鉴定HUWE1为AIM2相互作用蛋白
寻找AIM2炎症小体激活的调控因子。
通过AIM2免疫沉淀-质谱(IP-MS)分析F. novicida感染的WT和Aim2-/- BMDMs,鉴定与AIM2特异性相互作用的蛋白,发现E3泛素连接酶HUWE1。并通过共免疫沉淀(co-IP)验证HUWE1与AIM2、NLRP3、NLRC4的相互作用,以及它们的结构域(HIN/NACHT)和HUWE1的BH3结构域(F4片段)的作用。
HUWE1 mediates inflammasome activation and promotes host defense against bacterial infection
包含细胞系(HEK293T)异位表达、BMDMs基因敲除与抑制剂处理、体内小鼠感染模型等多层级验证,且涉及功能验证(caspase-1激活、IL-1β释放、细胞死亡)和机制验证(K27泛素化、ASC斑点、寡聚化)。
小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) HEK293T细胞 人THP-1细胞 人外周血单个核细胞(PBMCs)
HUWE1与AIM2、NLRP3、NLRC4的相互作用(通过HIN/NACHT结构域) HUWE1介导的K27连接多聚泛素化(受体K23/K64/等位点) ASC斑点形成及caspase-1 p33相互作用 体内感染模型(沙门氏菌、弗朗西斯菌、鲍曼不动杆菌)中细菌载量及caspase-1激活
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
寻找AIM2炎症小体激活的调控因子。
通过AIM2免疫沉淀-质谱(IP-MS)分析F. novicida感染的WT和Aim2-/- BMDMs,鉴定与AIM2特异性相互作用的蛋白,发现E3泛素连接酶HUWE1。并通过共免疫沉淀(co-IP)验证HUWE1与AIM2、NLRP3、NLRC4的相互作用,以及它们的结构域(HIN/NACHT)和HUWE1的BH3结构域(F4片段)的作用。
确定HUWE1是否调节NLRP3、AIM2和NLRC4炎症小体的激活。
使用Huwe1条件敲除BMDMs(CreER系统或Lyz2-Cre系统)和HUWE1抑制剂BI8622处理,检测不同刺激(LPS+ATP、dsDNA、F. novicida、Salmonella、Listeria)后caspase-1活化(p20)、IL-1β释放和细胞死亡。同时检测TNF和IL-6产生及Il1a/Il1b表达以排除转录效应。
确定HUWE1是否催化NLRP3、AIM2和NLRC4的K27连接多聚泛素化,并鉴定关键赖氨酸残基。
在HEK293T细胞中共转染HUWE1、受体蛋白及HA标记的泛素(WT和不同连接突变体),通过泛素化分析检测受体蛋白的泛素化形式。使用K27R突变泛素验证K27特异性。通过点突变受体蛋白(AIM2的K23R、K64R等;NLRP3的K21R/K22R/K24R;NLRC4的K61R、K71R)鉴定关键赖氨酸位点。
确认HUWE1的E3连接酶活性及其介导的泛素化对炎症小体激活的必需性。
在HEK293T细胞中重构炎症小体(NLRP3/NLRC4/AIM2 + ASC + pro-caspase-1),共转染HUWE1或其催化死亡突变体C4341A,或共转染K27泛素,然后刺激(nigericin/Salmonella/dsDNA)检测caspase-1活化。同时使用受体泛素化位点突变体(如NLRP3 K21R/K22R/K24R)检测其对caspase-1活化的影响。
在生理条件下验证HUWE1对炎症小体受体泛素化、寡聚化及ASC斑点形成的作用。
使用Lyz2-Cre Huwe1+/Y和Huwe1fl/Y BMDMs,刺激后通过内源性共免疫沉淀检测HUWE1与受体的相互作用及受体的泛素化水平;通过DSS交联检测NLRP3寡聚化;通过免疫荧光观察ASC斑点形成;通过共免疫沉淀检测ASC与caspase-1 p33的相互作用。
确定HUWE1在宿主抵抗细菌感染中的作用。
使用他莫昔芬诱导的Huwe1敲除小鼠,分别感染沙门氏菌(腹腔)、弗朗西斯菌(皮下)、鲍曼不动杆菌(鼻内),监测体重变化、细菌载量、组织病理(H&E染色)及caspase-1激活和IL-1β产生。同时给予HUWE1抑制剂BI8622验证。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | BI8622 | MedChemExpress | HY-120929 |
| 细胞培养 | 4-羟基他莫昔芬 | -- | 100 nM |
| Western blot | anti-V5 | Cell Signaling Technology | 13202 |
| anti-AIM2 | Cell Signaling Technology | 13095 | |
