鉴定3βHSD1磷酸化位点及其对酶活性的必要性
确定3βHSD1是否存在功能必需的磷酸化修饰及其位点。
在C4-2细胞中过表达HA-3βHSD1,用抗磷酸化酪氨酸抗体检测酪氨酸磷酸化;通过质谱分析鉴定磷酸化位点Y255和Y344;构建Y344F和Y255F突变体,检测DHEA代谢能力;使用定制磷酸化特异性抗体检测DHEA诱导的Y344磷酸化。
BMX controls 3βHSD1 and sex steroid biosynthesis in cancer
包含体外细胞实验、激酶筛选、生化酶学分析、体内小鼠移植瘤模型以及新鲜人前列腺组织代谢检测等多个独立证据层级,并包含功能验证与机制验证。
C4-2细胞系 LNCaP细胞系 VCaP细胞系 NSG小鼠移植瘤模型
3βHSD1 Y344磷酸化状态(Y344F突变体) BMX表达水平(shRNA敲低或过表达) BMX抑制剂(zanubrutinib、ibrutinib)处理 DHEA底物处理浓度和时间(如100 nM) 去势及DHEA缓释片植入的动物模型条件
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定3βHSD1是否存在功能必需的磷酸化修饰及其位点。
在C4-2细胞中过表达HA-3βHSD1,用抗磷酸化酪氨酸抗体检测酪氨酸磷酸化;通过质谱分析鉴定磷酸化位点Y255和Y344;构建Y344F和Y255F突变体,检测DHEA代谢能力;使用定制磷酸化特异性抗体检测DHEA诱导的Y344磷酸化。
寻找并验证负责磷酸化3βHSD1 Y344的激酶。
使用激酶抑制剂文库筛选抑制DHEA代谢的化合物;结合磷酸化预测工具,锁定BMX;通过药理学抑制剂、基因敲降和过表达实验验证BMX对3βHSD1磷酸化和DHEA代谢的作用;通过免疫共沉淀和体外激酶实验验证BMX与3βHSD1的直接相互作用和磷酸化。
阐明Y344磷酸化增强3βHSD1细胞酶活性的机制。
纯化WT和Y344F突变体蛋白,进行NAD+转化动力学分析;在细胞中共转染Flag-3βHSD1和GST-3βHSD1,检测二聚化;使用BMX抑制剂或Y344F突变体阻断磷酸化,观察对二聚化的影响。
确定3βHSD1 Y344磷酸化及BMX在前列腺癌细胞中的功能重要性。
构建稳定表达WT或Y344F 3βHSD1的C4-2细胞系,检测DHEA代谢、细胞增殖和AR靶基因表达;构建BMX敲低的LNCaP细胞系,检测细胞增殖和AR活性;使用BMX抑制剂处理LNCaP和C4-2细胞,检测细胞增殖和基因表达。
在动物模型中验证Y344磷酸化对CRPC肿瘤生长和雄激素合成的必要性,以及BMX药理学阻断的治疗效果。
将稳定表达WT或Y344F 3βHSD1的C4-2细胞皮下注射到NSG雄性小鼠,肿瘤生长后去势并植入DHEA缓释片,监测肿瘤生长和生存期;对C4-2或VCaP荷瘤小鼠去势并植入DHEA片后,口服zanubrutinib,评估肿瘤生长、生存期、瘤内睾酮和AR靶基因表达。
验证BMX抑制在人类组织中的效果,评估其转化潜力。
收集前列腺癌患者根治术后新鲜组织,离体培养,用或不用zanubrutinib处理,加入[3H]-DHEA,通过HPLC检测DHEA代谢;通过免疫沉淀和Western blot检测3βHSD1磷酸化和BMX-3βHSD1相互作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | 抗3βHSD1抗体 | Abcam | ab55268 |
| 抗磷酸化BMX抗体 | Abcam | ab59409 | |
| 抗磷酸化酪氨酸抗体 | Sigma-Aldrich | 05-1050 | |
| 抗磷酸化3βHSD1 Y344抗体 | Affinity Biosciences | -- | |
| 抗GST抗体 | Abclonal | AE001 | |
| 抗Flag抗体 | Sigma-Aldrich | F3165 | |
| 抗HA抗体 | Cell Signaling Technology | 3724S | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 3700S | |
| 抗BMX抗体 | Cell Signaling Technology | 24773 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 14C10 | |
| 药物处理 | 泽布替尼 | Selleckchem | BGB-3111 |
| 伊布替尼 | Selleckchem | S2680 | |
| 阿卡拉布替尼 | Selleckchem | ACP-196 | |
| 类固醇代谢 | 氚标记脱氢表雄酮 | PerkinElmer | -- |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Gemini | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| 转染 | FuGENE HD转染试剂 | Promega | E2311 |
| LentiCRISPRv2载体 | -- | -- | |
| 类固醇代谢 | β-葡糖醛酸酶 | Novoprotein | -- |
| Luna C18反相色谱柱 | Phenomenex | -- | |
| Breeze 1525高效液相色谱系统 | Waters Corp | -- | |
| β-RAM 3型在线放射性检测器 | IN/US Systems Inc. | -- | |
| Liquiscint闪烁液 | National Diagnostics | -- | |
| 基因表达 | GenElute哺乳动物总RNA小提试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad | -- | |
| ABI 7500实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| iTaq Fast SYBR Green Supermix(含ROX) | Bio-Rad | -- | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | Sigma-Aldrich | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | Roche | -- | |
