建立肝细胞特异性MET敲除小鼠模型
验证MET缺失对APAP诱导肝损伤的影响
通过AAV8-TBG-Cre和对照AAV8-TBG-eGFP注射METflox/flox小鼠,获得MET KO和WT小鼠,术后1周用于实验。
Hepatocyte-Specific MET Deletion Exacerbates Acetaminophen-Induced Hepatotoxicity in Mice
包含细胞系(原代人肝细胞)、动物模型(肝细胞特异性MET KO小鼠)、患者样本(公共数据)、组学分析(RNA-seq),并进行功能验证(AKT激活剂)和机制验证(JNK、AKT、线粒体损伤)。
肝细胞特异性MET敲除小鼠(MET KO) 野生型(WT)对照小鼠 原代人肝细胞
MET敲除效率:通过AAV8-TBG-Cre病毒在7-8周龄雄性METflox/flox小鼠中实现肝细胞特异性敲除,需验证敲除效果 APAP剂量和处理:小鼠禁食16小时后腹腔注射300 mg/kg APAP(含SC79实验为600 mg/kg),需核对给药时间和剂量 AKT激活剂处理:SC79(10 mg/kg,腹腔注射)在APAP过量后2小时给予,需核对溶剂(4% DMSO)及时间点 APAP处理原代人肝细胞:10 mM APAP,联合MET抑制剂capmatinib(0.1或1 μM),处理24小时,需核对细胞分离批数和处理条件 MET抑制剂浓度:capmatinib(MET抑制剂)在0.1和1 μM浓度下使用,需核对浓度和溶解条件
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证MET缺失对APAP诱导肝损伤的影响
通过AAV8-TBG-Cre和对照AAV8-TBG-eGFP注射METflox/flox小鼠,获得MET KO和WT小鼠,术后1周用于实验。
比较MET KO和WT小鼠在APAP过量后不同时间点的肝损伤程度
小鼠禁食16小时后腹腔注射APAP,收集血液和肝脏组织,检测血清ALT/AST、组织学坏死、死亡率。
确定MET缺失是否影响APAP代谢活化及抗氧化反应
检测CYP2E1表达、APAP蛋白加合物、GSH水平、抗氧化基因(GCLc, GCLm, Hmox1, Nfe2l2, Mt1)表达,并进行GSEA分析。
探究MET缺失加重肝损伤的分子机制
通过RNA-seq和免疫印迹分析JNK和AKT信号通路,使用AKT激活剂SC79验证。
验证MET缺失是否导致线粒体损伤和细胞死亡因子释放
分离线粒体,检测线粒体JNK、AIF释放,电镜观察线粒体形态,TUNEL染色检测DNA损伤。
评估MET缺失对APAP诱导后肝再生的影响
检测细胞周期蛋白(Cyclin-D1, p-RB, PCNA)表达,RNA-seq分析细胞周期通路,免疫组化检测PCNA阳性细胞。
探究MET缺失是否影响UPR
检测IRE1磷酸化、BiP表达,RNA-seq分析UPR相关基因。
验证HGF/MET信号在人类APAP诱导的急性肝衰竭中的作用
分析公共人类单核RNA测序和空间转录组数据,以及独立数据集,检测HGF/MET表达和通路激活。
验证MET抑制是否加重APAP诱导的人肝细胞死亡
原代人肝细胞用APAP和/或MET抑制剂处理,PI染色检测细胞死亡。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因敲除 | AAV8.TBG.PI.Cre.rBG | Addgene | 107787-AAV8 |
| 基因敲除对照 | AAV8.TBG.PI.eGFP.WPRE.bGH | Addgene | 105535-AAV8 |
| 药物处理 | 对乙酰氨基酚 | Sigma Aldrich | -- |
| SC79(AKT激活剂) | MedChemExpress | HY-18749 | |
| 细胞培养 | 肝细胞维持培养基 | Lonza | CC3197 |
| 组织学 | Cytoseal封片剂 | Epredia | 8310-4 |
| 电镜 | Poly/Bed 812树脂 | Polysciences, Inc. | -- |
| JEOL 1400 Plus透射电子显微镜 | JEOL | -- | |
| AMT 2k数码相机 | Advanced Microscopy Techniques | -- | |
| 生化检测 | GSH检测试剂盒 | Sigma Aldrich | -- |
| 线粒体分离 | 组织线粒体分离试剂盒 | Thermo Scientific | 89801 |
| 蛋白提取 | 组织蛋白提取试剂 | Thermo Scientific | 78510 |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Thermo Scientific | 1861284 | |
| Western blot | NuPAGE 4-12% Bis-Tris凝胶 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Immobilon-P PVDF转印膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| 磷酸化JNK (T183/Y185)抗体 | Cell Signaling Technology | 4668 | |
| JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 9252 | |
| 磷酸化AKT (T308)抗体 | Cell Signaling Technology | 2965 | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| GCLm抗体 | Cell Signaling Technology | 33381 | |
