血清TGFBI水平与预后的关联分析
评估血清TGFBI水平在癌症患者中的诊断和预后价值
通过ELISA检测CRC(n=54)、HCC(n=62)和健康供者(n=20)血清TGFBI浓度,并分析HCC患者(n=31)生存数据(Kaplan-Meier曲线)。
Transforming growth factor β induced as a novel secreted immune checkpoint counterinhibiting human tumor-associated T cells
包含患者样本分析(血清ELISA、组织IF、TMA)、体外细胞功能实验(TGFBI中和)、类器官共培养杀伤实验等多个独立证据层级,并包含机制验证。
结直肠癌患者外周血和肿瘤组织来源的T细胞 肝细胞癌患者外周血和肿瘤组织来源的T细胞 结直肠癌患者来源类器官与自体PBMC共培养模型
TGFBI中和抗体的浓度(3 μg/mL用于PBMC,0.3-3.0 μg/mL用于IHL,10 μg/mL用于类器官) 刺激条件:抗CD3/CD28 beads(1:5细胞比例用于PBMC,1:8用于纯化T细胞) 培养时间:PBMC和IHL为18小时或过夜,纯化T细胞为3天,类器官共培养为72小时 检测指标:流式细胞术检测CD25、CD69、IFN-γ、TNF-α、T-bet、颗粒酶B;LDH释放和ATP水平评估杀伤
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估血清TGFBI水平在癌症患者中的诊断和预后价值
通过ELISA检测CRC(n=54)、HCC(n=62)和健康供者(n=20)血清TGFBI浓度,并分析HCC患者(n=31)生存数据(Kaplan-Meier曲线)。
确定TGFBI在CRC和HCC肿瘤组织中的表达来源和分布
使用组织微阵列(TMA)和免疫荧光(IF)染色检测TGFBI表达,并与EpCAM、CD14、CD3、CD20共染。
确定TGFBI在癌症患者外周血和肿瘤浸润免疫细胞中的表达谱
通过流式细胞术分析PBMC、非肿瘤组织(NTUM)和肿瘤组织(TUM)中CD14+、CD4+、CD8+、CD20+、CD56+细胞的TGFBI表达,并检测分泌水平。
验证外源性TGFBI是否抑制T细胞活化和分化
用重组TGFBI处理健康供者PBMC,通过流式细胞术检测T-bet、IFN-γ和颗粒酶B表达。
评估TGFBI阻断是否恢复癌症患者T细胞功能
CRC和HCC患者的PBMC在抗CD3/CD28刺激下,用中和抗TGFBI抗体(3 μg/mL)或同型对照处理,通过流式细胞术检测CD25和CD69表达。
评估TGFBI阻断对肝脏常驻和浸润T细胞功能的影响
从HCC或CRC肝转移患者的非肿瘤肝组织分离肝内淋巴细胞(IHL),用抗CD3/CD28刺激,以不同浓度(0.3, 1.0, 3.0 μg/mL)抗TGFBI抗体处理,检测IFN-γ和TNF-α产生。
证明TGFBI阻断在无其他细胞来源的情况下增强T细胞自身分化和效应功能
纯化的CD4+或CD8+ T细胞(来自3个健康供者)在抗CD3/CD28刺激下,用抗TGFBI抗体(20, 10, 5 μg/mL)或同型对照处理,通过流式细胞术检测CCR7和CD45RA表达以评估分化状态。
在类器官模型中验证TGFBI阻断增强肿瘤特异性T细胞杀伤功能
CRC患者来源类器官(PDO)与自体PBMC共培养(E:T=20:1),加入抗TGFBI抗体(10 μg/mL)或对照,检测LDH释放和ATP水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| ELISA检测 | Cusabio ELISA试剂盒 | Cusabio | -- |
| 细胞分离 | CD4+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-096-533 |
| CD8+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-096-495 | |
| CD8微珠 | Miltenyi Biotec | 130-045-201 | |
| TGFBI中和实验 | 抗TGFBI抗体(兔多克隆) | Proteintech Europe | 10188-1-AP |
| 兔同型对照IgG | Novus Biologicals Europe | NBP2-24893 | |
| 抗人TGFBI单克隆抗体18B3 | -- | -- | |
| 蛋白转运抑制剂混合物 | eBioscience, Thermo Fisher Scientific | -- | |
| PDO培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher | -- |
| II型胶原酶 | Thermo Fisher | -- | |
| 基质胶(生长因子减少的基底膜提取物) | Corning | -- | |
| PDO共培养 | II型分散酶 | Sigma-Aldrich | -- |
| TrypLE Express酶 | Gibco | -- | |
| 抗人TGFBI中和抗体 | Proteintech Europe | 10188-1-AP | |
| 兔同型对照IgG | Novus Biologicals Europe | NBP2-24893 | |
| 抗人HLA-A、HLA-B、HLA-C抗体(克隆W6/32) | Biolegend | -- | |
| CellTiter-Glo发光细胞活力检测试剂盒 | Promega | -- | |
| LDH-Glo细胞毒性检测试剂盒 | Promega | -- | |
| IF检测 | CellEvent Caspase-3/7绿色检测试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| CellTracker Red CMPTX染料 | Invitrogen | -- | |
| Hoechst染料 | Invitrogen | -- | |
| Prolong-Gold防淬灭剂 | Thermo Fisher | -- | |
| 流式细胞术 | 可固定活力染料eFluor780 | eBiosciences | -- |
| BD Cytofix/Cytoperm固定/破膜试剂盒 | BD Biosciences | -- | |
| 可固定蓝色死活染料 | Thermo Fisher | L23105 | |
| LSRFortessa流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| Cytek Aurora光谱流式细胞仪 | Cytek | -- | |
| FlowJo软件V.10.0.8r1 | TreeStar | -- | |
| IF染色 | Leica TCS-SP8X激光扫描共聚焦显微镜 | Leica Microsystems | -- |
| Axioscope 5显微镜 | KMAT, Zeiss | -- | |
| ZEN显微镜软件(蓝色版) | Zeiss | -- | |
| Zeiss LSM900共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| PDO共培养 | DTX-880多功能酶标仪 | Beckman Coulter | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本收集 | 患者来源(CRC和HCC)、样本类型(血清、PBMC、组织)、样本量、知情同意 阅读提示:Materials and methods: Study population |
| 细胞分离和培养 | PBMC和T细胞分离方法、培养基组分(RPMI 1640、FBS浓度、L-谷氨酰胺、青霉素/链霉素、丙酮酸钠)、细胞密度 阅读提示:Materials and methods: Isolation of peripheral blood mononuclear cell subsets and TILs |
| TGFBI中和实验 | 中和抗体类型(兔多克隆或18B3)、浓度 (3 μg/mL或0.3-3.0 μg/mL)、刺激条件(抗CD3/CD28 beads)、培养时间 (18小时或3天) 阅读提示:Materials and methods: TGFBI neutralization in PBMCs and IHLs ex vivo, TGFBI neutralization in CD4+ and CD8+ isolated T cells |
| PDO共培养 | PDO来源、E:T比例(20:1)、细胞培养基(含BME和血清)、抗TGFBI浓度(10 μg/mL)、共培养时间(72小时) 阅读提示:Materials and methods: Patient-derived organoids, PBMC-PDO co-cultures |
| 流式细胞术 | 抗体克隆和荧光标记(详见补充表2)、门控策略、仪器(LSRFortessa或Cytek Aurora)、分析软件(FlowJo) 阅读提示:Materials and methods: Flow cytometry analysis, online supplemental figure 5 and figure 11A |