| 磷酸酶抑制剂 | Sigma-Aldrich | -- | |
| BCA蛋白定量分析 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 硝酸纤维素膜 | Millipore | -- | |
| 化学发光检测系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 免疫共沉淀 | 抗Flag M2亲和凝胶 | Sigma-Aldrich | A2220 |
| 质谱分析 | Orbitrap Elite质谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Dionex Acclaim PepMap C18色谱柱 | -- | -- | |
| Sequest软件 | -- | -- | |
| Proteome Discoverer 2.3软件 | -- | -- | |
| 体外激酶实验 | 碱性磷酸酶 | -- | -- |
| 酶动力学 | FLAG M纯化试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| 3×FLAG肽 | -- | -- | |
| Amicon Ultra-0.5离心超滤管 | Millipore | -- | |
| GelCode蓝色染色试剂 | Pierce | 24590 | |
| Promega NADH检测试剂盒 | Promega | -- | |
| BioTek Synergy Neo多功能酶标仪 | BioTek | -- | |
| 细胞增殖 | 细胞增殖试剂WST-1 | Sigma-Aldrich | -- |
| 台盼蓝 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 动物实验 | 基质胶 | -- | -- |
| DHEA缓释片 | -- | -- | |
| 红花籽油 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 质谱分析 | NEXERA X2超高效液相色谱系统 | Shimadzu Corporation | -- |
| InfinityLab Poroshell 120 EC-C18色谱柱 | Agilent | -- | |
| Zorbax Eclipse Plus C18色谱柱 | Agilent | -- | |
| Qtrap 5500质谱仪 | AB Sciex | -- | |
| MultiQuant软件 | AB Sciex | -- | |
| RNA-Seq | HumanHT-12 v4表达芯片 | Illumina | -- |
| iScan扫描仪 | Illumina | -- | |
| GenomeStudio软件 | Illumina | -- | |
| HemI软件 | -- | -- | |
| 基因分型 | HSD3B1基因分型 | -- | -- |
| 数据分析 | GraphPad Prism软件 | -- | version 9.0.0 |
| Microsoft Excel软件 | -- | version 16.43 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和构建 | 细胞系来源(如LNCaP、C4-2、VCaP、293T)及培养条件是关键,需核对培养基、血清类型和浓度。 阅读提示:Methods: Cell lines and constructs |
| 类固醇代谢分析 | 处理浓度和时间:如[3H]-DHEA (100 nM, 300,000-600,000 cpm)处理时间(如4、5、6小时);需核对培养基体积、细胞数量和检测时间点。 阅读提示:Methods: Steroid metabolism |
| 基因表达分析 | 处理条件:如DHEA处理浓度(100 nM)和时间(48小时);需核对qPCR的归一化基因(RPLP0)和引物序列。 阅读提示:Methods: Gene expression |
| 免疫印迹和免疫沉淀 | 抗体使用浓度(如1:2,000)和IP条件;需核对用于IP的细胞裂解液量(2 mg)和亲和凝胶体积(30 μL)。 阅读提示:Methods: Immunoblots and immunoprecipitation |
| 体外激酶实验 | 激酶反应缓冲液成分、ATP浓度(20 μM)、温度(30°C)和时间(30分钟)。 阅读提示:Methods: In vitro kinase assay |
| 酶动力学 | NAD+浓度(0.1 mM)、DHEA浓度范围(1-20 μM)、蛋白量(1 μg)、反应时间(1小时)。 阅读提示:Methods: Enzyme kinetics |
| 细胞增殖实验 | 细胞接种密度(约10^4/孔)、饥饿条件(无酚红培养基,5% CSS)、DHEA浓度(100 nM)、处理时间(5天)。 阅读提示:Methods: Cell proliferation assay and cell counting |
| 小鼠异种移植模型 | 小鼠品系(NSG雄性,6-8周龄)、细胞注射量(C4-2: 10^7或6×10^6; VCaP: 10^7)、去势手术、DHEA缓释片剂量(5 mg)、zanubrutinib剂量(15 mg/kg)和给药方式(口服,每日两次)。 阅读提示:Methods: Mouse xenograft studies, Figure 5 |
| 人前列腺组织培养 | 组织获取和处理细节(如切割、等分)、培养基(DMEM, 10% FBS)、zanubrutinib或DMSO处理、[3H]-DHEA或DHEA浓度和处理时间。 阅读提示:Methods: Human tissue studies, Figure 6 |
| 质谱分析 | 样本量(至少30 mg肿瘤组织)、内标(d3-T)、提取溶剂(MTBE)和分析平台(QTRAP 5500)。 阅读提示:Methods: Mass spectrometry analysis |