析。通过免疫荧光、qPCR、Seahorse代谢分析、流式细胞术和靶向生化测量验证关键发现。为了确定Müller胶质细胞来源的DIO2的功能意义,使用碘帕酸进行药理学抑制,随后补充外源性T3。结果:暗饲养显著降低了视觉功能,表现为视运动反应减弱和视网膜电图a波和b波振幅降低。感光细胞表现出线粒体基因下调,伴随着耗氧率降低、线粒体膜电位降低、ATP水平降低和Hif1α逐渐上调,共同表明在视觉剥夺下能量代谢受损。在突触水平,突触前囊泡启动蛋白UNC13A(Munc13-1)在ON双极细胞中选择性下调,而无长突细胞显示出增强的GABA能信号传导。值得注意的是,暗饲养诱导了全身和局部甲状腺激素波动,触发Müller胶质细胞中DIO2的动态代偿性上调。抑制DIO2加剧了视觉功能障碍和视网膜变薄,而T3补充成功挽救了这些缺陷。结论:这项研究表明,暗饲养引起视网膜代谢失调和突触重塑。Müller胶质细胞来源的DIO2作为关键的代偿机制,稳定局部甲状腺激素稳态,对于维持视网膜结构和功能至关重要。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
暗饲养诱导的视觉剥夺如何影响小鼠视网膜各细胞类型的分子和功能改变?
核心机制
暗饲养导致视网膜能量代谢失调(线粒体功能受损,糖酵解增强),双极细胞突触囊泡启动蛋白Unc13a下调,无长突细胞GABA能信号增强;Müller胶质细胞通过上调DIO2将T4转化为T3,代偿性维持局部甲状腺激素稳态。
主要证据
scRNA-seq显示暗饲养组感光细胞线粒体基因下调,Seahorse分析显示OCR降低,JC-1染色显示线粒体膜电位下降;免疫荧光显示Munc13-1在双极细胞中减少;CellChat分析显示GABA能信号增强;药理学抑制DIO2加重视觉功能障碍,T3补充挽救表型。
研究意义
揭示了感觉剥夺如何塑造视网膜发育和功能,并为视网膜可塑性和潜在干预策略提供概念基础。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

建立暗饲养模型并评估视觉功能

验证暗饲养是否成功诱导视觉功能障碍。

从出生起将小鼠置于完全黑暗环境中至P36,通过qOMR测试、OCT和ERG评估视觉功能。

2

单细胞RNA测序分析视网膜细胞类型转录组

识别暗饲养条件下各视网膜细胞类型的转录组改变。

分离视网膜,进行scRNA-seq,通过聚类、差异表达和功能富集分析。

3

验证能量代谢改变

验证暗饲养是否导致视网膜线粒体功能障碍和能量代谢失调。

通过qPCR检测Lars2、Hif1α等基因表达,Seahorse测量OCR,JC-1染色检测线粒体膜电位,并测量ATP和NAD+/NADH。

4

验证突触相关改变

验证暗饲养是否影响双极细胞突触传递相关分子。

通过免疫荧光检测Munc13-1蛋白表达,分析突触相关基因表达。

5

检查甲状腺激素稳态

评估暗饲养对全身和局部甲状腺激素水平的影响及Müller胶质细胞DIO2表达。

通过ELISA测量血清和视网膜T3/T4浓度,免疫荧光检测DIO2蛋白,qPCR检测Dio2 mRNA。

6

药理学抑制DIO2和T3补充

确定Müller胶质细胞来源的DIO2是否具有代偿保护作用。

使用IOP抑制DIO2,并给予T3补充,评估视网膜功能和结构。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基----
胎牛血清----
木瓜蛋白酶----
脱氧核糖核酸酶I----
AO/PI染色试剂盒Beyotime BiotechnologyC2019A
TRIzol试剂----
HiScript IV All-in-One Ultra RT SuperMix 用于qPCRVazymeR433-01
SYBR Green qPCR试剂盒TIANGEN BiotechFP217
CFX96实时荧光定量PCR检测系统Bio-Rad--
ATP检测试剂盒Beyotime BiotechnologyS0026
NAD+/NADH检测试剂盒Beyotime BiotechnologyS0175
Seahorse XFe24分析仪Agilent Technologies--
胰岛捕获通量板Agilent Technologies--
JC-1染色Beyotime BiotechnologyC2006
DAPI----
CytoFLEX S流式细胞仪Beckman Coulter--
LARS2一抗Proteintech17097-1-AP
PKCα一抗Santa Cruzsc-8393
UNC13A一抗Proteintech55053-1-AP
谷氨酰胺合成酶一抗Proteintech11037-2-AP
DIO2一抗HUABIOER1907-46
T3 ELISA试剂盒RUIXIN BiotechRXJ202660M
T4 ELISA试剂盒RUIXIN BiotechRXJ202844M
碘帕酸MedChemExpressHY-B1664
三碘甲状腺原氨酸MedChemExpressHY-A0070A

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
动物模型
小鼠品系:C57BL/6J,暗饲养时间:出生至P36,饲养环境:12小时光照/黑暗循环,暗饲养组全程黑暗
阅读提示:Methods: Animals
ERG记录
暗适应时间:>12小时,麻醉和散瞳方法,刺激强度:0.01、3.0、10.0 cd·s/m²,记录电极:金环角膜电极
阅读提示:Methods: Electroretinogram
scRNA-seq
样本数量:每组3个生物学重复,细胞解离条件:木瓜蛋白酶1 mg/mL,DNase I 0.2 mg/mL,20-30分钟,37°C,测序平台:10x Genomics,NovaSeq Xplus/DNBSEQ-T7
阅读提示:Methods: Retinal Cells Dissociation and scRNA-Seq
线粒体功能检测
Seahorse实验:FCCP 5 μM,鱼藤酮/抗霉素A 1 μM,注射顺序;JC-1染色浓度0.5 μM,孵育30分钟,流式细胞仪型号
阅读提示:Methods: Seahorse Assay, Mitochondrial Membrane Potential Assessment via Flow Cytometry
免疫荧光
抗体稀释比例:LARS2 1:200, PKCα 1:100, UNC13A 1:400, GS 1:200, DIO2 1:100;切片厚度10 μm;封片剂
阅读提示:Methods: Immunofluorescence
药理学干预
IOP剂量5 mg/kg/天,腹腔注射,P21-P36;T3浓度25 ng/mL,饮用水给药,pH 6.5-7.5
阅读提示:Methods: Pharmacological Inhibition of DIO2 and T3 Supplementation