计算机模拟验证HAP-ELP与IL-17A结合
评估HAP与ELP融合后是否影响与IL-17A的结合能力。
使用AlphaFold3预测HAP-ELP与IL-17A的复合物结构,并与已知晶体结构(PDB:5HHV)比较RMSD。
AI-validated fusion proteins for local inhibition of interleukin-17A
包含计算机模拟、体外结合与抑制实验、体内药代动力学和免疫原性研究等多层级证据链。
BALB/c小鼠干燥综合征模型(supra-LG注射) HEK-Blue IL-17报告细胞系
HAP-ELP融合蛋白的IL-17A结合亲和力(SPR测得的KD = 734 pM) HAP-ELP对IL-17A信号传导的抑制活性(HEK-Blue IL-17细胞测定IC50) 体内储库形成和药物释放动力学(IVIS成像) 免疫原性评估(BALB/c小鼠中CRP和ADA检测)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估HAP与ELP融合后是否影响与IL-17A的结合能力。
使用AlphaFold3预测HAP-ELP与IL-17A的复合物结构,并与已知晶体结构(PDB:5HHV)比较RMSD。
生产用于后续实验的HAP-ELP蛋白。
将HAP基因融合到ELP基因,在ClearColi BL21(DE3)细胞中表达,通过ITC纯化。
确定HAP-ELP的相变温度和相分离特性。
通过紫外-可见分光光度法和DLS测量不同温度下的浊度和粒径。
验证HAP-ELP与IL-17A的特异性结合和捕获能力。
使用SPR测定结合动力学;通过共凝聚实验评估从溶液中去除IL-17A的能力。
验证HAP-ELP抑制IL-17A诱导的细胞信号传导。
使用HEK-Blue IL-17报告细胞系,检测SEAP活性。
评估HAP-ELP在体内储库形成和释放动力学。
通过supra-LG注射罗丹明标记的HAP-ELP,使用IVIS成像和血样监测。
检测HAP-ELP是否引起免疫反应。
测量小鼠血浆中CRP和抗药抗体水平,并进行组织学检查。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 计算机模拟 | AlphaFold3 | -- | -- |
| 蛋白表达与纯化 | pUC57质粒 | Azenta Life Sciences | -- |
| pET-25b(+)质粒 | -- | -- | |
| ClearColi BL21(DE3)细胞 | -- | -- | |
| 蛋白纯化 | 聚乙烯亚胺 | -- | -- |
| 荧光标记 | NHS-罗丹明 | ThermoFisher | -- |
| 蛋白表征 | Bio-Rad Mini-PROTEAN TGX预制胶 | Bio-Rad | -- |
| Bio-Rad Precision Plus Protein Kaleidoscope | Bio-Rad | -- | |
| 质谱分析 | Bruker rapifleX MALDI Tissuetyper | Bruker | -- |
| 热相变表征 | Beckman Coulter DU800分光光度计 | Beckman Coulter | -- |
| Malvern Zetasizer系统 | Malvern | -- | |
| 结合动力学 | Biacore T200 | Biacore | -- |
| CM5传感芯片 | Cytiva | -- | |
| ELISA | ELISA试剂盒 | Biolegend | -- |
| 细胞培养 | HEK-Blue IL-17报告细胞系 | InvivoGen | -- |
| QUANTI-Blue试剂 | InvivoGen | -- | |
| 内毒素去除 | Detoxi-Gel树脂 | ThermoFisher | -- |
| Mustang E膜针头式过滤器 | Pall Corporation | -- | |
| 内毒素检测 | HEK-Blue LPS细胞 | InvivoGen | -- |
| 动物实验 | BALB/c小鼠 | The Jackson Laboratory | -- |
| 31G胰岛素注射器 | -- | -- | |
| 异氟烷 | -- | -- | |
| 体内成像 | IVIS Spectrum成像系统 | PerkinElmer | -- |
| 免疫原性检测 | 小鼠CRP Quantikine ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- |
| Nunc Maxisorp ELISA板 | ThermoFisher | -- | |
| HRP偶联的抗小鼠IgG/IgA/IgM二抗 | ThermoFisher | -- | |
| 检测稀释液A | Biolegend | -- | |
| AK1抗体 | -- | -- | |
| 数据分析 | GraphPad Prism | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 计算机模拟 | AlphaFold3版本、分析脚本、参考结构PDB ID、RMSD计算方法和模拟次数 阅读提示:2.1节 |
| 蛋白表达与纯化 | 表达宿主细胞系、诱导剂浓度、表达温度、纯化方法(ITC)和循环次数 阅读提示:2.3节 |
| 热相变表征 | 浓度、升温速率、DLS测量温度、样品缓冲液和pH 阅读提示:2.6节 |
| 结合动力学 | SPR仪器、固定化配体、分析物浓度范围、缓冲液组成、温度和再生条件 阅读提示:2.7节 |
| 体外抑制实验 | 细胞系、IL-17A浓度、HAP-ELP浓度范围、孵育时间和检测方法 阅读提示:2.9节 |
| 体内药代动力学 | 动物品系和年龄、给药途径、剂量、给药体积、荧光标记效率、成像时间点和血样采集方法 阅读提示:2.12节 |
| 免疫原性评估 | 动物品系和年龄、给药次数、给药剂量、检测时间点(CRP、ADA)、检测方法和阳性对照 阅读提示:2.13节 |