通过贝叶斯潜类别分析评估血浆游离DNA qPCR检测埃及血吸虫的诊断准确性:一项来自加蓬兰巴雷内孕妇队列的研究

Diagnostic accuracy of plasma cell-free DNA qPCR for Schistosoma haematobium assessed by Bayesian latent class analysis in a cohort of pregnant women from Lambaréné, Gabon

作者信息Youssef Hamway, Theresa Josten, Sherif Abdellatif, Piyas Mukherjee, Julia Schluckebier, Sèyigbéna P Déo-Gracias Berry, Yabo Josiane Honkpèhedji, Moustapha Nzamba Maloum, Romeo Laclong Lontchi, Paul A Nguema Moure, Brice Meulah, Pytsje T Hoekstra, Inge Kroidl, Govert J van Dam, Andrea Kreidenweiss, Meral Esen, Ayôla Akim Adégnika, Clarissa Prazeres da Costa
PMID42104414
发布时间2026-05-09
DOI10.1186/s40249-026-01447-4

摘要

背景:有效诊断血吸虫病(Schistosoma haematobium)对于疾病管理至关重要。然而,现有工具在低强度感染检测中常缺乏敏感性,这是近期WHO被忽视热带病路线图中指出的挑战。本研究旨在评估一种新型游离DNA(cfDNA)定量聚合酶链反应(qPCR)检测方法,该方法仅使用20 µl血浆并进行粗提DNA提取,旨在提高诊断准确性并降低分子检测在现场环境中的实施门槛。我们在加蓬兰巴雷内的孕妇中,将其性能与尿液过滤镜检和上转换报告颗粒侧流循环阳极抗原(UCP-LF CAA)检测进行了比较。方法:对加蓬296名孕妇开展了一项前瞻性横断面研究。于2018年12月至2020年11月期间收集EDTA抗凝血、尿液和粪便样本。尿液样本通过尿液过滤镜检和UCP-LF CAA进行分析。采用简化DNA提取方法,对20 µl冷冻血浆样本进行回顾性cfDNA qPCR检测。通过敏感性、特异性和一致性指标评估诊断准确性,并在缺乏金标准的情况下使用贝叶斯潜类别分析(BLCA)估计检测性能。结果:不同检测方法的阳性率存在差异:cfDNA qPCR为24.3%,尿液过滤镜检为18.6%,UCP-LF CAA为20.9%。检测间一致性有限。BLCA显示qPCR敏感性最高(74.0%,95% CrI:57.2-90.8),其次为UCP-LF CAA(65.7%,95% CrI:49.0-82.8)。镜检特异性最高(94.9%,95% CrI:89.6-99.3)。估计感染率在22.5%至27.1%之间。受试者工作特征(ROC)分析证实各检测方法性能良好(AUC 0.837-0.868),任意两种方法联合使用时性能提升(AUC最高达0.931)。结论:本研究验证了仅需20 µl血浆的新型cfDNA qPCR方法具有高敏感性,其性能与镜检及UCP-LF CAA相当。虽然镜检保持高特异性,但将其与qPCR或UCP-LF CAA等高敏感性检测结合可显著提升诊断效能。进一步优化这种简化qPCR检测的特异性,将推动我们实现高精度、可行的床旁诊断方案,这对资源有限地区的血吸虫病控制计划至关重要。

实验方法

产品清单

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AptaTaq基因分型预混液Roche Diagnostics Deutschland GmbH--
CFX384 Touch实时PCR检测系统Bio-Rad--