受试者随机分组
比较两种保存方法对供体心脏的影响
纳入20名心脏移植受者,随机分配至标准冷储存或控制性低温保存组,每组10人。
Evaluating the mechanism of action behind controlled hypothermic preservation of donor hearts: A randomized pilot study
包含随机对照试验设计、蛋白质组学检测和通路分析,但样本量小且临床终点未显示显著差异,机制验证局限。
人类心脏移植受者 右心室活检样本
供体心脏保存方式:控制性低温保存(SherpaPak)或标准冷储存 样本采集时间点:器官获取、移植前、移植后第7天 蛋白质组学检测方法:LC-MS/MS结合DIA-NN分析 通路分析:PINE和IPA 样本量:每组10例
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较两种保存方法对供体心脏的影响
纳入20名心脏移植受者,随机分配至标准冷储存或控制性低温保存组,每组10人。
获取不同时间点的蛋白质表达数据
在器官获取、移植前和移植后第7天收集右心室活检样本。
鉴定和量化蛋白质表达差异
使用LC-MS/MS进行蛋白质组学分析,并使用DIA-NN进行数据处理,共鉴定2974种蛋白质。
识别差异表达蛋白相关的生物通路
使用PINE和IPA进行通路分析,比较两组在不同时间点的通路激活情况。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 样本制备 | 尿素/SDS裂解缓冲液 | -- | -- |
| S-TRAP | Protifi | -- | |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | -- |
| 蛋白质消化 | 胰蛋白酶 | -- | -- |
| 二硫苏糖醇 | -- | -- | |
| 液相色谱-质谱分析 | Orbitrap Exploris 480质谱仪 | Thermo Fisher | -- |
| Ultimate 3000液相色谱系统 | Thermo Fisher | -- | |
| 分析软件 | DIA-NN | -- | -- |
| 统计软件 | MetaboAnalyst | -- | -- |
| SAS | SAS Institute | -- | |
| 心脏保存 | SherpaPak | Paragonix Technologies | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者纳入标准 | 年龄≥18岁,预期冷缺血时间≥3小时,排除重复移植和多器官移植 阅读提示:Methods 2.1 Patient population |
| 保存方法 | 控制性低温保存(SherpaPak)或标准冷储存 阅读提示:Methods 2.1 Patient population |
| 样本采集时间点 | 器官获取、移植前、移植后第7天 阅读提示:Methods 2.1 Patient population |
| 蛋白质组学分析 | 使用Exploris 480 Orbitrap,DIA-NN版本1.8,数据库为Human UniProt 阅读提示:Methods 2.4 Proteomic analyses |
| 统计学分析 | 使用MetaboAnalyst 5.0进行t检验和通路富集,显著性阈值alpha=0.05 阅读提示:Methods 2.5 Statistical methods |