体内T细胞筛选框架

体内T细胞筛选是阐明免疫复杂机制的有力工具，然而对于稳健的体内筛选所需的关键设计参数——基因文库大小、细胞移植数量和实验动物数量——仍缺乏共识。本研究提出了体内T细胞筛选框架（FITS），为不同体内实验场景提供确定最优参数的实验与分析指南。通过概念验证，我们运用FITS优化了B16-OVA肿瘤模型中CD8+ T细胞筛选的参数。我们在筛选中引入独特分子标识符（UMIs），以实现：（1）增强统计效力；（2）追踪不同基因敲除（KOs）的T细胞克隆在多个组织中的动态变化。这些发现为免疫细胞的体内筛选提供了实验与分析框架，并通过UMIs在体内T细胞筛选中的应用展示了具体案例。