发现FMO2在缺血性心肌细胞中表达上调
鉴定与心肌细胞缺血损伤相关的关键基因
对常氧和低氧处理的新生大鼠心肌细胞进行RNA-Seq分析,发现FMO2是氧化还原过程中表达上调最显著的基因之一;随后在MI大鼠心肌细胞和患者心脏样本中验证FMO2表达增加。
Flavin-containing monooxygenase 2 confers cardioprotection in ischemia models through its disulfide bond catalytic activity
包含细胞实验(NRCMs、hiPSC-CMs)、动物模型(MI和I/R大鼠模型、FMO2-KO大鼠)、临床样本、RNA-Seq、蛋白互作及结构模拟等多种证据层级,且具有明确的功能验证和机制验证。
新生大鼠心肌细胞(NRCMs) 成年大鼠心肌梗死模型 大鼠心肌缺血/再灌注模型 人诱导多能干细胞来源的心肌细胞(hiPSC-CMs)
SD大鼠(3-8周龄)通过尾静脉注射AAV9-shFMO2或AAV9-FMO2(4×10^12病毒颗粒/只),4周后建立MI模型 NRCMs在低氧(0.5% O2)条件下处理24或48小时 FMO2-KO大鼠通过CRISPR/Cas9基因编辑构建 TUNEL和cleaved caspase 3检测心肌细胞凋亡 使用DTNB和TCEP检测二硫键形成
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定与心肌细胞缺血损伤相关的关键基因
对常氧和低氧处理的新生大鼠心肌细胞进行RNA-Seq分析,发现FMO2是氧化还原过程中表达上调最显著的基因之一;随后在MI大鼠心肌细胞和患者心脏样本中验证FMO2表达增加。
阐明FMO2对心肌细胞存活和心脏功能的影响
通过AAV9介导的心肌细胞特异性敲低和过表达FMO2,以及FMO2基因敲除大鼠,观察MI后心肌细胞凋亡、梗死面积和心脏功能的变化。
明确FMO2是否通过调节内质网应激和UPR通路影响心肌细胞凋亡
在低氧处理的心肌细胞中检测内质网应激标志物和UPR通路蛋白的表达,评估FMO2敲低或过表达对UPR的影响;并通过CHOP过表达验证其关键作用。
证明FMO2具有催化二硫键形成的能力
通过DTNB检测细胞硫醇含量、DTT诱导的细胞毒性实验、体外GSH氧化实验和荧光肽底物实验,验证FMO2的催化活性;并使用TCEP和PDI敲低实验验证其与ER应激的关系。
鉴定FMO2催化活性所需的关键结构基序
通过结构比对和分子动力学模拟,预测GVSG基序的关键作用;构建GVSG突变体(LV-ΔFMO2)并在细胞和动物模型中验证其功能丧失。
评估FMO2过表达对心肌梗死和缺血再灌注损伤的治疗效果
在MI和I/R大鼠模型中,通过AAV9介导的FMO2过表达或敲低,评估其对心功能、心肌凋亡、纤维化和内质网应激的影响;并在hiPSC-CMs中验证人FMO2的保护作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | AAV9-shFMO2 | -- | -- |
| AAV9-FMO2 | -- | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Corning | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶/EDTA | Genomcellbio Biotechnology | -- | |
| II型胶原酶 | Gibco | -- | |
| 明胶 | MilliporeSigma | -- | |
| 5-溴-2-脱氧尿苷 | MilliporeSigma | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Roche | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce, Thermo Fisher Scientific | -- | |
| FMO2抗体 | Novus Biologicals | NBP1-85952 | |
| FMO1抗体 | Abcam | ab97720 | |
| FMO3抗体 | Abcam | ab126711 | |
| FMO4抗体 | Abcam | ab191141 | |
| FMO5抗体 | Abcam | ab189516 | |
| 心肌肌钙蛋白I抗体 | Abcam | ab47003 | |
| FLAG标签抗体 | Abcam | ab49763 | |
| cleaved caspase 3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 | |
| GRP78抗体 | Abcam | ab21685 | |
| caspase 12抗体 | MilliporeSigma | C7611 | |
| CHOP抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7351 | |
| p-PERK抗体 | Cell Signaling Technology | 3179 | |
| PERK抗体 | Cell Signaling Technology | 3192 | |
| p-eIF2α抗体 | Cell Signaling Technology | 9721 | |
| eIF2α抗体 | Cell Signaling Technology | 5324 | |
| ATF6抗体 | Proteintech | 24169 | |
| sXBP1抗体 | BioLegend | 619502 | |
| PDI抗体 | Cell Signaling Technology | 3501 | |
| HIF1抗体 | Huabio | ER1802-41 | |
| 肌动蛋白抗体 | Kangchen | KC-5A08 | |
| ECL化学发光检测试剂盒 | MilliporeSigma | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| MMLV逆转录酶 | TAKARA | -- | |
| SYBR Premix Ex Taq试剂盒 | Takara | -- | |
| 组织切片染色 | 30%蔗糖溶液 | Sangon Biotech | -- |
