急性炎症驱动角膜病理性再生

目的：本研究旨在表征急性炎症诱导的角膜转录组和表观遗传重塑。方法：在脂多糖或PBS基质内注射后第5天和第10天收集角膜缘-角膜组织。使用scRNA-seq和scATAC-seq，遵循Seurat和Signac流程，描绘炎症角膜的转录组和表观基因组图谱。进行免疫荧光以评估角膜上皮标志物和免疫细胞浸润的变化。结果：我们鉴定了16个细胞簇，包括十个上皮细胞亚群、角膜细胞、成纤维细胞、角膜内皮细胞、血管细胞、淋巴管细胞和免疫细胞。脂多糖诱导了五种主要免疫细胞类型的浸润：中性粒细胞、MHC-II⁻巨噬细胞、MHC-II⁺巨噬细胞、T细胞和自然杀伤细胞。我们表征了炎症反应过程中所有细胞类型的基因表达和染色质可及性动态，揭示了细胞类型特异性的基因调控元件和顺式调控染色质相互作用。Regulon活性和基序可及性分析确定了驱动不同炎症反应程序的关键转录因子。发现炎症抑制角膜缘干/祖细胞分化。CellChat分析揭示了所有细胞类型之间的一组分泌性细胞间串扰信号。结论：我们的工作提供了炎症角膜的全面、时间分辨的单细胞转录组和表观基因组图谱，定义了角膜病理性再生过程中的细胞功能异质性、顺式调控网络和细胞间通讯。这些发现为角膜病理学提供了有价值的见解。