空间转录组学与形态学分析相结合：探索小胶质细胞随年龄变化的工具

细胞形态与功能紧密相关，但亚细胞转录本定位如何发挥作用仍不明确。以小胶质细胞（大脑常驻巨噬细胞）为模型，我们将多重误差鲁棒性荧光原位杂交技术与免疫组织化学相结合，绘制了年轻和老年小鼠大脑中形态与亚细胞mRNA定位如何与功能相互作用的图谱。我们发现mRNA空间组织随小胶质细胞状态变化，并在其突起内形成不同的定位模式，揭示了转录组定义群体内部的形态异质性。值得注意的是，我们发现了一个具有分枝状形态（即呈现大量突起）的疾病相关样小胶质细胞亚群，这对形态与小胶质细胞状态间的传统假设提出了挑战。最后，我们发现衰老可能重塑mRNA分布及其共定位网络，使小胶质细胞程序从细胞内信号传导和吞噬作用调控转向迁移和分解代谢调控。我们的研究结果凸显了亚细胞转录本组织在塑造小胶质细胞形态和功能中的作用，为研究及调控健康、疾病和衰老状态下的小胶质细胞状态提供了新途径。