神经元TDP-43病理驱动ALS小鼠模型中的星形胶质细胞干扰素反应

Neuronal TDP-43 pathology drives astrocytic interferon response in a mouse model of ALS

作者信息Jie An, Nzinga Hendricks, Jeanna Wheeler, Joshua Hincks, Javier A Ramos Benitez, Jessica M Snyder, Brian C Kraemer, Nicole F Liachko, Keith B Elkon
PMID41419928
发布时间2025-12
DOI10.1186/s12974-025-03658-2

实验完整度

包含体外qPCR、质谱、snRNA-seq、免疫组化、免疫荧光和蛋白组学分析等多个独立证据层级,并明确验证了cGAS-STING通路和星形胶质细胞反应。

主要模型

rNLS8小鼠模型 对照(同窝不含tetO-hTDP-43-ΔNLS转基因)小鼠 全脑组织

重点核对

rNLS8小鼠在多西环素去除后4周(发生运动障碍和神经元变性) IFN-I通路激活(通过7个ISG的qPCR和IFN评分检测) cGAS-STING通路激活(通过质谱检测全脑中cGAMP浓度) snRNA-seq中星形胶质细胞中ISG表达显著上调 IHC/IF检测海马区星形胶质细胞中ISG15和IFITM3蛋白表达增加

摘要

神经炎症与肌萎缩侧索硬化(ALS)的发病机制有关。在潜在的天然免疫介质中,I型干扰素(IFN-I)可能发挥重要作用,因为它能抑制蛋白质合成并影响神经元突触和代谢。这些效应可能是细胞自主的,也可能是由胶质细胞或免疫细胞介导的非细胞自主效应。我们在rNLS8小鼠中检测了IFN-I,这些小鼠被工程化改造,通过神经丝重链(NEFH)启动子调控表达带有缺陷核定位信号(hTDP-43ΔNLS)的可被多西环素抑制的人TAR DNA结合蛋白43 kDa(hTDP-43)。在rNLS8小鼠中诱导hTDP-43ΔNLS后,我们观察到IFN-I刺激基因(ISG)的上调,并特别地,通过质谱鉴定全脑中的环状二核苷酸cGAMP,确定了DNA传感器环状GMP-AMP合酶(cGAS)的激活。为了确定IFN-I的细胞来源,我们对全脑进行了单核RNA测序。我们观察到ISG在星形胶质细胞中上调最为显著,表明星形胶质细胞本身在很大程度上负责rNLS8小鼠中IFN-I的产生和/或反应。这一观察通过大脑皮层中,尤其是海马区星形胶质细胞中IFN-I刺激蛋白的免疫组织化学和免疫荧光染色得到证实。这些结果指出星形胶质细胞在疾病相对早期阶段对细胞损伤作出反应中起关键作用,先前的研究表明该阶段部分是可逆的。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
在rNLS8 ALS小鼠模型中,神经元TDP-43病理是否以及如何激活I型干扰素反应,以及哪些细胞类型参与这一过程。
核心机制
神经元TDP-43病理导致cGAS-STING通路激活,产生cGAMP,进而诱导IFN-I反应,其中星形胶质细胞是主要的IFN-I应答细胞。
主要证据
通过qPCR和质谱检测到ISG表达和cGAMP浓度升高;snRNA-seq显示星形胶质细胞中ISG表达显著上调;免疫组化和免疫荧光证实ISG15和IFITM3蛋白在星形胶质细胞中表达增加。
研究意义
结果表明星形胶质细胞在ALS早期对TDP-43诱导的细胞损伤做出反应,为靶向IFN-I通路或星形胶质细胞提供了治疗可能性。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

诱导rNLS8 ALS模型

建立可诱导的TDP-43蛋白病模型,以研究疾病早期事件。

通过从饮食中去除多西环素(Dox),诱导rNLS8小鼠表达hTDP-43ΔNLS,从而在神经元中积累胞质pTDP-43,引发ALS样表型。

2

检测IFN-I通路激活

验证在rNLS8小鼠中IFN-I信号是否被激活。

通过定量实时PCR(qPCR)检测脑和脊髓中7个ISG的表达,并计算IFN评分。

3

检测cGAS-STING通路激活

确定IFN-I反应是否由cGAS-STING通路介导。

通过质谱法(UPLC-MS)定量全脑中的cGAMP浓度,以评估cGAS酶活性。

4

单核RNA测序分析细胞类型

识别IFN-I产生和应答的细胞类型。

对全脑进行single-nucleus RNA-seq(sci-RNA-seq3),分析不同细胞类型中ISG和相关基因的表达差异。

5

蛋白质水平验证

在蛋白水平确认ISG表达增加。

利用TDP-map数据库的蛋白质组学数据,检查IFIT3和ISG15蛋白表达;并进行免疫组化(IHC)和免疫荧光(IF)染色。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
多西环素饮食(625 ppm)LabDiet or BioServ--
RNeasy脂质组织迷你试剂盒Qiagen--
Applied Biosystems高容量cDNA逆转录试剂盒Applied Biosystems--
ABI StepOne Plus实时PCR系统Applied Biosystems--
OASIS WAX固相萃取柱Waters--
Waters Xevo TQS质谱仪Waters--
Bond Polymer Refine (DAB) 检测试剂盒Leica Microsystems--
兔抗小鼠IFITM3抗体,克隆RB13975Antibodies onlineABIN2845007
兔抗小鼠ISG15抗体Proteintech15981-1-AP
纯化兔IgGR&D SystemsAB-105-C
Nanozoomer数字病理切片扫描仪Hamamatsu--
Leica BOND RX自动染色仪Leica--
Opal抗小鼠/兔HRP聚合物Akoya BiosciencesARH1001EA
Opal 520荧光染料Akoya BiosciencesFP1487001KT
Opal 570荧光染料Akoya BiosciencesFP1488001KT
Opal 690荧光染料Akoya BiosciencesFP1497001KT
DAPI染色液SigmaD8417
Prolong Gold抗淬灭封片剂Invitrogen/Life TechnologiesP36930
Vectra Polaris定量病理成像系统Akoya Biosciences--
兔抗ISG15抗体Proteintech15981-1-AP
兔抗NeuN抗体(D4G4O)Cell Signaling Technologies24307
兔抗GFAP抗体DakoZ0334

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
动物模型诱导
rNLS8小鼠及其对照;多西环素去除的方式和时间点(4周)
阅读提示:Methods: Mouse housing and strains used; Induction of ALS in rNLS8 mice
qPCR检测ISG表达
引物序列(补充表1);7个ISG列表;组织来源(脑和脊髓);内参基因;数据分析方法(2^-ΔΔCt)
阅读提示:Methods: Quantitative real-time PCR (qPCR); Supplementary Table 1
cGAMP质谱检测
组织处理(80% MeOH提取);质谱参数(MRM转换);内标(cGAMP*)
阅读提示:Methods: Purification and quantification of cGAMP
单核RNA测序
样本数量(5 control, 5 rNLS8);性别(雌性);时间点(4周);文库制备(sci-RNA-seq3);测序平台(Illumina NovaSeq S4);参考基因组(GRCm39, Ensembl v107)
阅读提示:Methods: Single nucleus RNA sequencing (snRNA-seq); Data analysis pipeline and packages used
免疫组织化学和免疫荧光
抗原修复条件(HIER1或HIER2);抗体种类、稀释度、克隆号及货号;染色平台(Leica BOND RX);图像分析软件(Visiopharm)
阅读提示:Methods: Immunohistochemistry (IHC); Immunofluorescence (IF); Figure legends