乳酸敏感基因的筛选与验证
通过RNA-seq筛选在乳酸暴露下表达上调且具有低基线表达、快速恢复特性的候选基因
利用RNA-seq分析健康供者T细胞在酸性(25 mM乳酸,pH 6.0)和中性条件下基因表达差异,结合RT-qPCR和Western blot验证TXNIP的表达调控。
Harnessing tumor acidity: innovative lactic acid-responsive promoter enables precision control of CAR-T cell activity in solid tumors
包含RNA-seq筛选、报告基因验证、体外功能实验(细胞毒性、细胞因子)、体内人源化小鼠模型评估OTOT及抗肿瘤疗效,具备多层级功能与机制验证。
人源化HER2肝表达B-NDG小鼠模型(Ad5-HER2感染) SKOV3皮下移植瘤B-NDG小鼠模型 HER2双表达(肿瘤和肝)B-NDG小鼠模型 NCI-H292和SKOV3肿瘤细胞系
LARP对乳酸的响应及可逆性:25 mM乳酸处理72小时CAR MFI升高2.54倍,撤除乳酸后72小时恢复基线 酸性条件预处理对LAR CAR-T细胞毒性的影响:25 mM乳酸预孵24小时后对SKOV3的杀伤效率由9.7%/18.5%/36.1%提升至15.4%/25.4%/41.4%(2/4/6小时,E:T=4:1) 体内OTOT评估模型:Ad5-HER2感染B-NDG小鼠,8天后输注CAR-T细胞,监测体重、存活、肝酶(AST/ALT) 体内抗肿瘤实验:SKOV3皮下移植,肿瘤体积40-50mm³时分组,两次输注5×10⁶ CAR-T细胞(间隔3天)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
通过RNA-seq筛选在乳酸暴露下表达上调且具有低基线表达、快速恢复特性的候选基因
利用RNA-seq分析健康供者T细胞在酸性(25 mM乳酸,pH 6.0)和中性条件下基因表达差异,结合RT-qPCR和Western blot验证TXNIP的表达调控。
鉴定TXNIP启动子中响应乳酸的核心元件并构建高效LARP
克隆TXNIP全长启动子Pfull(1313bp)及其截短片段,构建mCherry报告载体,转染HEK-293T细胞和T细胞,验证乳酸诱导的报告基因表达。
验证LARP驱动的CAR表达对乳酸的响应性及LAR CAR-T细胞的抗肿瘤功能
构建miniE-E68驱动的HER2 CAR(LAR CAR)和SFFV驱动的常规CAR,转导T细胞后,在乳酸条件下检测CAR表达、细胞增殖、表型及对肿瘤细胞的杀伤和细胞因子分泌。
在HER2人源化肝小鼠模型中评估LAR CAR-T细胞的安全性
通过Ad5-HER2感染B-NDG小鼠,8天后输注CAR-T细胞,监测体重、存活率、肝酶(AST/ALT)、血清细胞因子及组织病理。
在同时表达肿瘤和肝HER2的小鼠模型中评估LAR CAR-T的抗肿瘤疗效和安全性
皮下接种SKOV3细胞,待肿瘤形成后腹腔注射Ad5-HER2,然后静脉或腹腔输注LAR CAR-T,监测肿瘤生长、体重、存活率及肝毒性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Corning | 10-013-CV |
| RPMI 1640培养基 | Corning | 10-040-CV | |
| 胎牛血清 | Eallbio | 03.U16001 | |
| 青霉素-链霉素 | NCM | C100C8 | |
| X-VIVO 15培养基 | Lonza | 04-418Q | |
| 无糖RPMI 1640培养基 | Wuhan Procell Life Science & Technology Co., Ltd. | PM150122 | |
| 白细胞介素-7 | Novoprotein | C086 | |
| 白细胞介素-15 | Novoprotein | C016 | |
| 白细胞介素-21 | Novoprotein | C045 | |
| 淋巴细胞分离液 | STEMCELL Technologies | 07851 | |
| L-乳酸 | Absin | abs42020226 | |
| 葡萄糖 | Sigma-Aldrich | G8644 | |
| 抗人CD3和CD28抗体包被的磁珠 | -- | -- | |
| 慢病毒转导增强剂 | WZ Biosciences | FH880807 | |
| 分子克隆 | PrimeSTAR Max DNA聚合酶 | Takara | R045A |
| ClonExpress II一步克隆试剂盒 | Vazyme | C112-02 | |
| 流式细胞术 | eFluor 670增殖染料 | Invitrogen | 65-0840-85 |
| 可固定死活染料 | Invitrogen | L23105 | |
| CD45-PE/Cy7抗体 | Biolegend | 304016 | |
| CD3-BV421抗体 | BD Biosciences | 562426 | |
| CD8-BV711抗体 | BD Biosciences | 563677 | |
| IFN-γ-APC抗体 | Biolegend | 502512 | |
| TNF-α-PE/Cy7抗体 | Biolegend | 502930 | |
| Cytofix/Cytoperm固定/破膜试剂盒 | BD Biosciences | 554714 | |
| GolgiStop蛋白转运抑制剂 | -- | -- | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8检测试剂盒 | Life-iLab | AC11L054 |
| 细胞因子检测 | ELISA试剂盒 | -- | -- |
| 动物实验 | 复制缺陷型重组5型腺病毒携带HER2抗原 | Genechem | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism V.10软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| LARP构建 | 启动子片段序列和长度(Pfull 1313bp,miniE-E68 180bp) 阅读提示:Methods: DNA construction, Results: 图2A |
| CAR-T细胞制备 | PBMC分离方法(Lymphoprep)、激活条件(anti-CD3/CD28 dynabeads 72小时)、转导条件(lentiviral transduction enhancer,离心1000×g 90分钟 32°C) 阅读提示:Methods: CAR-T cells preparation and expansion |
| 体外酸性模拟 | 乳酸浓度(≤25 mM)及刺激时间(最长72小时) 阅读提示:Methods: CAR-T cells preparation and expansion, Results: 图2F-I |
| 细胞毒性实验 | 效靶比(2:1和4:1)、共培养时间(2/4/6小时)、靶细胞类型(NCI-H292、SKOV3)及预处理条件(25 mM乳酸24小时) 阅读提示:Methods: In vitro CAR-T cells functional evaluation, Results: 图4 |
| 体内OTOT模型 | Ad5-HER2剂量(3×10⁹ PFU)、CAR-T细胞剂量(5×10⁵⁶)、感染后时间(8天) 阅读提示:Methods: In vivo studies, Figure legend 图5A |
| 体内抗肿瘤模型 | SKOV3接种量(5×10⁶)、肿瘤体积范围(40-50 mm³)、CAR-T输注方案(两次5×10⁶、间隔3天) 阅读提示:Methods: In vivo studies, Figure legend 图6A |