患者样本中RAB7表达分析
评估PAH患者肺组织和PAECs中RAB7的表达水平。
通过免疫荧光和免疫印迹检测PAH患者和对照组肺组织、PAECs和PASMCs中RAB7蛋白表达。
RAB7 deficiency impairs pulmonary artery endothelial function and promotes pulmonary hypertension
包括患者样本、细胞模型、小鼠模型和大鼠模型,并包含功能验证(血管生成、迁移、衰老)和机制验证(自噬、线粒体功能)及药物干预实验。
人肺动脉内皮细胞(PAECs) 内皮RAB7单倍剂量不足小鼠(RAB7fl/WT Cdh5-Cre+) 慢性缺氧/SU5416(Hx/Su)诱导的肺动脉高压大鼠模型
患者PAECs中RAB7表达降低及内体-溶酶体功能受损 内皮RAB7单倍剂量不足小鼠在常氧下自发PH,暴露于Hx/Su后加重 RAB7 siRNA敲低PAECs中血管生成、迁移和衰老的表型变化 RAB7敲低导致线粒体膜电位降低、氧化磷酸化受损和糖酵解增强 ML-098干预治疗可减轻已建立的Hx/Su大鼠的PH和右心功能障碍
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估PAH患者肺组织和PAECs中RAB7的表达水平。
通过免疫荧光和免疫印迹检测PAH患者和对照组肺组织、PAECs和PASMCs中RAB7蛋白表达。
检测内皮RAB7单倍剂量不足对肺血管重塑和PH发展的影响。
通过RAB7fl/fl与Cdh5-Cre杂交产生内皮特异性RAB7单倍剂量不足小鼠,暴露于Hx/Su或常氧,评估PH参数。
评估RAB7沉默对人PAECs功能的影响。
使用siRNA沉默PAECs中RAB7,进行血管生成、迁移、衰老、内体-溶酶体运输和降解、线粒体功能等检测。
评估RAB7激动剂ML-098对Hx/Su诱导的PH大鼠的治疗效果。
采用预防性(day1-21)和干预性/逆转性(day22-35或day36-49)给药方案,评估ML-098对PH参数的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 内皮细胞生长培养基-2微血管 | Lonza | CC-3162 |
| 平滑肌细胞生长培养基2 | Lonza | CC-3182 | |
| siRNA转染 | GenMute转染试剂 | SignaGen | SL100568 |
| RAB7 siRNA | Integrated DNA Technologies | NM_004637 | |
| 对照siRNA | Integrated DNA Technologies | 51-01-14-04 | |
| 血管生成实验 | 基质胶 | BD Biosciences | -- |
| μ-slide 15孔培养皿 | Ibidi | 81506 | |
| 细胞迁移实验 | 3孔迁移实验培养插入件 | Ibidi | 80369 |
| 衰老检测 | 衰老β-半乳糖苷酶染色试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9860 |
| 内体-溶酶体运输检测 | pHrodo红色葡聚糖 | Invitrogen (Thermo Fisher Scientific) | P10361 |
| CellLight早期内体-GFP试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | C10586 | |
| LysoTracker绿色荧光染料 | Thermo Fisher Scientific | L7526 | |
| 溶酶体活性检测 | 组织蛋白酶B检测试剂盒 | PromoCell | PK-CA577-K140 |
| 线粒体膜电位检测 | TMRE染色试剂盒 | Abcam | ab113852 |
| MitoTracker绿色荧光染料 | Thermo Fisher Scientific | M7514 | |
| TMRM检测试剂盒 | Abcam | ab228569 | |
| Hoechst 33342染料 | Thermo Fisher Scientific | H-1399 | |
| 线粒体ROS检测 | mitoSOX红色探针 | Thermo Fisher Scientific | M36008 |
| LIVE/DEAD可固定近红外死细胞染色试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | L34975 | |
| 乳酸检测 | 乳酸-Glo检测 | Promega | J5021 |
| 动物实验 | SU5416 | MilliporeSigma | S8442 |
| ML-098 | TargetMol | T4619 | |
| Vevo 2100小动物超声成像系统 | VisualSonics | -- | |
| GE Vivid IQ Premium超声系统 | GE Healthcare | -- | |
| 1.4F Millar导管 | Millar | -- | |
| PowerLab数据采集系统 | AD Instruments | -- | |
| 小动物呼吸机(RoVent) | Kent Scientific Corporation | -- | |
| 显微镜 | EVOS M7000自动显微镜 | Thermo Fisher Scientific | AMF7000 |
| 流式细胞术 | BD FACSSymphony A1流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| FlowJo 10软件 | FlowJo | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 9.0软件 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本分析 | 患者和对照组的样本量、PAECs分离和培养条件、RAB7表达检测方法 阅读提示:Methods: Cell lines, Tissue samples; Figure 1 legends |
| 内皮RAB7单倍剂量不足小鼠模型 | 小鼠品系、Cre介导的重组、Hx/Su暴露方案、PH评估指标和方法 阅读提示:Methods: Animal models, Animal experiments; Figure 2 legends |
| 体外RAB7敲低实验 | siRNA序列和浓度、转染试剂、转染时间、功能实验条件(血管生成、迁移、衰老等) 阅读提示:Methods: Cell culture experiments; Figure 4 and 5 legends |
| 线粒体功能检测 | TMRE/MitoTracker染色浓度和孵育时间、Seahorse分析条件、乳酸检测方法 阅读提示:Methods: Cell culture experiments; Figure 6 legends |
| ML-098治疗实验 | ML-098剂量和给药方案、动物模型建立和监测、PH评估指标 阅读提示:Methods: Animal experiments; Figure 7 and 8 legends |