建立可诱导Ngly1敲除小鼠模型
模拟NGLY1缺陷的神经退行性疾病并评估其表型
通过他莫昔芬诱导Ngly1fl/flUBC-cre/ERT2小鼠实现全身体敲除,评估体重、寿命、运动功能和神经病理。
The STING pathway drives noninflammatory neurodegeneration in NGLY1 deficiency
包含可诱导全身敲除小鼠模型、细胞类型特异性敲除、遗传挽救(Sting1敲除)、药理学抑制、snRNA-seq、患者样本等多个独立证据层级,并进行功能与机制验证。
可诱导全身Ngly1敲除小鼠(iNgly1−/−) C57BL/6-JF1品系Ngly1−/−小鼠 NGLY1缺陷患者小脑组织 SK-N-SH神经母细胞瘤细胞系
iNgly1−/−小鼠通过他莫昔芬诱导Ngly1敲除,出生后第7天开始连续5天给药,断奶后再次给药5天 Sting1敲除(iNgly1−/−Sting1−/−)挽救浦肯野细胞丢失、运动功能和寿命 STING抑制剂VS-X4口服给药,剂量10 mg/kg,每周三次,持续3个月 snRNA-seq分析使用8周龄小鼠,每种基因型2只 行为学评分采用4项指标(后肢紧握、边缘行走、步态、脊柱后凸)的12分制
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟NGLY1缺陷的神经退行性疾病并评估其表型
通过他莫昔芬诱导Ngly1fl/flUBC-cre/ERT2小鼠实现全身体敲除,评估体重、寿命、运动功能和神经病理。
确定NGLY1缺失导致的小脑浦肯野细胞丢失及其机制
通过IHC染色检测浦肯野细胞标记物calbindin,cleaved caspase-3标记凋亡细胞,COX IV标记线粒体。
验证STING通路在疾病中的因果作用
将Ngly1fl/flUBC-cre/ERT2与Sting1−/−杂交,诱导敲除后评估寿命、运动功能、浦肯野细胞数量和凋亡。
揭示细胞类型特异性分子变化和STING依赖的效应
对8周龄Ngly1fl/fl、iNgly1−/−和iNgly1−/−Sting1−/−小鼠小脑进行单核RNA测序,分析差异表达基因和细胞亚群。
验证STING拮抗剂能否缓解疾病表型
使用口服STING抑制剂VS-X4治疗iNgly1−/−小鼠,评估运动功能、发病时间和浦肯野细胞数量。
确定STING激活的上游机制
通过cGAS免疫沉淀和qPCR检测cGAS结合的mtDNA,并用药物降低胆固醇水平评估对STING通路的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型诱导 | 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | T5648 |
| 玉米油 | Sigma-Aldrich | C8267 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 药物处理 | 辛伐他汀 | MedChemExpress | HY-17502 |
| 甲基-β-环糊精 | MedChemExpress | HY-101461 | |
| STING激活 | diABZI | -- | -- |
| 免疫组织化学 | 抗钙结合蛋白D-28K抗体 | Sigma-Aldrich | C9848 |
| 抗Iba1/AIF1抗体 | MilliporeSigma | MABN92 | |
| Cleaved Caspase-3 (Asp175) 抗体 | Cell Signaling | 9661 | |
| 抗COX IV抗体 | Abcam | ab16056 | |
| PSMB2抗体 | Abcam | ab236752 | |
| TAX1BP1多克隆抗体 | Proteintech | 14424-1-AP | |
| HMGCR抗体 | LifeSpan BioSciences | LS-B16059 | |
| 山羊抗兔IgG二抗,Alexa Fluor Plus 488 | Thermo Fisher Scientific | A32731 | |
| 驴抗小鼠IgG二抗,Alexa Fluor 546 | Thermo Fisher Scientific | A10036 | |
| 驴抗小鼠IgG二抗,Alexa Fluor 647 | Thermo Fisher Scientific | A-31571 | |
| DAPI | -- | -- | |
| 抗NGLY1抗体 | Atlas Antibodies | HPA036825 | |
| Western blot | BCA蛋白定量 | -- | -- |
| SDS-PAGE凝胶电泳 | -- | -- | |
| 硝酸纤维素膜 | -- | -- | |
| HRP标记二抗 | Bio-Rad | -- | |
| SuperSignal West Pico化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗HMGB1抗体 | Abcam | ab18256 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling | 2118 | |
| 免疫沉淀 | cGAS抗体 | Abcam | ab252416 |
| Protein G磁珠 | Thermo Fisher Scientific | 10004D | |
| DNA提取 | QIAamp DNA小提试剂盒 | Qiagen | 56304 |
| RNA提取 | TRI试剂 | Sigma-Aldrich | -- |
| cDNA合成 | iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad | -- |
| qPCR | iTaq Universal SYBR Green Supermix | Bio-Rad | -- |
| snRNA-seq | Chromium单细胞5'试剂盒 | 10x Genomics | -- |
| Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| Nuclei EZ裂解缓冲液 | MilliporeSigma | EZ PREP NUC-101 | |
| 牛血清白蛋白 | Thermo Fisher Scientific | AM2618 | |
| RNA酶抑制剂 | Thermo Fisher Scientific | AM2694 | |
| Flowmi细胞过滤器 | Bel-Art | H13680-0040 | |
| 动物实验 | VS-X4 | Spring Bank Pharmaceuticals | -- |
| 胆固醇检测 | 胆固醇/胆固醇酯-Glo检测试剂盒 | Promega | J3190 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型诱导 | 他莫昔芬诱导方案(剂量、时间点)、对照组、小鼠品系 阅读提示:Materials and methods - Animals |
| 行为学评估 | 评分系统、评估时间点 阅读提示:Materials and methods - Mouse motor function tests |
| 组织病理和IHC | 抗体、稀释度、固定方法 阅读提示:Materials and methods - Histopathology and immunohistochemistry |
| snRNA-seq | 小鼠周龄、样本量、测序平台、分析软件和参数 阅读提示:Materials and methods - snRNA-seq and data analysis |
| 药理学抑制STING | VS-X4剂量、给药方式、治疗周期、对照组 阅读提示:Materials and methods - Mouse treatment |
| STING激活机制 | cGAS IP条件、qPCR引物、胆固醇药物浓度和处理时间 阅读提示:Materials and methods - Immunoprecipitation of endogenous cGAS and DNA analysis; Figure S5 legend |