患者入组与肿瘤标本采集
确定符合资格的患者并获取复发肿瘤组织用于基因组分析。
患者接受手术切除复发肿瘤,收集肿瘤标本(至少500mg)。
A Genomically Tailored Multiagent Precision Medicine Clinical Trial for Adults with Recurrent Glioblastoma
包含临床试验(I期)的体内疗效与安全性评价,以及基于肿瘤组织的基因组分析(NGS)和纵向基因组分析,涉及患者样本和统计学比较。
复发性胶质母细胞瘤患者队列(30例)
患者纳入标准:年龄>18岁,KPS≥70,预期寿命≥3个月 主要终点:手术后35天内启动治疗(初始队列目标≥85%) 疗效评估:PFS-6、OS-9(从入组手术起算) 安全性评价:CTCAE v5.0分级,包括剂量限制性毒性定义 基因组分析:UCSF500 NGS panel,平均覆盖度>500x
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定符合资格的患者并获取复发肿瘤组织用于基因组分析。
患者接受手术切除复发肿瘤,收集肿瘤标本(至少500mg)。
识别复发肿瘤中的可靶向遗传变异。
使用UCSF500 NGS panel对肿瘤DNA进行捕获测序,分析突变、拷贝数变化、结构变异等。
根据基因组结果制定联合用药方案。
多学科肿瘤委员会审查基因组结果,推荐最多四种FDA批准药物(含一种细胞毒性骨干药物)。
评估治疗可行性、安全性和毒性。
患者在手术后35天内开始治疗,监测毒性,进行剂量调整。
评估无进展生存期和总生存期。
每8周进行MRI评估,记录PFS和OS。
识别治疗后耐药机制。
对进展后手术标本(9例)进行相同平台测序,比较遗传变异进化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| DNA提取 | QIAamp DNA FFPE组织试剂盒 | QIAGEN | -- |
| QIAamp DNA血液中量试剂盒 | QIAGEN | -- | |
| 文库构建 | KAPA HyperPrep试剂盒 | Roche | -- |
| 杂交捕获 | 定制寡核苷酸文库 | Integrated DNA Technologies | -- |
| 测序 | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina | -- |
| 免疫组织化学 | 磷酸化ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 |
| 磷酸化S6核糖体蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2215 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者入组 | 年龄>18岁,KPS≥70,预期寿命≥3个月,骨髓、肝肾功能正常 阅读提示:Methods: Exclusion and inclusion criteria |
| 基因组分析 | 肿瘤组织量≥500mg,UCSF500 panel,覆盖度>500x 阅读提示:Methods: Tumor genomic profiling |
| 治疗启动 | 术后35天内启动治疗 阅读提示:Methods: Trial design and patient population |
| 剂量方案 | 具体药物剂量(如CCNU 90mg/m2, afatinib 40mg等),以及修改后的起始剂量 阅读提示:Results: Patient safety and toxicities; Supplementary Table S1 |
| 疗效评估 | PFS-6、OS-9、mPFS、mOS,统计方法(log-rank, Fisher exact) 阅读提示:Methods: Endpoint assessment, Statistical analysis; Results |