形态学观察与神经支配分析
确定胰腺病变中交感神经新生的空间分布及其与肌成纤维细胞的关系
使用全组织免疫荧光和透明化技术(FLASH)对KC小鼠和人类PDAC组织进行染色,检测TUBB3、TH、αSMA、PDPN、KRT19等标记物,并通过共聚焦显微镜和电子显微镜观察组织结构。
Myofibroblasts induce neuroplasticity to promote pancreatic inflammation and cancer progression
包含组织透明化三维成像、单细胞转录组、体外细胞功能验证、遗传学模型(Tgfbr2敲除、化学遗传学DREADD)及体内动物模型等多层级验证。
KC小鼠(KrasLSL-G12D/+; Pdx1-Cre)胰腺PanIN模型 KPC小鼠(KrasLSL-G12D/+; Trp53LSL-R172H/+; Pdx1-Cre)胰腺肿瘤模型 小鼠胰腺星状细胞(PSCs) 人胰腺星状细胞(hPSCs)和人正常成纤维细胞(hN4)
神经密度定量方法:TUBB3+轴突体积/组织体积,使用ImageJ或Imaris TGF-β1处理浓度:20 ng/mL,处理时间:24-96小时 去甲肾上腺素(NE)处理浓度:10 μM,用于钙成像 6-OHDA化学交感神经切除术:剂量100 mg/kg和250 mg/kg,间隔3天 DCZ给药剂量:100 μg/kg(饮水中)或3 μg/kg(腹腔注射)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定胰腺病变中交感神经新生的空间分布及其与肌成纤维细胞的关系
使用全组织免疫荧光和透明化技术(FLASH)对KC小鼠和人类PDAC组织进行染色,检测TUBB3、TH、αSMA、PDPN、KRT19等标记物,并通过共聚焦显微镜和电子显微镜观察组织结构。
鉴定CAF亚型中与轴突导向相关的基因表达特征
对KPC肿瘤中分离的成纤维细胞(DAPI-、CD45-、CD31-、EPCAM-)进行scRNA-seq,并进行GSEA和功能富集分析;分析已发表的PSC bulk RNA-seq数据(Mucciolo et al.);验证人类PDAC scRNA-seq数据中的基因特征。
验证TGF-β1诱导的肌成纤维细胞分泌轴突导向分子并促进神经突生长
使用小鼠和人PSCs(hPSC、hN4)在3D Matrigel中培养,用TGF-β1处理以诱导myCAF样表型,或使用IL-1α或条件培养基(CM)诱导iCAF样表型。通过Western blot分析蛋白表达,用PC12细胞和原代交感神经节外植体评估条件培养基对神经突生长的影响。
验证成纤维细胞TGF-β信号在神经支配中的作用
使用CRISPR/Cas9在PSCs中敲除Tgfbr2,体外检测轴突导向分子表达和神经元突起生长;体内使用Pdgfra-CreERT2; Tgfbr2fl/fl小鼠在雨蛙素诱导的急性和慢性胰腺炎模型中评估神经支配和TNC表达。
评估交感神经对肿瘤生长和基质沉积的影响
使用6-OHDA对C57BL/6J小鼠进行化学交感神经切除,然后原位植入FC1242细胞,评估肿瘤重量和胶原沉积。
确定成纤维细胞特异性Gαq信号在胰腺炎和肿瘤进展中的作用
使用Pdgfra-CreERT2; CAG-LSL-hM3Dq小鼠(GqC),通过DCZ激活hM3Dq DREADD,在急性胰腺炎模型、PanIN模型(KF小鼠)和原位肿瘤模型中评估表型。
验证去甲肾上腺素通过α1-肾上腺素受体和Gαq信号在PSCs中诱导钙响应
使用表达GCaMP6f的PSC细胞系,通过药物处理(NE、PE、多沙唑嗪、CGP 20712、ICI 118,551、FR900359等)进行活细胞钙成像,并检测下游信号蛋白的磷酸化(Western blot)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Fisher Scientific | 10-013-CV |
| 胎牛血清 | Corning | 35-010-CV | |
| RPMI 1640培养基 | Corning | 10-040-CV | |
| 热灭活马血清 | Millipore Sigma | H1138-100ML | |
| 基质胶 | Corning | 356231 | |
| 高级DMEM/F12培养基 | Thermo Fisher Scientific | 12634028 | |
| 药物处理 | 转化生长因子-β1 | Biolegend | 763104 |
| 白细胞介素-1α | R&D Systems | 400-ML-005/CF | |
| 甲磺酸多沙唑嗪 | MedChemExpress | HY-B0098A | |
| 盐酸哌唑嗪 | MedChemExpress | HY-B0193A | |
| ICI 118,551盐酸盐 | Tocris | 0821 | |
| FR900359 | MedChemExpress | HY-117037 | |
| 去氯氯氮平 | HelloBio | HB9126 | |
| 6-羟基多巴胺 | Sigma Aldrich | H4381 | |
| 他莫昔芬 | Millipore-Sigma | T5648 | |
| 雨蛙素 | Sigma-Aldrich | C9026 | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 新霉素 | Thermo Fisher Scientific | 10131035 | |
| 杀稻瘟菌素 | Thermo Fisher Scientific | A11139-03 | |
| Western blot | cOmplete mini EDTA-free蛋白酶抑制剂 | Roche | 11836170001 |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Roche | 4906845001 | |
| DC蛋白浓度测定试剂盒 | BioRad | 5000111 | |
| NuPAGE LDS样品缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Amersham ECL Prime Western印迹检测试剂 | Cytiva | RPN2232 | |
| 免疫组化/免疫荧光 | ImmPACT DAB显色液 | Vector Laboratories | SK-4105 |
| 苏木素QS复染液 | Vector Laboratories | H3404-100 | |
