建立肝癌小鼠模型并验证GS敲除效果
评估GS缺失对β-catenin驱动的肝癌发生发展的影响。
使用Alb-Cre小鼠特异性敲除肝脏GS,并通过SB-HTVI递送c-Met和ΔN90-β-catenin诱导肝癌,比较WT和KO小鼠的肿瘤负担和生存期。
Glutamine synthetase limits β-catenin-mutated liver cancer growth by maintaining nitrogen homeostasis and suppressing mTORC1
包含多个小鼠肝癌模型(c-Met/β-catenin、DEN、YAP/β-catenin)、肝细胞系体外实验、代谢组学和稳定同位素示踪,以及临床样本和组织芯片分析,并进行功能验证(GS敲除、mTORC1抑制、GPT抑制)。
c-Met/ΔN90-β-catenin诱导的肝癌小鼠模型 DEN/PB和DEN/HFD诱导的肝癌小鼠模型 YAP/ΔN90-β-catenin诱导的肝癌小鼠模型 Hep3B和HepG2肝癌细胞系
GS敲除时机(Alb-Cre胚胎期或腺病毒Cre成年期) β-catenin激活方式(SB-HTVI递送c-Met/ΔN90-β-catenin) mTORC1抑制剂rapamycin剂量(2 mg/kg,每周3次) GPT抑制剂β-CLA剂量(20 mg/kg,每周3次) 15N-NH4Cl示踪剂量(5 mmol/kg,腹腔注射)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估GS缺失对β-catenin驱动的肝癌发生发展的影响。
使用Alb-Cre小鼠特异性敲除肝脏GS,并通过SB-HTVI递送c-Met和ΔN90-β-catenin诱导肝癌,比较WT和KO小鼠的肿瘤负担和生存期。
确定GS缺失是否影响mTORC1信号通路。
通过RNA测序和GSEA分析WT和KO小鼠肝脏的基因表达,并通过免疫印迹、免疫组化和免疫荧光检测mTORC1下游靶标(p-S6、p-4EBP1)的磷酸化水平。
验证mTORC1激活在GS缺失促进肿瘤中的必要性。
对WT和KO小鼠给予rapamycin或车辆处理,比较肿瘤负担和生存期。
探究GS缺失对肝脏氮代谢的影响。
使用LC-MS进行非靶向代谢组学,并用15N-NH4Cl和13C-U-glucose进行稳定同位素示踪,比较WT和KO小鼠肝脏中代谢物和标记富集情况。
验证谷氨酸衍生的非必需氨基酸是否能激活mTORC1并促进细胞增殖。
在肝癌细胞系(Hep3B、HepG2)中,使用NEAA混合物或单个氨基酸刺激,检测mTORC1激活(p-S6K、p-S6),并敲低GLUL或转氨酶(GPT1、GOT1等)观察对mTORC1和细胞增殖的影响。
验证抑制谷氨酸转氨酶是否能抑制GS缺失促进的肝癌生长。
在Glul-KO小鼠中通过SB-HTVI敲低GPT1或给予β-CLA抑制GPT,评估肿瘤负担和mTORC1信号。
验证人类HCC中GS表达与尿素循环及mTORC1活性的相关性。
利用TCGA数据和组织芯片(TMA)分析CTNNB1突变与GLUL表达、UCE表达及mTORC1靶基因的关系,并分析GS表达与预后的关联。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 雷帕霉素 | LC Laboratories | R-5000 |
| β-氯-L-丙氨酸 | Santa Cruz Biotechnology | sc-291972 | |
| 动物实验 | 二乙基亚硝胺 | Sigma-Aldrich | N-0756 |
| 细胞培养 | L-丙氨酸 | Sigma-Aldrich | A7469 |
| L-天冬酰胺 | Sigma-Aldrich | A4159 | |
| L-谷氨酸 | Sigma-Aldrich | G8415 | |
| L-谷氨酰胺 | Sigma-Aldrich | G8540 | |
| 氯化铵 | Sigma-Aldrich | A9434 | |
| 二甲基α-酮戊二酸 | Sigma-Aldrich | 349631 | |
| L-环丝氨酸 | Sigma-Aldrich | C1159 | |
| 稳定同位素示踪 | 15N-氯化铵 | Cambridge Isotope Laboratories | NLM-467-PK |
| U-13C-D-葡萄糖 | Cambridge Isotope Laboratories | CLM-1396-1 | |
| 免疫印迹 | 抗GS抗体 | Sigma-Aldrich | G2781 |
| 抗p-S6 S235/236抗体 | Cell Signaling Technology | 4858 | |
| 抗p-4EBP1 T37/46抗体 | Cell Signaling Technology | 2855 | |
| 抗CPS1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-376190 | |
| 抗GPT1抗体 | Proteintech | 16897-1-AP | |
| 质粒构建 | pT3-EF1aH c-Met质粒 | Addgene | 86498 |
| pCMV/SB10转座酶质粒 | Addgene | 24551 | |
| pX330质粒 | Addgene | 42230 | |
| pLentiCRISPRv2质粒 | Addgene | 52961 | |
| 质粒纯化 | 质粒大提试剂盒 | Qiagen | 12163 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 肝癌小鼠模型建立 | 小鼠品系、性别、年龄;质粒种类和浓度;SB-HTVI注射方法 阅读提示:Methods: Mouse experiments, HTVI and related experiments |
| GS敲除 | Alb-Cre介导的胚胎期敲除或腺病毒Cre成年期敲除;敲除效率验证 阅读提示:Methods: Mouse experiments, HTVI and related experiments |
| 药物处理 | rapamycin剂量、给药频率和方式;β-CLA剂量、给药频率和方式 阅读提示:Methods: HTVI and related experiments |
| mTORC1信号检测 | 检测抗体(p-S6、p-4EBP1)和稀释比例;样品采集时间 阅读提示:Methods: Antibodies; Results: GS ablation leads to increased mTORC1 signaling |
| 代谢组学分析 | LC-MS方法;同位素示踪剂剂量和注射方式;组织采集时间 阅读提示:Methods: Chemicals; Results: GS ablation leads to increased production of nonessential amino acids |