验证MAPK4在PCa细胞中的表达和功能
确定MAPK4在PCa细胞系中的表达水平及其对细胞生长的影响。
检测多种PCa细胞系中MAPK4表达;通过shRNA敲低和过表达MAPK4,检测细胞增殖、锚定非依赖性生长和去势抵抗条件下的生长。
MAPK4 promotes prostate cancer by concerted activation of androgen receptor and AKT
包含体外细胞增殖/软琼脂实验、蛋白质稳定性/泛素化实验、机制互作实验、异种移植瘤模型及人类CRPC组织表达分析等多个独立证据层级。
LNCaP细胞 LAPC4细胞 22Rv1细胞 VCaP细胞 SCID小鼠异种移植模型
MAPK4敲低或过表达对GATA2/AR表达和PCa细胞增殖的影响 GATA2蛋白稳定性及泛素化实验(CHX和MG132处理) MAPK4突变体(D254A、S186A)对AKT和GATA2/AR信号的不同影响 AKT抑制剂MK2206处理对MAPK4诱导的细胞生长的影响 异种移植实验中Dox诱导的MAPK4敲低或过表达对肿瘤生长的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定MAPK4在PCa细胞系中的表达水平及其对细胞生长的影响。
检测多种PCa细胞系中MAPK4表达;通过shRNA敲低和过表达MAPK4,检测细胞增殖、锚定非依赖性生长和去势抵抗条件下的生长。
评估MAPK4是否调控GATA2和AR的表达及活性。
通过Western blot和qPCR检测MAPK4敲低或过表达后GATA2、AR/AR-V7及AR靶基因PSA和TMPRSS2的表达;通过PSA启动子报告或PSA mRNA水平检测AR活性。
确定GATA2和AR在MAPK4促生长中的作用。
在MAPK4过表达细胞中敲低AR或GATA2,检测细胞增殖和AR靶基因表达;在MAPK4敲低细胞中过表达AR或GATA2,观察对细胞生长的恢复。
阐明MAPK4是否通过影响GATA2蛋白稳定性来调控其水平。
使用CHX追踪GATA2蛋白半衰期;用MG132处理检测泛素化变化;通过泛素化实验和co-IP、BiFC验证MAPK4与GATA2的相互作用。
确定AKT激活是否是MAPK4促PCa生长所必需的。
使用MAPK4突变体(D254A, S186A)和AKT抑制剂MK2206,检测对细胞增殖和锚定非依赖性生长的影响;通过AKT1-DD突变体过表达进行功能挽救。
确定同时激活AKT和GATA2是否能替代MAPK4促进PCa生长和去势抵抗。
在LNCaP细胞中共表达GATA2和AKT1-DD,在FBS、CSS和CSS+R1881条件下检测细胞增殖;在MAPK4敲低VCaP细胞中单独过表达GATA2或AKT1-DD,观察对生长的恢复。
验证MAPK4在体内对PCa肿瘤生长和去势抵抗的促进作用。
将LNCaP-iMAPK4、LAPC4-ishMAPK4、22Rv1-ishMAPK4及其对照细胞皮下注射到完整或去势SCID小鼠,通过Dox诱导MAPK4表达或敲低,测量肿瘤体积和重量,并用Western blot分析肿瘤组织中相关蛋白表达。
评估MAPK4表达与人类CRPC中AR激活的相关性。
利用GEO GSE77930数据集的171个mCRPC肿瘤基因表达数据,计算MAPK4表达与AR靶基因(KLK2, PSA/KLK3)及AR签名(Nelson和TCGA)的Pearson相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | 抗HA抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-805 |
| 抗Myc抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-40 | |
| 抗GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-32233 | |
| 抗AR抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-816 | |
| 免疫沉淀 | 蛋白A琼脂糖 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2001 |
| 蛋白G PLUS琼脂糖 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2002 | |
| Western blot | 抗MAPK4抗体 | Abgent | AP7298b |
| 抗MAPK4抗体 | MilliporeSigma | HPA007461 | |
| 抗MAPK4抗体 | Origene | TA505872 | |
| 抗GATA2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-9008 | |
| 抗GATA2抗体 | ABclonal | A0677 | |
| 抗磷酸化AKT T308抗体 | Cell Signaling Technology | 4056 | |