| OCT包埋剂 | Sakura | -- | |
| 小麦胚芽凝集素 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 肌钙蛋白I抗体(免疫荧光用) | Abcam | ab47003 | |
| 山羊抗兔二抗 | Abcam | ab96883 | |
| Masson三色染色试剂盒 | Solaribio | -- | |
| 凋亡检测 | TUNEL检测试剂盒 | Roche | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RNA-seq | NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒 | Illumina | -- |
| TruSeq PE簇生成试剂盒 | Illumina | -- | |
| 透射电镜 | 醋酸铀酰 | -- | -- |
| H-7500透射电子显微镜 | Hitachi | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C0037 |
| 二硫键测定 | 总硫醇检测试剂盒 | BestBio | -- |
| 谷胱甘肽 | MilliporeSigma | -- | |
| 体外酶活反应 | 纯化FMO2蛋白 | Sino Biological | -- |
| 多肽NRCSQGSCWN | Chinese Peptide | -- | |
| 蛋白质氧化还原状态检测 | AMS(4-乙酰氨基-4'-马来酰亚胺基芪-2,2'-二磺酸) | Invitrogen | -- |
| NEM(N-乙基马来酰亚胺) | MilliporeSigma | -- | |
| TCEP(三(2-羧乙基)膦) | Sangon Biotech | -- | |
| hiPSC培养 | mTeSR1培养基 | STEMCELL Technologies | -- |
| Matrigel基质胶 | -- | -- | |
| Accutase消化液 | STEMCELL Technologies | -- | |
| Y27632(ROCK抑制剂) | Tocris | -- | |
| hiPSC分化 | CHIR99021(GSK3抑制剂) | Selleckchem | -- |
| 无胰岛素RPMI/B-27培养基 | -- | -- | |
| IWP2(Wnt抑制剂) | Biorbyt | -- | |
| 流式细胞术 | True-Nuclear转录因子缓冲液套装 | BioLegend | -- |
| PE标记小鼠抗肌钙蛋白T抗体 | BD Biosciences | 564767 | |
| BD FACSCanto II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8.0 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 心肌梗死后FMO2的表达检测 | 成人SD大鼠(3-8周龄)MI术后3天分离CM;NRCMs低氧处理24或48小时;FMO2蛋白和mRNA水平;FMO1-5表达情况 阅读提示:Methods: Animals, MI and I/R models, Western blot analysis, RT-qPCR; Results: Figure 1 |
| AAV9介导的FMO2敲低/过表达 | AAV9-shFMO2或AAV9-FMO2的注射剂量(4×10^12病毒颗粒/只)和给药途径(尾静脉);注射后4周进行MI手术;心肌细胞特异性启动子cTnT 阅读提示:Methods: AAV9 construction and injection; Results: Figure 2 and Figure 3 |
| 细胞凋亡检测 | TUNEL染色定量(TUNEL+和troponin I+双阳性细胞数);cleaved caspase 3蛋白表达;样本数量(每组n=5) 阅读提示:Methods: TUNEL assay; Results: Figure 2 A-D |
| 内质网应激和UPR通路检测 | 低氧处理NRCMs(24小时)或MI后第3天心脏组织;检测GRP78、CHOP、cleaved caspase 12、p-PERK/PERK、p-eIF2α/eIF2α、sXBP1、ATF6蛋白水平 阅读提示:Methods: Western blot analysis; Results: Figure 5 and Figure 6 |
| 二硫键催化活性检测 | DTNB法测定细胞硫醇含量;DTT处理(5 mM,4小时)后CCK-8检测细胞活力;FMO2蛋白浓度(3 μM)和底物(GSH、肽NRCSQGSCWN)反应体系;TCEP(0.5 mM)处理;PDI siRNA敲低 阅读提示:Methods: Thiol-disulfide exchange reactions, Determination of the thiol group, DTT-induced reductive stress model, Results: Figure 7 |
| GVSG基序功能验证 | LV-ΔFMO2(GVSG突变)的构建和表达;在低氧NRCMs中检测二硫键含量、TUNEL凋亡、ER应激相关蛋白表达 阅读提示:Methods: Lentivirus construction and transfection; Results: Figure 8 |
| 大鼠心肌缺血/再灌注模型 | I/R手术操作:左前降支结扎45分钟后松开;AAV9-shFMO2或AAV9-FMO2注射后4周进行I/R手术;再灌注后4小时和28天检测 阅读提示:Methods: MI and I/R models; Results: Supplemental Figure 13-14 |
| hiPSC-CMs模型验证 | hiPSC-CMs分化流程和鉴定;低氧处理条件;FMO2过表达或敲低后检测GRP78、CHOP等ER应激蛋白 阅读提示:Methods: Generation of CMs from hiPSCs, Characterization of hiPSC-CMs; Results: Supplemental Figure 15 |