构建LZTR1变异体表达载体
生成携带患者来源的LZTR1错义变异(p.K156E和p.G248R)的真核表达载体,用于后续功能研究。
通过定点诱变在野生型LZTR1 cDNA(pCDNA-MYC-Hist-LZTR1)中引入c.466A>G(p.K156E)和c.742G>A(p.G248R)突变,并经Sanger测序验证。
Pathogenesis of Noonan Syndrome is Modulated by NOC2L, a Novel Interactor of LZTR1 Leading to Impaired P53 Signalling
研究包含体外细胞模型(HEK 293T)的过表达实验、磷酸化蛋白质组学、免疫印迹、免疫荧光、纳米荧光素酶互补实验和计算机模拟蛋白结构预测,但缺乏动物模型或患者样本的直接功能验证。
HEK 293T细胞系(体外过表达模型)
LZTR1野生型和变异体(p.K156E, p.G248R)的过表达 HEK 293T细胞培养条件:DMEM高糖培养基,10%胎牛血清,1%青霉素/链霉素,37°C,5% CO2 转染试剂:Lipofectamine 3000 蛋白检测:免疫印迹和免疫荧光 蛋白相互作用验证:NanoBiT互补实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
生成携带患者来源的LZTR1错义变异(p.K156E和p.G248R)的真核表达载体,用于后续功能研究。
通过定点诱变在野生型LZTR1 cDNA(pCDNA-MYC-Hist-LZTR1)中引入c.466A>G(p.K156E)和c.742G>A(p.G248R)突变,并经Sanger测序验证。
在HEK 293T细胞中表达野生型或变异型LZTR1,用于后续蛋白表达和功能分析。
HEK 293T细胞培养于DMEM高糖培养基(含10%胎牛血清、1%青霉素/链霉素),使用Lipofectamine 3000转染质粒DNA。
鉴定LZTR1变异体下游差异磷酸化蛋白质和信号通路,寻找潜在机制。
转染后24小时收获细胞,尿素缓冲液裂解并超声,经胰蛋白酶消化和TiO2富集磷酸化肽段,使用Orbitrap Q-Exactive Plus质谱仪分析。利用Ingenuity Pathway Analysis进行通路分析。
验证LZTR1变异体对pan-RAS水平、NOC2L表达和定位的影响。
通过免疫印迹检测LZTR1、pan-Ras和NOC2L蛋白水平;通过免疫荧光观察LZTR1、pan-Ras和NOC2L的亚细胞定位。
评估LZTR1变异体是否影响p53乙酰化和DNA损伤反应相关蛋白的表达及磷酸化。
用免疫印迹检测p53乙酰化(K382)和总p53水平,以及磷酸化Rad50(Ser635)和磷酸化Adducin1/2;用免疫荧光检测ATM、CHK1和Rad51的表达。
检测LZTR1变异体对细胞凋亡和自噬通路的影响。
用免疫印迹检测Cathepsin D、p70 S6激酶及其磷酸化水平;用免疫荧光检测LC3B水平。
验证LZTR1与NOC2L的直接相互作用,并检查LZTR1变异体对相互作用的影响。
使用NanoBiT互补实验,将NOC2L与LZTR1(野生型或变异体)分别融合SmBiT和LgBiT,共转染HEK 293T细胞,检测发光信号;同时使用MultiFOLD2和PyMOL进行计算机模拟结构预测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | Sigma | D5648 |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | -- | -- |
| 蛋白定量 | Bradford蛋白定量试剂盒 | Bio-Rad | -- |
| 免疫印迹 | Laemmli SDS上样缓冲液(6X) | Thermo Scientific | -- |
| 4-12% Bis-Tris预制胶(1.0mm) | Invitrogen | -- | |
| Trans-Blot SD半干转印槽 | Bio-Rad | -- | |
| 小鼠抗Myc标签单克隆抗体(克隆9E10) | Abcam | ab32 | |
| Pan Ras单克隆抗体(Ras10) | Thermo Fisher Scientific | MA1-012 | |
| 兔多克隆NOC2L抗体 | Proteintech | 28509-1-AP | |
| 人p53(乙酰化K382)抗体 | Abcam | ab75754 | |
| 兔单克隆ATM抗体[Y170] | Abcam | ab32420 | |
| 小鼠单克隆p53(1C12)抗体 | Cell Signaling Technology | 2524 | |
| 小鼠单克隆Chk1(2G1D5)抗体 | Cell Signaling Technology | 2360 | |
| 兔磷酸化Rad50(Ser635)抗体 | Cell Signaling Technology | 14223 | |
| 兔磷酸化ADD1/ADD2(Ser726, Ser713)多克隆抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-40276 | |
| 兔单克隆抗Rad51抗体 | Abcam | ab133534 | |
| 兔多克隆Cathepsin D抗体 | Abcam | ab72915 | |
| 兔多克隆p70 S6激酶抗体 | Cell Signaling Technology | 9202 | |
| 小鼠单克隆磷酸化p70 S6激酶(Thr389)(1A5)抗体 | Cell Signaling Technology | 9206 | |
| 兔单克隆LC3B(D11)抗体 | Cell Signaling Technology | 3868 | |
| 兔抗GAPDH抗体 | Abcam | ab9485 | |
| 小鼠抗β-肌动蛋白单克隆抗体 | Abcam | ab6276 | |
| IRDye 800CW山羊抗小鼠IgG | LI-COR | -- | |
| IRDye 800CW山羊抗兔IgG | LI-COR | -- | |
| IRDye 680RD山羊抗小鼠IgG | LI-COR | -- | |
| IRDye 680RD山羊抗兔IgG | LI-COR | -- | |
| 蛋白相互作用 | Furimazine荧光素酶底物 | Nanolight Technology | -- |
| CLARIOstar多功能酶标仪 | BMG Labtech | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和转染 | HEK 293T细胞培养条件(培养基、血清浓度、抗生素)、转染试剂和DNA量 阅读提示:Materials and Methods: Cell Lines and Transfection Protocols |
| LZTR1变异体构建 | 突变位点(c.466A>G, p.K156E; c.742G>A, p.G248R)、载体骨架、定点诱变方法 阅读提示:Materials and Methods: Generation of LZTR1 Variant Constructs |
| 磷酸化蛋白质组学 | 细胞处理时间(24h)、裂解缓冲液、蛋白酶消化条件、TiO2富集、质谱参数 阅读提示:Materials and Methods: Phosphoproteomics |
| 免疫印迹和免疫荧光 | 抗体(针对Myc、pan-Ras、NOC2L、p53、ATM、CHK1等)的稀释比例、细胞固定和通透化条件 阅读提示:Materials and Methods: Immunoblotting and Immunofluorescence |
| 蛋白相互作用 | NanoBiT质粒DNA量(各100 ng)、转染后时间(48h)、底物浓度(Furimazine 1:20稀释)、检测时间(1h) 阅读提示:Materials and Methods: NanoBiT Complementation Assays |