患者CSF样本收集与IgG分离
获取NMDARE患者和对照的CSF及纯化IgG,用于后续实验。
收集6例NMDARE患者和6例对照的CSF,离心后保存;使用Protein G Spin Kit从CSF中纯化IgG,并制备IgG去除的CSF。
The anti-NMDAR1 antibodies and IL-17 signaling pathway shape NMDAR encephalitis
体外hFOs模型、小鼠体内模型及患者CSF样本多层级验证,结合转录组、代谢组、蛋白质组及电生理等多项功能验证。
人前脑类器官(hFOs) C57BL/6小鼠模型(脑室内输注患者CSF) HEK 293T细胞(细胞基测定)
hFOs处理分组:NMDAR1-Ab(10 μg/mL)或患者CSF处理24小时 CSF样本来源:6例NMDARE患者及6例非受影响对照,处理前收集 NMDAR1-Ab浓度:10 μg/mL(单克隆抗体或患者CSF纯化IgG) 小鼠模型:C57BL/6雄性,8-10周龄,脑室内输注CSF(0.25 μL/h),7天后PTZ(40 mg/kg)诱发癫痫 IL-17处理浓度:100 ng/mL,处理24小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取NMDARE患者和对照的CSF及纯化IgG,用于后续实验。
收集6例NMDARE患者和6例对照的CSF,离心后保存;使用Protein G Spin Kit从CSF中纯化IgG,并制备IgG去除的CSF。
建立人前脑类器官模型,验证其包含主要脑细胞类型且表达NMDAR1。
从hiPSC(U2F)生成hFOs,培养至第110天;通过免疫染色表征神经祖细胞、神经元、星形胶质细胞、少突胶质细胞及NMDAR1表达。
验证抗NMDAR1抗体是否导致NMDAR功能减退。
将hFOs暴露于单克隆NMDAR1抗体或患者CSF纯化IgG,通过免疫染色检测细胞表面NMDAR1密度和神经元密度。
揭示抗NMDAR1抗体暴露对hFOs基因表达的影响。
对处理组和对照组hFOs进行RNA-seq,鉴定差异表达基因,进行GO/KEGG富集分析和PPI网络分析。
验证抗NMDAR1抗体暴露是否影响谷氨酸等代谢物水平。
对处理组和对照组hFOs进行靶向代谢组学分析(LC-MS/MS),鉴定差异代谢物,并ELISA验证谷氨酸水平。
评估抗NMDAR1抗体及患者CSF对hFOs神经活性的影响。
使用MEA记录hFOs的放电活动,钙成像检测钙瞬变,比较不同处理组的神经活性。
鉴定患者CSF中差异表达的炎症蛋白,寻找导致神经元过度兴奋的关键因子。
使用Olink炎症面板检测6例NMDARE患者和6例对照CSF中92种炎症相关蛋白,鉴定差异蛋白并富集分析。
验证IL-17是否导致神经元过度兴奋及其机制。
将hFOs暴露于IL-17,检测IL-17信号通路激活(ACT1, TRAF6)及神经活性;使用抗IL-17中和抗体(AIN457)处理,观察是否能缓解过度兴奋。
验证患者CSF是否导致癫痫行为,并验证IL-17中和抗体的保护作用。
通过脑室内微渗透泵向小鼠输注患者CSF或对照CSF(含或不含抗IL-17抗体),7天后注射PTZ诱导癫痫,评估Racine评分。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| CSF样本处理 | NAb™ 蛋白G离心柱试剂盒 | Thermo Fisher | 89979 |
| 细胞培养 | 基质胶 | Corning | 354277 |
| mTeSR Plus培养基 | STEMCELL Technologies | 05825 | |
| DMEM培养基 | Gibco | C11995500BT | |
| 胎牛血清 | Gibco | A3161001C | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | 10378016 | |
| 细胞基测定 | pcDNA3.1质粒 | -- | -- |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher | L3000001 | |
| 兔抗NMDAR1一抗 | Abcam | ab109182 | |
| FITC标记抗人IgG抗体 | Abcam | ab81051 | |
| Alexa Fluor 594偶联山羊抗兔IgG | Thermo Fisher | A11012 | |
| DAPI核酸染料 | Invitrogen | D1306 | |
| 显微镜(Axio Vert A1) | Zeiss | Axio Vert A1 | |
| 类器官生成 | Accutase消化液 | Sigma-Aldrich | A6964 |
| 96孔圆底超低吸附板 | Corning | 7007 | |
| 免疫染色 | O.C.T包埋剂 | Tissue-Tek | 4583 |
| 低温恒温切片机(CM1950) | Leica | CM1950 | |
| 牛血清白蛋白 | Solarbio | A8020 | |
| 小鼠抗NMDAR1抗体 | Abcam | ab134308 | |
| RNA提取 | miRNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | 217004 |
| RT-qPCR | HiScript III RT SuperMix(用于qPCR,含gDNA去除) | Vazyme | R323-01 |
| ChamQ SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q711-02 | |
| 实时荧光定量PCR系统(QuantStudio 3) | Thermo Fisher | QuantStudio 3 | |
| 代谢组学 | SCIEX QTRAP 6500+质谱仪 | SCIEX | -- |
| 600MRM平台 | Biotree | -- | |
| 钙成像 | Fluo-4 AM钙离子荧光探针 | Beyotime | S1060 |
| 蛋白质组学 | Olink® Target 96炎症面板 | Olink Proteomics AB | -- |
| 动物实验 | 微型渗透泵(型号1002) | Alzet | 1002 |
| 脑输注套件3 | Alzet | 0008851 | |
| 抗IL-17单克隆抗体(AIN457) | Selleck | A2025 | |
| 戊四唑 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CSF样本处理 | CSF样本来源(NMDARE患者及对照)、收集时间、离心条件 阅读提示:见Materials and methods: CSF sample collection |
| hFOs培养与处理 | hFOs培养方法、处理时天数(110天)、处理物浓度(NMDAR1-Ab 10 μg/mL)、处理时间(24小时) 阅读提示:见Materials and methods: Generation of hFOs, Results: NMDAR1-Ab exposure |
| 电生理检测 | MEA记录参数(15分钟)、钙成像参数(Fluo-4 AM 5 μM, 2Hz, 3分钟) 阅读提示:见Materials and methods: Microelectrode array (MEA) assay, Calcium imaging analysis |
| 蛋白质组学 | 样本量(各6例)、检测平台(Olink炎症面板)、差异蛋白筛选标准(P<0.05) 阅读提示:见Materials and methods: Olink proteomic analysis |
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、年龄、体重、饲养条件、CSF输注量、泵速率、PTZ剂量(40 mg/kg)、Racine评分标准 阅读提示:见Materials and methods: Animals, Intracerebroventricular infusion, Evaluation of seizure stages |