| 抗磷酸化AKT S473抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 2920 | |
| 抗磷酸化GSK3β S9抗体 | Cell Signaling Technology | 9558 | |
| 免疫沉淀 | EZview红抗FLAG M2亲和凝胶 | MilliporeSigma | F2426 |
| 蛋白稳定性实验 | MG132 | MilliporeSigma | M7449 |
| 细胞增殖实验 | MTT | MilliporeSigma | -- |
| AR激活实验 | R1881 | MilliporeSigma | R0908 |
| 细胞增殖实验 | BrdU | MilliporeSigma | B9285 |
| Western blot | 抗β-肌动蛋白抗体 | MilliporeSigma | A1978 |
| BrdU实验 | 抗BrdU抗体 | MilliporeSigma | B8434 |
| Western blot | 抗FLAG抗体 | MilliporeSigma | F3165 |
| 药物处理 | 恩杂鲁胺 | Selleckchem | S1250 |
| MK2206 | Selleckchem | S1078 | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| IMDM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Hyclone或Invitrogen | -- | |
| 活性炭剥离胎牛血清 | Hyclone | SH3007103 | |
| 转染 | GenMute siRNA转染试剂 | SignaGen Laboratories | SL100568 |
| LipoD293 DNA转染试剂 | SignaGen Laboratories | SL100668 | |
| 慢病毒包装 | 慢病毒包装试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | TLP5914 |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | 23225 |
| BrdU实验 | Dylight 488山羊抗小鼠二抗 | Invitrogen | 35502 |
| RNA提取 | Quick-RNA MiniPrep试剂盒 | Zymo Research | R1054 |
| 反转录 | amfiRivert cDNA合成预混液 | GenDEPOT | R5600 |
| qPCR | PerfeCTa SYBR Green FastMix试剂 | Quanta Biosciences | 95072 |
| LightCycler 480实时荧光定量PCR仪 | Roche Applied Science | -- | |
| 异种移植 | 基质胶 | Corning | 354234 |
| 转染 | Lipofectamine? | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源;培养基类型(RPMI-1640, DMEM, IMDM)及FBS浓度;LAPC4需添加R1881;CSS浓度及MDV3100浓度 阅读提示:Methods - Cell culture |
| 基因敲低和过表达 | shRNA序列和克隆载体(pGIPZ, pLKO-Tet-On, pInducer10);过表达载体(pCDH, pInducer20-YF);Dox浓度及处理时间 阅读提示:Methods - Cell culture, Plasmids, siRNAs and shRNAs |
| Western blot | 抗体列表、稀释比例;RIPA缓冲液;BCA定量;上样量(5-20 μg) 阅读提示:Methods - Western blot, Reagents and antibodies |
| 增殖实验(MTT、BrdU) | 细胞密度、处理时间;Dox浓度;BrdU浓度和孵育时间;MTT浓度和孵育时间;测量波长(590nm) 阅读提示:Methods - Proliferation assay, BrdU assay |
| 软琼脂实验 | 低熔点琼脂浓度(0.35%);底层琼脂浓度(1%);Dox浓度;集落计数时间(3-4周) 阅读提示:Methods - Soft agar colony formation assay |
| 异种移植实验 | 小鼠品系、年龄、性别;细胞注射量;Dox浓度(0.2或4 mg/mL);Matrigel比例;肿瘤测量频率 阅读提示:Methods - Xenograft tumor models |
| 人类数据关联分析 | 数据集GSE77930;样本选择标准(非神经内分泌CRPC,n=144);计算方法(Pearson相关) 阅读提示:Methods - Analysis of human tumor molecular data sets |