| Cytoseal 60封片剂 | Fisher Scientific | 8310-4 | |
| ProLong抗淬灭封片剂 | Thermo Fisher Scientific | P36930 | |
| 细胞培养 | 胶原酶II | Gibco | 17101-015 |
| Histodenz密度梯度介质 | -- | -- | |
| 转染 | XtremeGENE 9 DNA转染试剂 | Sigma Millipore | 6365779001 |
| Lenti-X病毒浓缩液 | Takara | 631232 | |
| 钙成像 | GCaMP6f钙指示剂 | Cellomics Technology | PLV-10181-50 |
| jRGECO1a红色钙指示剂 | -- | Addgene_124775 | |
| 细胞培养 | SV40大T抗原 | -- | Addgene_170255 |
| 免疫组化/免疫荧光 | 抗小鼠CD16/CD32 Fc受体阻断剂 | Biolegend | 101302 |
| 单细胞RNA-seq | Chromium Next GEM单细胞3'基因表达试剂盒 | 10X Genomics | 1000268 |
| Chromium控制器 | 10X Genomics | 120223 | |
| 组织处理 | 中性缓冲福尔马林 | Fisher Scientific | 22-110-869 |
| 二甲基亚砜 | Millipore Sigma | D2650 | |
| 尿素 | Millipore Sigma | U5378-500G | |
| 两性离子去污剂3-14 | Millipore Sigma | 693021 | |
| 牛血清白蛋白 | Millipore Sigma | A7030-100G | |
| Triton X-100 | Millipore Sigma | X100 | |
| 苯甲酸苄酯 | Sigma Millipore | B6630 | |
| 电镜 | EMbed 812树脂 | Electron Microscopy Sciences | -- |
| 蛋白质分析 | Pierce蛋白浓缩管(3kDa截留分子量) | Thermo Fisher | 88526 |
| 细胞培养 | IV型胶原包被平板 | Corning | 354430 |
| 数据分析 | ImageJ软件 | -- | -- |
| Imaris软件 | Bitplane | -- | |
| Qupath软件 | -- | -- | |
| GraphPad Prism软件 | -- | -- | |
| Volocity软件 | Quorum Technologies | -- | |
| 显微镜 | Leica SP8激光扫描共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| Yokogawa CSU-22转盘共聚焦显微镜 | Yokogawa | -- | |
| Hitachi HT 7800 120kV透射电子显微镜 | Hitachi | -- | |
| Slideview VS200玻片扫描仪 | Olympus | -- | |
| 细胞培养 | Incucyte S3活细胞成像系统 | Sartorius | -- |
| 流式细胞术 | Sony HS800细胞分选仪 | Sony Biotechnology | -- |
| BD FACSAria Fusion流式细胞分选仪 | BD | -- | |
| Western blot | Trans-blot Turbo转印系统 | Biorad | 1704150 |
| ChemiDoc MP成像系统 | BioRad | 12003153 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 组织透明化和免疫荧光 | 组织厚度(200μm或50μm)、抗体稀释度、透明化处理时间(FLASH协议)、图像分析参数(阈值、体素大小) 阅读提示:Methods: Wholemount Immunofluorescence and tissue clearing; Innervation analysis; Figure legends for Figure 1 |
| 体外PSC培养和TGF-β1处理 | PSC细胞系(PSC5、PSC12)、Matrigel基质、TGF-β1浓度(20 ng/mL)、处理时间(48-96小时) 阅读提示:Methods: Cell line and cell culture; In vitro drug treatments; Figure legends for Figure 2 |
| Tgfbr2敲除实验 | CRISPR sgRNA序列、敲除效率验证(Western blot)、体内他莫昔芬给药方案(100mg/kg,5天)、雨蛙素诱导急慢性胰腺炎方案 阅读提示:Methods: Tgfbr2 CRISPR/Cas9 Knockout; Tamoxifen treatment; Acute Pancreatitis / Chronic Pancreatitis; Figure legends for Figure 3 |
| 化学交感神经切除术 | 6-OHDA剂量(100mg/kg和250mg/kg)、给药时间点(间隔3天)、恢复期(2周)、肿瘤细胞系(FC1242)和注射数量(5000个/小鼠) 阅读提示:Methods: Chemical Sympathectomy; Orthotopic transplantation mouse models; Figure legends for Figure 4 |
| 钙成像实验 | 细胞系(PSC12-GCaMP6f)、药物浓度(NE、PE、多沙唑嗪等)、记录时间(5分钟)、添加药物时间(1分钟)、分析软件(CALIMA) 阅读提示:Methods: Calcium imaging; Figure legends for Figure 4 |
| 化学遗传学DREADD激活 | 小鼠基因型(GqC、KF)、他莫昔芬方案、DCZ剂量和给药途径(饮水或腹腔)、雨蛙素方案、原位肿瘤模型细节 阅读提示:Methods: DREADD activation in vivo; Acute Pancreatitis / Chronic Pancreatitis; Orthotopic transplantation mouse models; Figure legends for Figures 5 and 6 |