构建足细胞特异性Epsins三敲除小鼠模型
研究epsin家族在足细胞中的生理功能。
将Epn1fl/fl与Epn2-/-和Epn3-/-小鼠杂交,再与Podocin-Cre和Rosa-Dtrfl/fl小鼠交配,生成Pod-Epn TKO小鼠。通过PCR基因分型、免疫荧光和Western blot验证敲除效率。
Murine Epsins Play an Integral Role in Podocyte Function
包含足细胞特异性基因敲除小鼠模型(Pod-Epn TKO和Pod-Srf KO)、原代足细胞功能实验(粘附、铺展、迁移)、分子机制验证(Cdc42活性、SRF活性、ChIP-qPCR、荧光素酶报告基因)及组织学与超微结构分析,涉及多个独立证据层级。
Pod-Epn TKO小鼠(足细胞特异性Epn1/2/3三敲除) Pod-Srf KO小鼠(足细胞特异性Srf敲除) 原代小鼠足细胞
小鼠基因型:Podocin-Cre、Rosa-Dtrfl/fl、Epn1fl/fl、Epn2-/-、Epn3-/-(Pod-Epn TKO)及Srf fl/fl(Pod-Srf KO) 原代足细胞分离自出生后P1-P3小鼠,用0.1 μg/ml白喉毒素纯化 细胞粘附实验:6×10^3细胞/孔,铺于胶原蛋白I(40 μg/ml)和层粘连蛋白(10 μg/ml)包被的96孔板 Cdc42活性检测使用pull-down assay(PAK-1 PBD琼脂糖珠),SRF活性使用荧光素酶报告基因,Cdc42抑制剂ML 141浓度为20 μM 体内表型评估:尿白蛋白肌酐比、血浆肌酐、BUN、肾组织学(PAS、TRI染色)和电镜足突密度
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
研究epsin家族在足细胞中的生理功能。
将Epn1fl/fl与Epn2-/-和Epn3-/-小鼠杂交,再与Podocin-Cre和Rosa-Dtrfl/fl小鼠交配,生成Pod-Epn TKO小鼠。通过PCR基因分型、免疫荧光和Western blot验证敲除效率。
评估epsin缺失对肾功能和组织结构的影响。
收集不同年龄小鼠的尿液和血浆,检测白蛋白尿、血浆肌酐和BUN;肾组织进行组织学染色(H&E、PAS、TRI)和透射电镜观察足突和基底膜。
探索epsin缺失对Cdc42、Rac1和RhoA活性的影响。
从Pod-Epn TKO和对照小鼠中分离原代足细胞,使用pull-down实验检测GTP结合的Cdc42、Rac1和RhoA水平。
检测epsin缺失对足细胞粘附、铺展和迁移的影响。
将原代足细胞接种于胶原蛋白I和层粘连蛋白包被的培养板,进行粘附实验(结晶紫染色)、铺展实验(成像分析)和伤口愈合实验(迁移)。
研究epsin缺失导致β1整合素下调的机制。
通过Western blot、qPCR检测β1整合素(Itgb1)的蛋白和mRNA表达;通过荧光素酶报告基因检测SRF活性;通过ChIP-qPCR检测SRF与Itgb1启动子结合。并使用Cdc42抑制剂ML 141验证Cdc42对SRF活性的调控。
验证SRF在足细胞中的必要性及其与epsin缺失表型的关系。
将Srf fl/fl小鼠与Podocin-Cre和Rosa-Dtrfl/fl小鼠交配生成Pod-Srf KO小鼠,并对其进行表型分析,包括白蛋白尿、肾功能、组织学和原代足细胞功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 抗体 | 小鼠抗Wilms肿瘤抗体(克隆6F-H2) | Millipore Sigma | MAB4234 |
| 兔抗Wilms肿瘤抗体 | Abcam | ab89901 | |
| 豚鼠抗nephrin抗体 | Progen | GP-N2 | |
| 小鼠抗Rac1抗体(克隆23A8) | Millipore Sigma | 05-389 | |
| 小鼠抗RhoA抗体 | Cytoskeleton | ARH04 | |
| 小鼠抗Cdc42抗体(克隆28-10) | Millipore Sigma | MABN 2485-25UL | |
| 大鼠抗整合素β1抗体(克隆MB1.2) | Millipore Sigma | MAB1997-25UG | |
| 兔抗SRF抗体 | Cell Signaling Technology | 5147 | |
| 兔抗甘油醛-3-磷酸脱氢酶抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| 小鼠抗Fascin1抗体(D-10) | Santa Cruz Biotechnology | sc-46675 | |
| Alexa Fluor 488山羊抗兔IgG | Invitrogen | A-11008 | |
| Alexa Fluor 488山羊抗小鼠IgG | Invitrogen | A-11001 | |
| Alexa Fluor 488山羊抗大鼠IgG | Invitrogen | A-11006 | |
| Alexa Fluor 594山羊抗豚鼠IgG | Invitrogen | A-11076 | |
| Alexa Fluor 594山羊抗兔IgG | Invitrogen | A-11012 | |
| 山羊抗大鼠IgG二抗,HRP | EMD Millipore | AP136P | |
| 山羊抗小鼠IgG二抗,HRP | EMD Millipore | AP160P | |
| 山羊抗兔IgG二抗,HRP | EMD Millipore | AP187P | |
| 细胞培养 | 牛I型胶原蛋白 | Corning | 354231 |
| 天然小鼠层粘连蛋白 | Invitrogen | 23017-015 | |
| Cignal Lenti SRE报告基因(荧光素酶) | Qiagen | CLS-10L-1 | |
| SureENTRY转导试剂 | -- | 336921 | |
| 双荧光素酶检测系统 | Promega | E1910 | |
| ML 141 | Sigma-Aldrich | SML0407 | |
