鉴定PT及其细胞毒性
从植物提取物中筛选并鉴定具有抗肿瘤增殖活性的化合物。
构建包含422种植物提取物的文库,用K562细胞筛选细胞毒性,通过HPLC分馏和细胞毒性筛选鉴定活性成分,最终确定PT为最丰富和有效的活性成分。
Petasin potently inhibits mitochondrial complex I-based metabolism that supports tumor growth and metastasis
包含体外细胞系筛选、功能验证(NDI1、Rho-0细胞)、代谢组学、蛋白质组学、多种体内模型(同系和异种移植)及转移模型。
B16F10小鼠黑色素瘤细胞 A2058人黑色素瘤细胞 NB-1人神经母细胞瘤细胞 Jyg-MCB小鼠转移性乳腺癌细胞
PT处理浓度:3 μM(体外) PT给药剂量:50 mg/kg,腹腔注射(体内) B16F10黑色素瘤原位模型(同系) A2058和NB-1异种移植模型 Jyg-MCB自发转移模型
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从植物提取物中筛选并鉴定具有抗肿瘤增殖活性的化合物。
构建包含422种植物提取物的文库,用K562细胞筛选细胞毒性,通过HPLC分馏和细胞毒性筛选鉴定活性成分,最终确定PT为最丰富和有效的活性成分。
评估PT对多种肿瘤和非肿瘤细胞系的细胞毒性作用。
用PT处理多种细胞系,测定细胞活力、细胞周期、形态变化、代谢改变(葡萄糖、乳酸、pH)、ATP/ADP比和细胞死亡方式。
验证PT对ETCC1的抑制活性,并比较其与二甲双胍和苯乙双胍的效力。
检测PT对线粒体各复合物活性的影响,测定ETCC1抑制的IC50,并通过NDI1过表达和Rho-0细胞验证ETCC1抑制是PT细胞毒性的机制。
揭示PT对肿瘤和正常细胞代谢的影响。
用PT处理B16F10和ASF 4-1细胞,进行代谢组学分析,鉴定显著改变的代谢物和通路。
评估PT对肿瘤细胞转录组的影响,特别是ATF4信号通路。
用PT处理A2058细胞,进行cDNA微阵列分析,鉴定差异表达基因,并进行通路富集分析。
分析PT对癌蛋白表达和糖基化的影响。
用PT处理多种细胞系,进行蛋白质组学分析和免疫印迹,检测癌蛋白、糖基化蛋白和信号通路(如AMPK/mTOR)。
评估PT在多种小鼠模型中的抗肿瘤效果和安全性。
在B16F10原位同系模型、A2058和NB-1异种移植模型、Jyg-MCB自发转移模型中给予PT(50 mg/kg,i.p.),监测肿瘤生长、转移灶、体重和正常器官毒性。
评估PT对肿瘤细胞迁移、侵袭和粘附的影响。
进行划痕愈合实验、Matrigel侵袭实验、细胞粘附实验和粘着斑分析,检测PT处理对细胞运动性和侵袭能力的影响。
评估PT对肺转移和淋巴结转移的抑制作用。
使用B16F10肺定植模型和Jyg-MCB自发转移模型,PT给药后计数肺转移灶和淋巴结重量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Wako | -- |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | -- | |
| EMEM培养基 | Wako | -- | |
| RPMI1640培养基 | Wako | -- | |
| 乳腺上皮细胞基础培养基 | Lonza | CC-3151 | |
| 乳腺上皮细胞生长培养基试剂盒 | Lonza | CC-3150 | |
| MEM非必需氨基酸溶液(100×) | Wako | 139-15651 | |
| MEM必需氨基酸溶液(50×) | Wako | 132-15641 | |
| L-天冬氨酸 | Sigma-Aldrich | A9256 | |
| 葡萄糖 | Sigma-Aldrich | G8644 | |
| 蛋白质印迹 | DC蛋白定量试剂盒 | Bio-Rad | -- |
| PVDF膜 | EMD Millipore | Immobilon-P | |
| PVDF封闭试剂 | TOYOBO | -- | |
| HRP标记抗小鼠IgG | Cell Signaling Technology | -- | |
| HRP标记抗兔IgG | Cell Signaling Technology | -- | |
| Luminata Forte Western HRP底物 | EMD Millipore | -- | |
| 抗β-肌动蛋白小鼠单克隆抗体 | Sigma-Aldrich | A5316 | |
| RT-qPCR | NucleoSpin miRNA提取试剂盒 | MACHEREY-NAGEL | -- |
| Agilent 2100生物分析仪 | Agilent | -- | |
| PrimeScript逆转录试剂盒 | Takara | -- | |
| Universal SYBR Select预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| Takara Thermal Cycler Dice实时荧光定量PCR系统II | Takara | -- | |
| 组织学 | Tissue-Tek伊红 | Sakura Finetek Japan | 8659 |
| 免疫活性抗原修复缓冲液 | Matsunami Glass | IA6500, IA9500 | |
| ImmPRESS HRP马抗兔IgG聚合物检测试剂盒 | Vector Laboratories | MP-7401 | |
| ImmPACT DAB底物 | Vector Laboratories | SK-4105 | |
| 显微镜BZ-X700 | KEYENCE | -- | |
| 免疫细胞化学 | 抗p-FAKY397抗体 | Cell Signaling Technology | 8556 |
| Alexa Fluor 488标记抗兔抗体 | Life Technologies | -- | |
| Alexa Fluor 568标记鬼笔环肽 | Life Technologies | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| Lab Vision PermaFluor封片剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 显微镜 | 共聚焦显微镜LSM-710 | Carl Zeiss | -- |
| 软件分析 | ImageJ | NIH | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系和培养基的选择(DMEM, EMEM, RPMI1640等),血清浓度,细胞来源 阅读提示:Methods: Cell lines and culture |
| 体外细胞毒性 | PT浓度、处理时间、细胞活力测定方法 阅读提示:Figure 1 and Figure 2 legends |
| 线粒体复合物I活性测定 | PT浓度、线粒体来源、ETCC1活性测定方法 阅读提示:Figure 3 legend and Methods: Mitochondrial ETC activity assays |
| 代谢组学分析 | 细胞系、PT浓度、处理时间、代谢物提取方法、分析平台 阅读提示:Figure 4 legend and Supplemental Methods |
| 体内肿瘤模型 | PT剂量、给药途径、给药频率、模型类型(B16F10, A2058, NB-1, Jyg-MCB) 阅读提示:Figure 8 legend and Methods: Animal experiments |
| 转移模型 | 细胞系、PT剂量、给药途径、给药频率、转移评估方法 阅读提示:Figure 10 legend and Methods: Animal experiments |
| 细胞迁移和侵袭 | PT浓度、处理时间、实验方法(划痕愈合、侵袭、粘附) 阅读提示:Figure 9 legend and Methods: Scratch wound healing assay, Matrigel invasion assay, Cell attachment assay |