病毒株筛选与感染模型建立
确定神经毒力EV-D68株是否能在新生小鼠中复制并引起麻痹。
将3日龄WT小鼠颅内接种105 PFU的三种EV-D68株(Fermon、MO49、IL52)或PBS对照,在1、3、5 dpi检测脑和脊髓组织病毒滴度,观察麻痹发生,并检测血清中和抗体。
Immune cells promote paralytic disease in mice infected with enterovirus D68
包含体外三维脊髓类器官感染、新生小鼠颅内感染(包括病毒滴度、免疫组化、细胞因子分析)、免疫细胞耗竭和基因缺陷小鼠(Ccr2–/–、Rag1–/–)等功能验证,证据层次明确。
3日龄C57BL/6J野生型新生小鼠 Ccr2基因敲除新生小鼠 Rag1基因敲除新生小鼠 人诱导多能干细胞来源的三维脊髓类器官(3-DiSC hSCO)
颅内接种剂量:105 PFU,接种体积5 μL 病毒株:EV-D68 US/IL/14-18952 (IL52) 小鼠品系:C57BL/6J WT、Ccr2–/–、Rag1–/– 细胞耗竭抗体:抗CD4(克隆GK1.5)和抗CD8(克隆2.43),每只50 μg 麻痹监测终点:每日观察,出现麻痹即安乐死
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定神经毒力EV-D68株是否能在新生小鼠中复制并引起麻痹。
将3日龄WT小鼠颅内接种105 PFU的三种EV-D68株(Fermon、MO49、IL52)或PBS对照,在1、3、5 dpi检测脑和脊髓组织病毒滴度,观察麻痹发生,并检测血清中和抗体。
比较神经毒力株和非毒力株在体内和体外诱导的细胞因子差异。
通过Luminex多因子检测,分析感染后脊髓组织和hSCO上清中31种(小鼠)和37种(人)炎症因子的浓度,比较IL52和MO49诱导的差异。
确定神经毒力EV-D68感染是否导致免疫细胞募集至脊髓。
从麻痹的IL52感染小鼠和对照小鼠中制备脊髓单细胞悬液,使用流式细胞术(27参数)检测T细胞、巨噬细胞、单核细胞等免疫细胞的数量和比例。
验证CCR2介导的免疫细胞募集和成熟淋巴细胞是否参与麻痹发生。
对Ccr2–/–、Rag1–/–和WT小鼠颅内接种EV-D68 IL52,检测病毒滴度、瘫痪率、细胞因子水平和脊髓免疫细胞组成。
确定CD4+或CD8+ T细胞是否直接促进EV-D68瘫痪。
对3日龄WT小鼠颅内接种IL52后,腹腔注射抗CD4、抗CD8或同型对照抗体(50 μg,第0天和第3天),监测瘫痪发生。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 横纹肌肉瘤细胞 | ATCC | CCL-136 |
| 人支气管上皮细胞 | ATCC | CRL-3588 | |
| 病毒培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 病毒噬斑试验 | 琼脂糖 | Invitrogen | 16500500 |
| 2X MEM培养基 | Gibco | -- | |
| 中性红 | -- | -- | |
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
| Hamilton注射器 | Hamilton | -- | |
| 组织破碎仪 | QIAGEN | -- | |
| 抗体耗竭 | 抗血蓝蛋白IgG2b同型对照抗体 | Bio X Cell | BE0090 |
| 抗CD4单克隆抗体(克隆GK1.5) | Bio X Cell | BE0003-1 | |
| 抗CD8单克隆抗体(克隆2.43) | Bio X Cell | BE0061 | |
| InVivoPure稀释液 | Bio X Cell | -- | |
| 中和试验 | 结晶紫 | -- | -- |
| hSCO培养 | mTeSR Plus培养基 | STEMCELL Technologies | 100-0276 |
| Y-27632 | Tocris | 1254 | |
| Cultrex基质胶 | R&D Systems | 3434-005-02 | |
| ACCUMAX细胞分离液 | STEMCELL Technologies | -- | |
| DMEM/F-12培养基 | Gibco | -- | |
| Neurobasal培养基 | Gibco | -- | |
| KnockOut血清替代物 | Invitrogen | -- | |
| N2添加剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 不含维生素A的B27添加剂 | Invitrogen | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Gibco | -- | |