| anti-caspase-1 | AdipoGen | AG-20B-0042 | |
| anti-HUWE1 | Lifespan Biosciences | LS-B1359 | |
| anti-NLRP3 | AdipoGen | AG-20B-0014 | |
| anti-NLRC4 | Lifespan Biosciences | LS-C148271 | |
| anti-ASC | AdipoGen | AG-25B-0006 | |
| anti-HA | Santa Cruz Biotechnology | SC-805 | |
| anti-FLAG | MilliporeSigma | F3165 | |
| anti-ubiquitin | MilliporeSigma | 04-263 | |
| anti-Myc | Cell Signaling Technology | 2278 | |
| anti-GAPDH | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| 免疫荧光 | anti-TGN46 | Abcam | ab2809 |
| 封片剂 | Vector Laboratories | H-1200 | |
| 显微镜 | 蔡司LSM880共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| 细胞培养 | L929细胞条件培养基DMEM/F-12 | -- | -- |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 免疫沉淀 | 蛋白A/G琼脂糖珠 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2003 |
| anti-HUWE1 (Abcam) | Abcam | ab70161 | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| M-MLV逆转录酶 | Promega | -- | |
| ELISA | ELISA MAX标准试剂盒(小鼠IL-1β) | BioLegend | 432601 |
| ELISA MAX标准试剂盒(小鼠IL-6) | BioLegend | 431301 | |
| ELISA MAX标准试剂盒(小鼠TNF) | BioLegend | 430901 | |
| ELISA MAX标准试剂盒(人IL-1β) | BioLegend | 437004 | |
| ELISA MAX标准试剂盒(人IL-6) | BioLegend | 430504 | |
| ELISA MAX标准试剂盒(人TNF) | BioLegend | 430204 | |
| 细胞培养 | 聚凝胺 | -- | -- |
| 嘌呤霉素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 基因敲除小鼠模型 | Huwe1fl/fl-CreER和Huwe1+/+-CreER小鼠的他莫昔芬给药方案(剂量、时间)、感染细菌种类和剂量(沙门氏菌腹腔5000 CFU,F. novicida皮下1.5×10^5 CFU,A. baumannii鼻内5×10^8 CFU)、感染时间点及组织采集 阅读提示:Methods部分'Mice'和'Bacterial infection of mice' |
| BMDMs制备与基因敲除 | BMDMs培养条件(L929条件培养基、FBS浓度、培养天数)、4-OHT浓度(100 nM)及处理时间(5天) 阅读提示:Methods部分'Preparation of BMDMs, stimulation, and bacterial infection' |
| 炎症小体激活刺激条件 | 各刺激物浓度和处理时间:LPS(500 ng/mL, 4h)+ATP(5 mM, 50 min)、F. novicida(200 MOI, 16h)、Salmonella(3 MOI, 2h)、Listeria(50 MOI, 3h)、dsDNA(0.5 μg, 8h)等 阅读提示:Figure 2和3图注 |
| 泛素化分析 | 转染质粒(HA-ubiquitin WT或K27R等)、MG132浓度、裂解和变性条件(SDS boiling)、IP抗体 阅读提示:Methods部分'Ubiquitination analysis' |
| ASC斑点形成检测 | 免疫荧光染色条件(抗体浓度、透化、共聚焦显微镜)、刺激条件(LPS+ATP、dsDNA、F. novicida、Salmonella) 阅读提示:Methods部分'Immunofluorescence staining and microscopy'及Figure 8C图注 |