临床样本分析
探究肠道FXR激活与动脉粥样硬化相关指标的关系
收集健康对照和高胆固醇血症患者的血清,检测FGF19、胆固醇、神经酰胺和C4水平,进行相关性分析。
Suppressing the intestinal farnesoid X receptor/sphingomyelin phosphodiesterase 3 axis decreases atherosclerosis
包含临床样本分析、细胞系和类器官实验、小鼠模型(基因敲除、药物处理、过表达)等多层级验证,并进行了机制研究(ChIP、3C、报告基因)和功能验证。
ApoE–/–小鼠 FxrΔIEApoE–/–小鼠 肠道类器官 HCT116细胞
高胆固醇血症患者血清FGF19水平与总胆固醇和总神经酰胺水平呈正相关 HCD喂养5周的ApoE–/–小鼠模型中肠道FXR缺乏减少动脉粥样硬化病变面积 C16:0神经酰胺补充(10 mg/kg/d,腹腔注射)逆转肠道FXR缺乏的保护作用 GUDCA(30 mg/kg/d,灌胃)以肠道FXR依赖方式减少动脉粥样硬化 GW4869(30 mg/kg/d,灌胃)抑制SMPD3减少已建立的动脉粥样硬化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究肠道FXR激活与动脉粥样硬化相关指标的关系
收集健康对照和高胆固醇血症患者的血清,检测FGF19、胆固醇、神经酰胺和C4水平,进行相关性分析。
评估肠道FXR缺乏对动脉粥样硬化的影响
利用Fxrfl/flApoE–/– 和 FxrΔIEApoE–/– 小鼠,喂食HCD 5周,分析主动脉病变、血清胆固醇、炎症因子和神经酰胺水平。
验证神经酰胺在肠道FXR缺失保护作用中的因果角色
给FxrΔIEApoE–/– 小鼠腹腔注射C16:0神经酰胺,检测主动脉病变、炎症和神经酰胺水平。
确定SMPD3是否为肠道FXR的直接靶基因及其调控机制
使用GW4064激活FXR,检测Smpd3表达;通过ChIP、荧光素酶报告基因和3C实验验证FXR结合增强子并调控转录。
验证SMPD3介导FXR诱导的神经酰胺产生和分泌
在肠道类器官中过表达SMPD3或使用GW4869抑制SMPD3,检测神经酰胺水平。
验证肠道SMPD3过表达能否逆转FXR缺失的保护作用
通过手术向FxrΔIEApoE–/– 小鼠肠道导入LV-SMPD3,然后HCD喂养5周,分析动脉粥样硬化表型。
评估GUDCA和GW4869对动脉粥样硬化的预防和治疗效果
在HCD诱导的动脉粥样硬化模型中,给予GUDCA或GW4869,分析病变面积、炎症和神经酰胺水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 高胆固醇饮食(D12109C) | Research Diets | -- |
| 药物处理 | 甘氨熊去氧胆酸 | Sigma-Aldrich | 06863 |
| C16:0神经酰胺 | -- | -- | |
| GW4064 | Sigma-Aldrich | G5172 | |
| GW4869 | Selleck Chemicals | S7609 | |
| 组织培养 | 温和细胞解离试剂 | STEMCELL Technologies | -- |
| 基质胶 | Corning | -- | |
| IntestiCult类器官生长培养基(OGM) | STEMCELL Technologies | -- | |
| HBLV-m-SMPD3慢病毒 | Hanbio Biotechnology | -- | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| SMPD3抗体 | Santa Cruz | sc-166637 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab8227 | |
| 免疫荧光 | Mac-2抗体 | Cedarlane | CL8942AP |
| IL-1β抗体 | ABclonal | A19635 | |
| CD36抗体 | ABclonal | A1470 | |
| Alexa Fluor 546偶联抗大鼠二抗 | Novus | DDXCR05A546 | |
| Alexa Fluor 647偶联抗兔二抗 | Abcam | Ab150075 | |
| 生化检测 | 胆固醇和甘油三酯检测试剂盒 | Biosino Bio-Technology | -- |
| 炎症细胞因子微球阵列试剂盒 | BD Biosciences | 552364 | |
| 人FGF-19 Quantikine ELISA试剂盒 | R&D Systems | DF1900 | |
| 代谢检测 | 胰岛素 | Solarbio | I8040 |
| 血糖仪(Contour TS) | Bayer | -- | |
| 胰岛素ELISA试剂盒 | Solarbio | SEKR-0141 | |
| 酶活性检测 | Amplex Red鞘磷脂酶检测试剂盒 | Invitrogen | A12220 |
| 脂质组学 | LM6002内标 | Avanti Polar Lipids | -- |
| 超高效液相色谱系统(Eksigent LC100) | -- | -- | |
| TripleTOF 5600系统 | AB SCIEX | -- | |
| XBridge Peptide BEH C18色谱柱 | Waters | -- | |
| FPLC | Superose S-6 10/300 GL色谱柱 | -- | -- |
| C4分析 | Prominence 20 UFLCXR系统 | Shimadzu | -- |
| ChIP | SimpleChIP Plus酶法染色质IP试剂盒 | Cell Signaling | 9005 |
| 3C | HindIII限制性内切酶 | New England Biolabs | -- |
| T4 DNA连接酶 | -- | -- | |
| 荧光素酶实验 | pGL4.27荧光素酶质粒 | -- | -- |
| pRL-海肾荧光素酶对照载体 | Promega | -- | |
| 双荧光素酶检测系统 | Promega | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| RT-PCR | 逆转录试剂盒 | ABM | G490 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 患者高胆固醇血症定义(TC≥6.2 mmol/L),样本量(n=30/组),血清分离条件(室温静置至少30分钟,1000g离心5分钟) 阅读提示:Methods: Human subjects |
| 动物模型 | 小鼠品系(Fxrfl/flApoE–/–,FxrΔIEApoE–/–),性别(雄性),年龄(8周龄),HCD喂养时间(5周),每组样本量(n=8) 阅读提示:Methods: Mice; Figure 1 legend |
| 药物处理 | GUDCA剂量(30 mg/kg/d,灌胃),C16:0神经酰胺剂量(10 mg/kg/d,腹腔注射),GW4064剂量(10 mg/kg/d,灌胃),GW4869剂量(30 mg/kg/d,灌胃) 阅读提示:Methods: Mice; Figure 6 and 7 legends |
| 类器官培养 | 类器官来源(FXRfl/fl和FXRΔIE小鼠),培养条件(Matrigel和OGM,37°C,5% CO2),处理(GW4064 10 μM或GW4869 10 μM,3天) 阅读提示:Methods: Organoid culture, lentiviral transduction, and treatment; Figure 3 and 4 legends |
| 动脉粥样硬化斑块分析 | 主动脉油红O染色,主动脉根部冰冻切片,Mac-2、IL-1β、CD36免疫染色,图像分析软件(ImageJ) 阅读提示:Methods: Analysis of atherosclerotic plaques; Figure 1, 2, 5, 6, 7 legends |