| AIF抗体 | Cell Signaling Technology | 4642 | |
| 磷酸化ERK1/2 (T202/Y204)抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 | |
| ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4696 | |
| 磷酸化RB (S807/811)抗体 | Cell Signaling Technology | 8516 | |
| Cyclin-D1抗体 | Cell Signaling Technology | 55506 | |
| PCNA抗体 | Cell Signaling Technology | 2586 | |
| IRE1α抗体 | Cell Signaling Technology | 3294 | |
| BiP抗体 | Cell Signaling Technology | 3177 | |
| VDAC抗体 | Cell Signaling Technology | 4661 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 4970 | |
| p21抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-6246 | |
| TGF-β1抗体 | R&D Systems | RDI-TGFβ1 | |
| CYP2E1抗体 | Atlas Antibodies | HPA009128 | |
| 磷酸化IRE1 (S724)抗体 | ABclonal Technologies | AP1442 | |
| GCLc抗体 | ABclonal Technologies | A25132 | |
| 免疫组化 | PCNA抗体(1:3000) | Cell Signaling Technology | 2586 |
| TUNEL | TUNEL检测试剂盒 | Sigma Aldrich | S7100 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | -- | -- |
| RNA测序 | Novogene RNA测序服务 | Novogene | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 10.0版 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与APAP处理 | 实验用METflox/flox小鼠的年龄(7-8周龄)、性别(雄性)、APAP剂量(300或600 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、禁食时间(16小时)、采样时间点(0、1、3、6、24小时) 阅读提示:Materials and Methods, Animals, Treatments, and Tissue Collection |
| MET敲除验证 | 用于敲除的AAV8-TBG-Cre病毒滴度(2.5×10^11病毒颗粒/只)、敲除效率确认(RNA-seq验证) 阅读提示:Materials and Methods, Animals, Treatments, and Tissue Collection; Supplemental Figure S1 |
| AKT激活剂实验 | SC79剂量(10 mg/kg)、给药时间(APAP后2小时)、溶剂(4% DMSO)、APAP剂量(600 mg/kg) 阅读提示:Materials and Methods, Animals, Treatments, and Tissue Collection |
| 原代人肝细胞实验 | 细胞来源(Human Liver Tissue & Hepatocytes Research Resource)、培养基(Lonza CC3197)、APAP浓度(10 mM)、MET抑制剂浓度(0.1或1 μM)、HGF浓度(50 ng/mL)、处理时间(24小时)、细胞死亡检测(PI染色) 阅读提示:Materials and Methods, Primary Human Hepatocyte Experiments |
| 转录组分析 | RNA-seq样本量(n=3)、时间点(0、6、24小时)、差异基因筛选标准(P<0.05, 1.5倍变化)、分析软件(IPA、DAVID、GSEA) 阅读提示:Materials and Methods, RNA Isolation, Sequencing, and Analysis |
| 人类数据验证 | 公共数据集(GSE223559、GSE223581、GSE120652)的获取和分析条件,差异基因标准(≥2倍变化,P<0.05) 阅读提示:Materials and Methods, RNA Isolation, Sequencing, and Analysis; Results, HGF/MET Signaling Activation in Human ALF |
| 组织学及生化检测 | 肝脏固定、切片、染色方法(H&E)、坏死面积评估、ALT/AST测量方法、GSH检测试剂盒 阅读提示:Materials and Methods, Histologic Analysis and Serum ALT/AST Measurements; Estimation of Total Glutathione Level |