EC-周细胞串扰图谱构建
系统鉴定健康和LPS诱导ALI肺中EC-周细胞间的分子通讯
从Pdgfrb-EGFP小鼠肺中分离EC和周细胞,进行RNA-seq,并利用扩展的细胞-细胞相互作用数据库进行串扰分析
Activating NO-sGC crosstalk in the mouse vascular niche promotes vascular integrity and mitigates acute lung injury
包含体内小鼠模型(LPS诱导ALI)、细胞特异性基因敲除、体外微流体芯片、转录组分析及电镜形态学等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
Pdgfrb-EGFP小鼠(肺内皮细胞和周细胞) LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 Gucy1a1-EGFP报告小鼠 HUVEC和HBVP共培养的微流体芯片血管网络
LPS诱导ALI小鼠模型(气管内滴注2 mg/kg LPS) Riociguat给药方案(20 mg/kg,每9小时口服,伤后3小时开始) 周细胞特异性sGC敲除小鼠(Cspg4-CreERT2::Gucy1b1flox/flox) 体外微流体芯片实验(HUVEC和HBVP共培养,TNFα刺激) 血管通透性检测(Evans blue渗漏实验)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
系统鉴定健康和LPS诱导ALI肺中EC-周细胞间的分子通讯
从Pdgfrb-EGFP小鼠肺中分离EC和周细胞,进行RNA-seq,并利用扩展的细胞-细胞相互作用数据库进行串扰分析
验证LPS处理后EC-周细胞间NO-sGC信号受损
检测肺中eNOS和sGC的表达,并用免疫染色验证sGC在周细胞中的表达
验证药理学激活sGC是否能减轻LPS诱导的肺损伤
在LPS损伤后给予Riociguat治疗,评估血管渗漏、肺水肿、炎症细胞浸润和肺组织学变化
确定Riociguat的保护作用是否依赖于周细胞sGC
利用周细胞、平滑肌细胞或血小板特异性sGC敲除小鼠,评估Riociguat对LPS诱导肺损伤的影响
在仅含EC和周细胞的微流体血管网络中验证NO-sGC激活对血管完整性的直接作用
将HUVEC和HBVP共培养于微流体芯片形成血管网络,用TNFα诱导炎症,并用8-Br-cGMP激活sGC下游,评估血管渗漏和周细胞形态变化
阐明sGC激活稳定周细胞形态的分子机制
进行转录组学和转录因子富集分析,验证VASP磷酸化和MRTFA核转位是否受sGC信号调控
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 利奥西呱 | Selleck | S8135 |
| 细胞培养 | 人脐静脉内皮细胞 | PromoCell | C-12208 |
| 内皮细胞生长培养基2 | PromoCell | C-22011 | |
| 人脑血管周细胞 | ScienceCell | 1200 | |
| 周细胞培养基 | ScienceCell | 1201 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15070063 | |
| I型胶原蛋白 | Corning | 354249m | |
| 8-溴环磷酸鸟苷 | Sigma-Aldrich | B1381 | |
| 肿瘤坏死因子α | R&D | 210-TA-100 | |
| 动物实验 | 脂多糖 | -- | -- |
| 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | T5648 | |
| 血管通透性检测 | 伊文思蓝 | -- | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| RNeasy小型试剂盒 | Qiagen | 217004 | |
| cDNA合成 | ReverTra Ace qPCR RT预混液 | Toyobo | FSQ-301 |
| qPCR | PowerUp SYBR Green预混液 | Invitrogen | A25778 |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Yeason | 20201ES76 |
| 蛋白检测 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Sangon | B14001 |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Sangon | B15001 | |
| ELISA | 小鼠CCL2酶联免疫吸附试剂盒 | Beyotime | PC125 |
| 免疫荧光 | 兔抗GUCY1A1抗体 | Proteintech | 12605-1-AP |
| 兔抗PDGFRβ抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-15143 | |
| 兔抗NG2抗体 | Abcam | ab129051 | |
| 兔抗Desmin抗体 | Abcam | Ab15200-1 | |
| 大鼠抗TER119抗体 | BD | 557915 | |
| 大鼠抗GR1抗体 | Biolegend | 108419 | |
| 仓鼠抗CD31抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA3105 | |
| 小鼠抗eNOS抗体 | Abcam | ab76198 | |
| Western blot | 兔抗GUCY1B1抗体 | Abcam | ab154841 |
| 小鼠抗GAPDH抗体 | TransGen | HC301-02 | |
| 小鼠抗Tubulin抗体 | Transgenbiotech | HC-101-01 | |
| 兔抗p-eNOS(Ser1177)抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-97371 | |
| 兔抗VASP抗体 | Cell Signaling Technology | 3132S | |
| 兔抗p-VASP(Ser239)抗体 | Cell Signaling Technology | 3114S | |
| HRP偶联驴抗兔IgG | Jackson | 711-036-152 | |
| HRP偶联驴抗小鼠IgG | Jackson | 715-036-151 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | 小鼠品系(Pdgfrb-EGFP、Gucy1a1-EGFP等)、性别(雄性)、周龄(8周)、LPS剂量(2 mg/kg气管内滴注或6 mg/kg腹腔注射) 阅读提示:Materials and methods - Mouse experiments 和 Intratracheal LPS instillation-induced lung injury model |
| 药物处理 | Riociguat剂量(20 mg/kg)、给药途径(口服灌胃)、给药间隔(每9小时)、首次给药时间(LPS后3小时) 阅读提示:Materials and methods - Riociguat treatment regimen |
| 血管通透性检测 | Evans blue剂量(30 mg/kg)、尾静脉注射时间(处死前2小时)、灌注条件(EDTA缓冲液,8 ml/min,5分钟) 阅读提示:Materials and methods - Evans blue permeability assay |
| 细胞培养与体外实验 | HUVEC和HBVP的来源与代数(不超过第6代)、培养条件(37°C、5% CO2)、TNFα浓度(100 ng/ml)、8-Br-cGMP浓度(50 µM) 阅读提示:Materials and methods - Cell culture 和 Microfluidic chip assay |
| 基因敲除 | 他莫昔芬剂量(100 μl,20 mg/ml)、注射天数(连续5天)、诱导周龄(4周)、敲除效率验证(qPCR和Western blot) 阅读提示:Materials and methods - Pericyte-, vSMC-, or platelet-specific Gucy1b1 deletion |