卵母细胞Med12敲除和转录组分析
确定Med12缺失对卵母细胞转录组的影响。
通过Zp3Cre介导的敲除获得Med12缺失卵母细胞,收集D12、GV、MII期卵母细胞进行RNA-seq。
Maternal Med12 safeguards trophoblast pluripotency and placental development
包含卵母细胞和胚胎RNA-seq、组织学、免疫组化、转基因拯救实验等多个独立证据层级。
小鼠卵母细胞 E3.5囊胚 E7.5胚胎植入体 小鼠胎盘
卵母细胞特异性敲除Med12(Zp3Cre;Med12fl/fl) 胚胎RNA-seq(E3.5囊胚和E7.5组织分离) 组织学和免疫组化(CDX2, TPBPA, CEBPA) 常染色体Med12转基因拯救实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Med12缺失对卵母细胞转录组的影响。
通过Zp3Cre介导的敲除获得Med12缺失卵母细胞,收集D12、GV、MII期卵母细胞进行RNA-seq。
观察母体Med12缺失对胚胎植入和胎盘形态的影响。
将对照和突变雌鼠与野生型雄鼠交配,收集E7.5至E12.5的子宫并进行组织学分析。
鉴定母体Med12缺失在囊胚阶段引起的转录组变化。
收集E3.5囊胚进行RNA-seq,分析差异表达基因。
分析母体Med12缺失在E7.5不同胚外组织中的转录组变化。
将E7.5胚胎植入体分离为EPC、ExE和EPI,进行RNA-seq。
验证胚胎表达Med12转基因能否拯救母体Med12缺失导致的发育缺陷。
将突变雌鼠与携带激活的Med12转基因的雄鼠交配,评估生育力和后代基因型。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 组织学 | HistoCore MULTICUT切片机 | Leica Biosystems | -- |
| 免疫组织化学 | 抗CDX2抗体 | Abcam | ab76541 |
| 抗TPBPA抗体 | Abcam | ab320823 | |
| 抗CEBPA抗体 | Abcam | ab317442 | |
| 生物素-SP偶联山羊抗兔 | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 111-065-003 | |
| 过氧化物酶偶联链霉亲和素 | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 016-030-084 | |
| NovaRED底物试剂盒 | Vector Laboratories | SK-4800 | |
| Aperio GT 450扫描仪 | Leica Biosystems | -- | |
| 卵母细胞收集 | I型胶原酶 | Sigma | SCR103 |
| 牛血清白蛋白 | Sigma | A3311 | |
| MEM-α培养基 | Gibco | 12561056 | |
| 孕马血清促性腺激素 | BioVendor | RP178272100 | |
| Hepes-MEM培养基 | Gibco | 12360038 | |
| 西洛他唑 | Sigma | 231085 | |
| Trizol试剂 | ThermoFisher | 15596026 | |
| 人绒毛膜促性腺激素 | Sigma | C1063 | |
| 透明质酸酶 | Sigma | H3506 | |
| 胚胎收集 | 10X裂解缓冲液 | Takara Bio | -- |
| RNA酶抑制剂 | Takara Bio | -- | |
| 胎牛血清 | Cytiva | SH30088.03 | |
| RNA提取 | PicoPure RNA提取试剂盒 | ThermoFisher | KIT0204 |
| DNase I | Qiagen | 79254 | |
| RNA质检 | 5200片段分析仪系统 | Agilent Technologies | -- |
| RNA-seq文库构建 | SMART-Seq v4超低输入RNA试剂盒 | Takara Bio | -- |
| Tecan Universal Plus总RNA文库制备试剂盒 | Tecan Life Sciences | -- | |
| RT-qPCR | SingleShot细胞裂解试剂盒 | BioRad | 172-5080 |
| SuperScript III第一链合成系统 | ThermoFisher | 18080-051 | |
| SsoAdvanced通用SYBR Green预混液 | Biorad | 1,725,271 | |
| StepOnePlus仪器 | ThermoFisher | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 卵母细胞收集和RNA-seq | 小鼠品系和年龄(6周以上)、PMSG和hCG剂量(5 IU)、卵母细胞阶段(D12、GV、MII)、RNA-seq平台(HiSeq 4000) 阅读提示:Methods中的'Oocyte collection for RNA-seq' |
| 胚胎收集和RNA-seq | 小鼠品系和年龄(6周以上)、PMSG和hCG剂量(5 IU)、胚胎阶段(E3.5、E7.5)、组织分离(EPC、ExE、EPI)、RNA-seq平台(NovaSeq X) 阅读提示:Methods中的'Embryo collection for RNA-seq' |
| 组织学和免疫组化 | 固定液(10%福尔马林)、切片厚度(5 μm)、一抗稀释度(CDX2 1/1000, TPBPA 1/1000, CEBPA 1/2000) 阅读提示:Methods中的'Histological analysis and immunohistochemical staining' |
| 转基因拯救实验 | 雄鼠基因型(ROSAMed12(A)/+)、交配方案、产仔数和窝产仔数记录 阅读提示:Results中的'Embryonic expression of a Med12 transgene compensates for loss of maternal Med12' |