| 抗坏血酸 | MilliporeSigma | -- | |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | Thermo Fisher Scientific | 13256-029 | |
| CHIR 99021 | Tocris | 4423 | |
| SB431542 | Tocris | 1614 | |
| 视黄酸 | Tocris | 302-79-4 | |
| Smoothened激动剂 | Tocris | 912545-86-9 | |
| 免疫荧光 | VP1特异性抗体 | Genetex | GTX132313 |
| NeuN特异性抗体 | BioLegend | 834501 | |
| 山羊抗兔IgG | Thermo Fisher Scientific | A-11008 | |
| 山羊抗小鼠IgG | Thermo Fisher Scientific | A-11001 | |
| Leica Stellaris 5共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| Luminex | Bio-Plex Pro小鼠趋化因子31-plex检测试剂盒 | Bio-Rad | 12009159 |
| LabMAP多因子分析系统 | Luminex | -- | |
| Bio-Plex人炎症因子37-plex检测试剂盒 | Bio-Rad | 171AL001M | |
| MAGPIX多因子检测系统 | MilliporeSigma | -- | |
| 流式细胞术 | HBSS缓冲液 | Gibco | 14175095 |
| 胰蛋白酶 | Worthington | LS003708 | |
| 细胞筛网 | Falcon | 352350 | |
| LIVE/DEAD可固定紫色荧光染料 | Thermo Fisher Scientific | L34963 | |
| 抗CD16/CD32抗体 | Tonbo Biosciences | 70-0161-M001 | |
| True-Stain单核细胞阻断剂 | BioLegend | 46102 | |
| Brilliant Stain缓冲液 | BD Biosciences | 566349 | |
| Cytofix/Cytoperm固定/破膜液 | BD Biosciences | 554714 | |
| Perm/Wash缓冲液 | BD Biosciences | -- | |
| Aurora多光谱流式细胞仪 | Cytek | -- | |
| Precision Count计数微球 | BioLegend | 424902 | |
| 统计分析 | GraphPad Prism软件 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 病毒株选择和接种 | EV-D68株(IL52)的来源和制备,颅内接种剂量(105 PFU)和体积(5 μL),小鼠品系和日龄(3日龄C57BL/6J) 阅读提示:Methods: Cells and viruses, Mouse experiments; Figure 1 legend |
| 麻痹监测 | 麻痹判定标准(肢体拖拽、对刺激无反应),观察频率(每日),安乐死时间点(出现麻痹即处死) 阅读提示:Methods: Mouse experiments; Results: EV-D68 strains differ in virulence; Figure 1D |
| 细胞因子分析 | Luminex试剂盒型号(小鼠31-plex,人37-plex),样本(脊髓组织匀浆、hSCO上清)收集时间(3 dpi),数据处理和统计学方法 阅读提示:Methods: Luminex assays; Figure 2和Figure 3图注 |
| 免疫细胞分析 | 脊髓单细胞制备方法,流式抗体组合(见补充表1),细胞固定和透化条件,数据获取仪器(Aurora),绝对计数方法(Precision Count Beads) 阅读提示:Methods: Flow cytometric analyses; Supplemental Table 1 |
| 基因缺陷小鼠实验 | Ccr2–/–和Rag1–/–小鼠的基因型背景,感染剂量和途径,观察时间(14 dpi),病毒滴度检测方法 阅读提示:Results: CCR2-dependent...和Paralysis frequency...; Methods: Mouse experiments |
| 抗体耗竭实验 | 抗体克隆(GK1.5、2.43)和同型对照,给药剂量(50 μg)和次数(第0天和第3天),给药途径(腹腔注射),小鼠日龄(3日龄) 阅读提示:Methods: Mouse experiments; Results: Antibody-mediated...; Figure 8 legend |