| RPMI 1640培养基 | Gibco | 11875-093 | |
| 胎牛血清 | Gibco | 10082147 | |
| HEPES | American Bio | -- | |
| 白喉毒素 | Sigma-Aldrich | D0564 | |
| 胰蛋白酶-EDTA | Invitrogen | -- | |
| 40微米细胞过滤器 | Falcon; BD Biosciences | -- | |
| 结晶紫 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Trizol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 高容量cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4368814 | |
| Power SYBR Green PCR预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| 7300实时PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 免疫印迹 | Bio-Rad蛋白检测试剂盒 | Bio-Rad | -- |
| 增强化学发光试剂 | Bio-Rad | -- | |
| Odyssey成像系统 | LI-COR Biosciences | -- | |
| 免疫荧光 | Retrievagen A溶液 | BD Biosciences | -- |
| 含DAPI的SlowFade封片剂 | Invitrogen | -- | |
| Cdc42/Rac1/RhoA活性检测 | Rac1/Cdc42活性检测试剂盒 | EMD Millipore | 17-441 |
| RhoA Pull-down活性检测试剂盒 | Cytoskeleton | BK036 | |
| 染色质免疫沉淀 | SimpleChIP酶法染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9004 |
| 生化检测 | 白蛋白ELISA定量试剂盒 | Bethyl Laboratories Inc | -- |
| 肌酐ELISA定量试剂盒 | BioAssay Systems | -- | |
| 显微镜 | 尼康Eclipse TE200显微镜 | Nikon | -- |
| Spot RT相机 | Diagnostic Instruments | -- | |
| Andor CSU-WDi转盘共聚焦显微镜 | Andor | -- | |
| 尼康Ti-E CFI Plan Apochromat Lambda 60×油浸物镜 | Nikon | -- | |
| 微板读取 | 微板读数仪(型号550) | Bio-Rad | -- |
| 发光检测仪 | Promega | -- | |
| 图像分析 | ImageJ软件 | NIH | -- |
| 统计软件 | GraphPad Prism 8软件 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 基因敲除小鼠生成 | 小鼠品系背景(C57BL/6J),Cre品系(Podocin-Cre),Rosa-Dtrfl/fl,基因敲除策略(Epn1fl/fl、Epn2-/-、Epn3-/-;Srf fl/fl),以及基因分型方法 阅读提示:Methods: Generation of Mice |
| 原代足细胞分离与培养 | 小鼠年龄(P1-P3),胶原蛋白包被(I型胶原,354231),培养基组成(RPMI 1640、10% FBS、100 U/ml青霉素、100 μg/ml链霉素、100 mM HEPES、1 mM碳酸氢钠、1 mM丙酮酸钠),白喉毒素浓度(0.1 μg/ml)和处理时间 阅读提示:Methods: Cell Culture |
| 细胞粘附、铺展和迁移实验 | 粘附实验:细胞数(6×10^3/孔),包被基质(胶原蛋白I 40 μg/ml、层粘连蛋白10 μg/ml),培养时间(2小时),染色方法(0.1%结晶紫,15分钟),检测波长(595 nm);铺展实验:接种密度、培养条件(37°C、5% CO2)、成像时间点(5分钟、2小时);迁移实验:划痕方法(20 μl移液器)、观察时间点(0小时、24小时) 阅读提示:Methods: Adhesion, Spreading, and Wound-Healing Assay |
| Rho GTPase活性检测 | 细胞裂解物与PAK-1 PBD珠(Cdc42/Rac1)或GST-Rhotekin-RBD珠(RhoA)的孵育条件,抗体(anti-Cdc42、anti-Rac1、anti-RhoA) 阅读提示:Methods: Cdc42, Rac1, and RhoA Activation Assay |
| SRF活性检测 | 报告基因构建(Cignal Lenti SRE Reporter),转染条件(50 MOI,20小时),ML 141处理浓度(20 μM)和时间(1小时),荧光素酶检测方法(Dual-Luciferase Assay System) 阅读提示:Methods: Luciferase Reporter Assay |
| ChIP-qPCR | 交联条件(1%甲醛),抗体(anti-SRF),试剂盒(SimpleChIP Enzymatic Chromatin IP Kit),Itgb1启动子引物序列 阅读提示:Methods: Chromatin Immunoprecipitation Assay |
| 组织学和电镜分析 | 组织固定方法(4%多聚甲醛,可加2%戊二醛),染色方法(H&E、PAS、TRI),电镜样本处理,肾小球硬化评分标准,足突密度计算,WT1阳性细胞计数 阅读提示:Methods: Kidney Tissue for Histology, Immunofluorescence, and Electron Microscopy Quantification |