小鼠模型生成与表型分析
确定Mfsd7c缺失对小鼠生存和整体表型的影响。
使用IMPC提供的Mfsd7c全敲除小鼠,进行时间交配获取胚胎,观察围产期致死性、体重和头部大小,并进行大体解剖。
Deficiency of MFSD7c results in microcephaly-associated vasculopathy in Fowler syndrome
研究包括基因敲除小鼠模型、组织学与免疫荧光分析、转录组测序、缺氧检测及人类患者遗传与影像学验证,涵盖表型、功能与机制多层次验证。
Mfsd7c基因敲除小鼠 HEK293细胞 Fowler综合征患者(S203Y纯合突变患者及复合杂合突变患者)
Mfsd7c敲除小鼠围产期致死性验证(时间交配获取胚胎) 大脑血管形态分析(CD31/GLUT1免疫染色,检查血管密度、直径及肾小球样结构) 血脑屏障完整性检测(NHS-biotin渗漏实验、PLVAP染色) 全身及大脑缺氧检测(pimonidazole注射) 神经元细胞死亡检测(活化caspase-3染色)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Mfsd7c缺失对小鼠生存和整体表型的影响。
使用IMPC提供的Mfsd7c全敲除小鼠,进行时间交配获取胚胎,观察围产期致死性、体重和头部大小,并进行大体解剖。
评估Mfsd7c缺失对胚胎大脑血管生长和形态的影响。
通过GLUT1和CD31免疫染色可视化血管,检查E13.5至E18.5胚胎脑冠状切片的血管生长、密度、直径及形态(肾小球样结构)。
验证MFSD7c缺失是否影响血脑屏障的结构和功能。
通过NHS-biotin注射评估血管渗漏,用PLVAP染色检测细胞窗孔,检查是否存在出血。
探究血管生长缺陷是否导致缺氧和神经元细胞死亡。
注射pimonidazole检测缺氧区域,用活化caspase-3染色检测细胞死亡,并与CD31共染。
鉴定Mfsd7c缺失对全脑基因表达的影响。
对E14.5 WT和KO胚胎全脑RNA进行转录组测序,分析差异表达基因,并用qRT-PCR验证关键基因。
将小鼠表型与人类Fowler综合征进行关联验证。
对患者进行全外显子组测序,并通过Sanger测序验证突变;获取患者脑组织进行组织学染色和MRI检查。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 组织学染色 | 伊红 | MilliporeSigma | -- |
| DPX封片剂 | Merck | -- | |
| 蛋白质印迹 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 11836170001 |
| 磷酸酶抑制剂混合物1 | MilliporeSigma | P2850 | |
| β-肌动蛋白抗体 | MilliporeSigma | A5441 | |
| GLUT1抗体 | Abcam | ab40084 | |
| 磷酸化SMAD1/5抗体 | Cell Signaling Technology | 9516 | |
| SMAD4抗体 | Cell Signaling Technology | 38454 | |
| β-连环蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 19807 | |
| 磷酸化β-连环蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 9561 | |
| 蛋白质印迹成像 | ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | -- |
| 缺氧检测 | 缺氧探针Red549试剂盒 | Hypoxyprobe | -- |
| 血脑屏障渗透性检测 | NHS-生物素 | Thermo Fisher Scientific | 21335 |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 血红素检测 | 血红素比色测定试剂盒 | Biovision | K672 |
| 氚标记血红素 | American Radiochemicals | -- | |
| RNA提取 | QIAGEN Mini RNA提取试剂盒 | QIAGEN | -- |
| TRIzol试剂 | Invitrogen | -- | |
| cDNA合成 | SuperScript第一链合成系统 | Invitrogen | -- |
| qPCR | SYBR Green混合液 | -- | -- |
| RNA测序 | NovaSeq 6000测序平台 | Illumina | -- |
| 外显子组捕获 | Twist人类全外显子核心试剂盒 | Twist Bioscience | -- |
| 显微镜 | Leica CM3060S冷冻切片机 | Leica | -- |
| 显微成像 | Zeiss LSM710共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| Fisherbrand Superfrost Plus显微镜载玻片 | Fisherbrand | -- | |
| 统计 | GraphPad Prism 7.2版 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | Mfsd7c基因敲除小鼠来源(IMPC),遗传背景,饲养条件,基因型鉴定引物 阅读提示:Methods - Mice |
| 免疫染色 | 固定条件(4% PFA,时间1-5天),蔗糖脱水浓度和时间,OCT包埋,切片厚度(15-50 μm),抗体浓度 阅读提示:Methods - Immunostaining of embryo sections,Supplemental Table 2 |
| 血脑屏障渗透性检测 | NHS-biotin注射剂量(4 mg/mL, 5 μL),注射部位(肝脏),循环时间(10分钟) 阅读提示:Methods - NHS-biotin injections |
| 缺氧检测 | pimonidazole剂量(180 mg/kg),注射时机(GD15.5),注射后3小时收集胚胎 阅读提示:Methods - Immunostaining of embryo sections |
| 细胞培养与转染 | HEK293细胞培养条件,质粒量(2-3 μg/孔,24孔板),转染试剂(Lipofectamine 2000),转染后24小时处理 阅读提示:Methods - Expression of MFSD7c in HEK293 cells |
| 转录组分析 | E14.5全脑RNA提取方法,RNA-Seq建库与测序平台(Novogene),比对参考基因组(mm10,Ensembl Release 98),差异表达分析工具(DESeq2) 阅读提示:Methods - Transcriptomic analysis |