筛选Aβ结合蛋白
鉴定与Aβ结合的细胞内蛋白
使用HuProt v3.1人类蛋白质芯片,与荧光标记的Aβ寡聚体孵育,筛选出Aβ结合候选蛋白,并通过SPR和Co-IP验证Kvβ2与Aβ的相互作用。
Altered trafficking of Kv1-Kvβ2 leads to neuronal hyperexcitability and memory deficits in amyloid-β pathology
包含体外蛋白结合(SPR、Co-IP)、细胞模型(mRFP-Aβ)、体内敲入小鼠电生理和行为学验证,及患者样本共定位,证据层级多元且含功能验证。
APPNL−G−F敲入小鼠 HT22/mRFP-Aβ细胞 原代皮层和海马神经元 AD患者脑组织
Kvβ2与Aβ结合区域(氨基酸2-18) Aβ处理浓度(5 µM)及时间(30-48 h) 慢病毒注射时间点(3个月龄)及分析时间(5.5-7个月龄) 电生理记录中CA1锥体神经元的刺激电流(50 pA) 行为测试类型(Y迷宫、新物体识别、被动回避)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定与Aβ结合的细胞内蛋白
使用HuProt v3.1人类蛋白质芯片,与荧光标记的Aβ寡聚体孵育,筛选出Aβ结合候选蛋白,并通过SPR和Co-IP验证Kvβ2与Aβ的相互作用。
验证Aβ是否干扰Kvβ2与EB1的结合
在APPNL−G−F小鼠海马组织中进行Co-IP,检测Kvβ2-EB1复合物水平;使用纯化蛋白进行体外竞争结合实验,添加不同比例Aβ检测影响。
定位Kvβ2中Aβ结合所需区域
通过生成Kvβ2缺失突变体(ΔN、ΔC、Δ(2–18)),在HEK293T细胞中表达并与Aβ孵育,进行Co-IP分析结合能力。
检测Kvβ2表达是否减轻Aβ诱导的细胞毒性
在HT22细胞中稳定表达Kvβ2 WT或Δ(2–18)突变体,用Aβ处理,通过PI染色和MTT法检测细胞活力,并使用Flux OR实验检测钾通道活性。
确认细胞内Aβ与Kvβ2相互作用并改变Kv1表面定位
生成表达mRFP-Aβ的HT22细胞,通过共定位、Co-IP和表面生物素化实验验证与Kvβ2的相互作用及Kv1表面水平的降低。
检验Kvβ2表达是否能改善APPNL−G−F小鼠的病理表型
通过脑室内注射慢病毒表达Kvβ2 WT或Δ(2–18)至APPNL−G−F小鼠,进行电生理记录(sEPSC、动作电位)和行为测试(Y迷宫、新物体识别、被动回避),并检测c-Fos、NeuN水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Aβ寡聚体制备 | Aβ1−42(rPeptide) | rPeptide | A-1163 |
| 蛋白芯片筛选 | HuProt v3.1 | CDI Labs | -- |
| 免疫染色 | Kvβ2抗体(Origene) | Origene | TA331456 |
| Western blot和Co-IP | Kvβ2抗体(Neuromab) | Neuromab | 75-021 |
| 细胞培养 | HT22细胞 | -- | -- |
| 细胞处理 | 亚甲蓝 | Sigma | M4159 |
| 尼氟灭酸 | -- | -- | |
| 表面生物素化 | 磺基-NHS-SS-生物素 | APExBIO | A8005 |
| 细胞活力检测 | MTT | Sigma | M-2003 |
| 荧光观察 | Hoechst 33342 | -- | -- |
| 蛋白表达 | pLVX-puro载体 | Clontech | 632164 |
| 蛋白纯化 | Ni-NTA琼脂糖 | -- | -- |
| 蛋白质印迹 | PVDF膜 | -- | -- |
| 免疫沉淀 | Protein G琼脂糖 | GE Healthcare | 17-0618-05 |
| 表面等离子体共振 | Biacore系统 | Cytiva | -- |
| 电生理记录 | Multiclamp 700A放大器 | Molecular Devices | -- |
| Digidata 1440A数字化仪 | Molecular Devices | -- | |
| 慢病毒注射 | Hamilton微量注射器702 | Hamilton Company | 80400 |
| 统计分析 | GraphPad Prism 10 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| Aβ寡聚体制备 | Aβ1−42肽的预处理(HFIP、DMSO、PBS稀释)、孵育条件(4°C、48小时)、离心(13,400 × g、10分钟) 阅读提示:Methods: Preparation of synthetic Aβ oligomers |
| 蛋白芯片筛选 | HuProt芯片批次、Aβ浓度(3 µg)、孵育时间(8小时)、A-score阈值(前1%) 阅读提示:Methods: Human protein chip assay screening |
| 细胞培养与处理 | 细胞系(HT22、原代神经元)、Aβ处理浓度(5 µM)和持续时间(30-48小时) 阅读提示:Methods: Cell culture and treatments; Results: Fig. 2, 3, 4 |
| 表面等离子体共振 | His-Kvβ2蛋白固定、Aβ浓度、KD值 阅读提示:Methods: Surface plasmon resonance (SPR) |
| 免疫共沉淀 | 细胞或组织裂解液、抗体种类(6E10、anti-FLAG等)、Aβ浓度(1 µM)、孵育时间 阅读提示:Methods: Co-immunoprecipitation assay |
| 动物实验 | 小鼠品系(APPNL−G−F)、注射时间点(3或5个月龄)、慢病毒滴度(1×108 TU/ml)、注射量 阅读提示:Methods: APPNL−G−F knock-in mice; Intracerebroventricular injection |
| 电生理记录 | 脑片制备、ACSF成分、记录电极电阻(4-8 MΩ)、刺激电流(50 pA)、神经元类型(CA1锥体神经元) 阅读提示:Methods: Electrophysiological recordings |
| 行为测试 | Y迷宫参数(尺寸、探索时间)、被动回避参数(电击强度0.25 mA、2秒)、新物体识别参数(训练和测试时间) 阅读提示:Methods: Behavior tests |