结合Maxwell试剂盒法与NaOH法DNA提取的Sm1-7-qPCR系统检测曼氏血吸虫感染的比较评估

Comparative evaluation of Sm1-7-qPCR systems incorporated with Maxwell kit-based and NaOH-based DNA extraction methods for the detection of Schistosoma mansoni infection

作者信息Yi Mu, Thomas G Egwang, Candia Rowel, Moses Adriko, Malcolm K Jones, Helena Ullyartha Pangaribuan, Toni Wandra, Donald P McManus, Pengfei Cai
PMID42115872
发布时间2026-05-11
DOI10.1186/s40249-026-01444-7

摘要

背景:世界卫生组织最新的《2021-2030年被忽视的热带病(NTD)路线图》将诊断技术列为实现2030年目标的四个重点领域之一。分子诊断检测,如实时定量PCR(qPCR),对于诊断包括血吸虫病在内的NTD具有重要价值。本研究旨在比较评估两种结合不同DNA提取方法的Sm1-7-qPCR系统,用于检测曼氏血吸虫感染。方法:开发了两种粪便DNA-qPCR系统:基于Maxwell试剂盒的粪便DNA-Sm1-7-qPCR系统(Sm1-7-qPCR-S1)和基于NaOH的粪便DNA-Sm1-7-qPCR系统(Sm1-7-qPCR-S2)。两个系统均在乌干达血吸虫病流行区和非流行区采集的粪便样本(n=482)上进行测试。采用基于Kato-Katz(KK)法或qPCR检测任一阳性结果的复合参考标准进行校准。根据不同诊断方法的结果分析曼氏血吸虫阳性率。比较两个粪便DNA-qPCR系统的DNA浓度和循环阈值(Ct值)差异(Wilcoxon符号秩检验)。结果:根据复合参考标准,曼氏血吸虫总体阳性率为52.9%(229/433),而KK法、Sm1-7-qPCR-S1和Sm1-7-qPCR-S2记录的阳性率分别为36.7%(159/433)、43.9%(190/433)和47.6%(206/433)。Sm1-7-qPCR-S2的灵敏度为90.0%,优于KK法(69.4%)和Sm1-7-qPCR-S1(83.0%)(χ²检验,P值分别为<0.0001和0.015)。在两个Sm1-7-qPCR系统均为阳性的样本(n=179)中,Sm1-7-qPCR-S2获得的Ct值显著低于Sm1-7-qPCR-S1(Wilcoxon符号秩检验,P<0.0001)。两个系统的Ct值与KK法粪便虫卵计数均呈显著负相关(Sm1-7-qPCR-S1,r=-0.5637,P<0.0001;Sm1-7-qPCR-S2,r=-0.5723,P<0.0001)。KK法与复合参考标准的一致性较高(ƙ=0.682),而两个Sm1-7-qPCR系统与参考标准的一致性几乎完全一致(ƙ分别为0.821和0.894)。结论:本研究强调,从两个系统提取的DNA样本均适用于稳健的qPCR扩增。与Sm1-7-qPCR-S1系统相比,Sm1-7-qPCR-S2系统具有多项优势,包括更高的灵敏度、更好的现场适用性和更低的成本。经过进一步优化,Sm1-7-qPCR-S2系统可整合到现有的血吸虫病监测网络中,助力疾病消除。

实验方法

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