验证STING激动剂的抗肿瘤效应及依赖性
确定瘤内注射STING激动剂(cGAMP和DMXAA)对肿瘤生长的抑制作用及其是否依赖IFNAR信号和CD8+ T细胞。
在B16黑色素瘤模型中,瘤内注射cGAMP或DMXAA,监测肿瘤生长;使用Ifnar-/-小鼠和抗体阻断IFN-γ、CD8、CD4;检测肿瘤内STING下游基因表达。
Endothelial STING-JAK1 interaction promotes tumor vasculature normalization and antitumor immunity
包含体外内皮细胞实验、体内多个肿瘤模型、细胞特异性基因敲除小鼠,以及患者样本的临床相关性分析,并进行了机制验证。
B16小鼠黑色素瘤模型 MC38小鼠结肠腺癌模型 内皮细胞特异性Sting敲除小鼠 人脐静脉内皮细胞(HUVEC)
内皮细胞特异性Sting敲除后STING激动剂抗肿瘤效果消失 IFN-β刺激诱导JAK1-STING相互作用及JAK1磷酸化 STING C91A突变破坏与JAK1的相互作用并抑制JAK1激活 H151和ruxolitinib抑制STING-JAK1相互作用及下游信号
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定瘤内注射STING激动剂(cGAMP和DMXAA)对肿瘤生长的抑制作用及其是否依赖IFNAR信号和CD8+ T细胞。
在B16黑色素瘤模型中,瘤内注射cGAMP或DMXAA,监测肿瘤生长;使用Ifnar-/-小鼠和抗体阻断IFN-γ、CD8、CD4;检测肿瘤内STING下游基因表达。
确定STING在哪种细胞类型(肿瘤细胞、树突状细胞、巨噬细胞或内皮细胞)中表达对于STING激动剂的抗肿瘤效应是必需的。
生成Sting敲除的B16和MC38肿瘤细胞;生成DC特异性(Itgax-Cre)、巨噬细胞特异性(LysM-Cre)和内皮特异性(Tek-Cre、Cdh5-Cre)Sting敲除小鼠;植入肿瘤并用STING激动剂处理,观察肿瘤生长。
确定内皮STING缺失是否影响STING激动剂诱导的肿瘤血管正常化和CD8+ T细胞浸润。
通过免疫荧光染色检测肿瘤中CD31和COL4表达;通过IHC检测CD8+ T细胞浸润;通过ELISA检测肿瘤内IFN-β水平。
确定内皮STING是否参与IFNAR下游的JAK1-STAT信号激活。
分离原代内皮细胞,IFN-β刺激后,检测ISG表达、JAK1和STAT1磷酸化;RNA-seq分析;体内注射重组IFN-β观察肿瘤生长。
确定STING与JAK1是否相互作用以及该相互作用的结构基础和调控机制。
通过免疫共沉淀检测STING与JAK1的相互作用;构建STING截短突变体(dCTT、CBD)和点突变体(C91A、S365A、L373A);使用抑制剂H151和ruxolitinib处理,检测相互作用和下游信号。
验证内皮STING表达和棕榈酰化与患者肿瘤免疫的相关性。
利用公开的单细胞数据集和TCGA数据,分析内皮STING与JAK1/STAT1表达的相关性,以及与免疫细胞浸润和患者生存的关系;检测黑色素瘤患者肿瘤组织中STING棕榈酰化水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Invitrogen | -- |
| RPMI-1640培养基 | Invitrogen | -- | |
| 胎牛血清 | TransGen Biotech | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 内皮细胞生长补充物 | Merck | 02-102 | |
| 药物处理 | DMXAA | APExBIO | A8233 |
| 环状GMP-AMP | APExBIO | B8362 | |
| 干扰素-β | R&D Systems | 8234-MB | |
| 抗IFN-γ抗体 | BioXCell | BE0055 | |
| 抗CD4抗体 | BioXCell | BE0003-1 | |
| 抗CD8抗体 | BioXCell | BE0061 | |
| H151(STING拮抗剂) | -- | -- | |
| 鲁索利替尼 | -- | -- | |
| 2-溴棕榈酸(棕榈酰化抑制剂) | -- | -- | |
| 细胞因子诱导 | 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | PeproTech | 315-03 |
| 白细胞介素-4 | PeproTech | 214-14 | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | PeproTech | 315-02 | |
| RNA提取 | RNA提取试剂盒 | Promega | LS1040 |
| 逆转录 | PrimeScript逆转录试剂盒 | Takara | RR036A |
| qPCR | SYBR预混试剂盒 | Genstar | A301 |
| Western blot | STING抗体 | Cell Signaling Technology | 13647S |
| STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 14994S | |
| 磷酸化STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 9167S | |
| JAK1抗体 | Cell Signaling Technology | 50996S | |
| 磷酸化JAK1抗体 | Cell Signaling Technology | 74129S | |
| ECL检测试剂盒 | -- | -- | |
| 免疫共沉淀 | STING抗体 | Cell Signaling Technology | 13647S |
| 蛋白A琼脂糖珠 | Thermo Scientific | 20333 | |
| 抗MYC磁珠 | Bimake Inc. | B26302 | |
| 免疫组织化学 | 抗CD8抗体 | Cell Signaling Technology | 98941S |
| 抗CD3抗体 | Abcam | ab16669 | |
| 免疫荧光 | 抗CD31抗体 | Abcam | ab182981 |
| 抗COL4抗体 | Merck | ab236640 | |
| 多重免疫荧光 | 抗人CD8抗体 | ZSGB-BIO | ZA-0508 |
| 抗人STING抗体 | Invitrogen | MA5-26030 | |
| 抗人CD31抗体 | Abcam | ab28364 | |
| 棕榈酰化检测 | N-乙基马来酰亚胺 | Sigma-Aldrich | -- |
| 羟胺 | Sigma-Aldrich | 431362 | |
| OG488叠氮化物 | Click Chemistry Tools | 1264-1 | |
| 硫酸铜 | Merck | 7758-98-7 | |
| 三(2-羧乙基)膦 | Merck | 51805-45-9 | |
| STING抗体 | Invitrogen | MA5-26030 | |
| 荧光素/OG 488 | Life Technologies | A-889 | |
| Duolink PLA探针MINUS和PLUS | Merck | DUO92002 | |
| Duolink原位检测试剂盒 | Merck | DUO92008 | |
| DAPI | Merck | DUO82040 | |
| 显微镜 | 共聚焦扫描荧光显微镜 | ZEISS | LSM880 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 肿瘤模型 | 细胞系(B16、MC38)和植入数量 阅读提示:Methods: Tumor models and treatment regimens |
| STING激动剂处理 | STING激动剂类型、剂量、给药途径 阅读提示:Methods: Tumor models and treatment regimens |
| 基因敲除小鼠 | 组织特异性Sting敲除小鼠的构建方式和基因型 阅读提示:Methods: Construction of tissue-specific Sting knockout mice |
| IFN-β刺激 | IFN-β浓度和刺激时间 阅读提示:Methods: Western blot, coimmunoprecipitation... (IFN-β treatment) |
| STING-JAK1相互作用检测 | 免疫共沉淀的条件和抗体 阅读提示:Methods: Western blot, coimmunoprecipitation... |