氧化脂质组学分析患者样本
检测多种慢性炎症性疾病上皮组织中铁死亡相关氧化磷脂的积累
通过LC-MS分析哮喘、囊性纤维化、银屑病和肾衰竭患者的上皮样本,发现铁死亡特异性的氧化磷脂酰乙醇胺(oxPE)物种水平升高。
Ferroptosis of select skin epithelial cells initiates and maintains chronic systemic immune-mediated psoriatic disease
包含氧化脂质组学、质谱成像、体外细胞实验、遗传小鼠模型及治疗干预等多个独立实验层级,并进行功能与机制验证。
K14/Gpx4小鼠模型 人银屑病皮肤组织 原代人表皮角质形成细胞(HEKa)
K14+角质形成细胞中Gpx4敲除的诱导方式(他莫昔芬处理) 小鼠模型启动铁死亡所需的Gpx4缺失比例 脂氧合酶15-LOX-2在银屑病表皮中的表达上调 铁死亡抑制剂liproxstatin-1的给药途径和剂量
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测多种慢性炎症性疾病上皮组织中铁死亡相关氧化磷脂的积累
通过LC-MS分析哮喘、囊性纤维化、银屑病和肾衰竭患者的上皮样本,发现铁死亡特异性的氧化磷脂酰乙醇胺(oxPE)物种水平升高。
确定铁死亡在银屑病表皮中发生的细胞类型和空间分布
使用MALDI-MS成像和双SIMS成像技术,结合免疫荧光染色,鉴定出K14+角质形成细胞中富含铁死亡标志物oxPE。
验证特异性敲除K14+角质形成细胞中Gpx4是否能诱导铁死亡并产生银屑病表型
通过他莫昔芬诱导K14-CreERT介导的Gpx4敲除,在K14+角质形成细胞中触发铁死亡,观察小鼠皮肤和全身炎症变化。
评估K14/Gpx4小鼠模型与人类银屑病转录组的一致性
对小鼠皮肤和人类皮肤进行RNA测序,比较差异表达基因和通路,并与已发表的银屑病小鼠模型和人类数据进行比较。
评估铁死亡抑制剂和靶向IL-12/IL-23/TNF-α的抗体对银屑病样表型的治疗效果
在K14/Gpx4小鼠中给予Lip-1或抗IL-12p40、IL-23p19、TNF-α抗体,观察疾病严重程度和炎症标志物的变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 真皮细胞基础培养基 | ATCC | PCS-200-030 |
| 角质形成细胞生长因子试剂盒 | ATCC | PCS-200-040 | |
| 药物处理 | RSL3 | Sigma-Aldrich | -- |
| Erastin | Sigma-Aldrich | -- | |
| Ferrostatin-1 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Liproxstatin-1 | Cayman Chemical | -- | |
| 黄芩素 | Tocris | -- | |
| 细胞活力检测 | CellTiter 96 Aqueous细胞增殖检测试剂盒 | Promega | G3582 |
| 增殖检测 | BrdU细胞增殖试剂盒 | Millipore | 2750 |
| 细胞分离 | 泛T细胞分离试剂盒II | Miltenyi Biotec | 30-095-1 |
| 中性粒细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-097-658 | |
| 细胞迁移实验 | 6.5mm聚碳酸酯膜Transwell小室,5μm孔径 | Corning | 3421 |
| 流式细胞术 | 胶原酶D | Sigma-Aldrich | C0130 |
| 透明质酸酶 | Sigma-Aldrich | H3884 | |
| 脱氧核糖核酸酶 | Sigma-Aldrich | DN25 | |
| 可固定活力染料eFluor 780 | Invitrogen | 65-0865-18 | |
| Fix & Perm细胞透化试剂盒 | Invitrogen | GAS002 | |
| BD LSRFortessa X20流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 细胞分选 | Aurora CS细胞分选仪 | Cytek Biosciences | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596018 |
| RNeasy纤维组织迷你试剂盒 | QIAGEN | 74704 | |
| 逆转录 | QuantiTect逆转录试剂盒 | QIAGEN | 205314 |
| RT-qPCR | TaqMan Fast Advance预混液 | Applied Biosystems | 44-445-57 |
| Fast SYBRGreen预混液 | Applied Biosystems | 4385612 | |
| StepOnePlus实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 免疫荧光 | C11-BODIPY (581/591) 荧光探针 | Thermo Fisher Scientific | D3861 |
| Click-iT Plus TUNEL检测试剂盒 | Invitrogen | C10618 | |
| Gelvatol封片剂 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 尼康A1共聚焦显微镜 | Nikon | -- | |
| Western blot | T-PER组织蛋白提取试剂 | Thermo Fisher Scientific | 78510 |
| 蛋白酶抑制剂 | Thermo Fisher Scientific | 78425 | |
| 磷酸酶抑制剂 | Cell Signaling | 5870S | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 | |
| Odyssey封闭液 | LI-COR | 927-70001 | |
| Odyssey扫描仪 | LI-COR | -- | |
| ELISA | 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | BD Biosciences | 555240 |
| 微量采血管 | BD Biosciences | 365967 | |
| LC-MS | Luna 3 μm硅胶色谱柱(2) 100 Å | Phenomenex | -- |
| Orbitrap Fusion Lumos Tribrid质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| MALDI-MS成像 | 1,5-二氨基萘基质 | Fisher Scientific | -- |
| Ultraflextreme质谱仪 | Bruker Daltonics | -- | |
| SIMS成像 | J105二次离子质谱仪 | Ionoptika | -- |
| 动物模型 | 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | T5648 |
| 玉米油 | Sigma-Aldrich | C8267 | |
| 抗CD4抗体 | Bio X Cell | -- | |
| 抗CD8a抗体 | Bio X Cell | -- | |
| 抗IL-12p40抗体 | Bio X Cell | -- | |
| 抗IL-23p19抗体 | Bio X Cell | -- | |
| 抗TNF-α抗体 | Bio X Cell | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 氧化脂质组学分析 | 患者样本类型,LC-MS检测条件 阅读提示:Methods: LC-MS/MS analysis of lipid mediators |
| 细胞培养与处理 | HEKa细胞培养条件,药物处理浓度和时间 阅读提示:Methods: Primary cells and cell lines, Cell viability assay, Proliferation assay |
| 小鼠模型诱导 | K14/Gpx4小鼠品系,他莫昔芬给药剂量和方案 阅读提示:Methods: Animal models |
| 治疗干预 | 抗体或Lip-1的给药剂量、途径和时间 阅读提示:Methods: Animal models |
| 转录组分析 | RNA提取方法、测序平台和数据分析流程 阅读提示:Methods: RNA sequencing |