体外剪切应力下Nck1/2对NF-κB活化的影响
验证Nck1和Nck2是否参与剪切应力诱导的内皮活化
通过siRNA或CRISPR/Cas9敲低或敲除HAECs中的Nck1/2,施加急性剪切应力或振荡剪切应力,检测NF-κB磷酸化、核转位及VCAM-1/ICAM-1表达
Selective role of Nck1 in atherogenic inflammation and plaque formation
包含体外细胞实验(siRNA/CRISPR敲除、结构域突变)、动物模型(PCL、HFD饮食诱导)及人样本验证,并明确机制验证。
人主动脉内皮细胞(HAECs) 小鼠主动脉内皮细胞(MAECs) 部分颈动脉结扎(PCL)小鼠模型 高脂饮食诱导的ApoE敲除小鼠动脉粥样硬化模型
Nck1/2敲低效率(siRNA/CRISPR) 剪切应力类型与时间(急性层流12 dynes/cm2,OSC ±5 dynes/cm2,18小时) 小鼠品系与基因型(iEC-Control、Nck1-KO、iEC-Nck2-KO、iEC-DKO,均ApoE-/-背景) 高脂饮食时间(12周) PCL术后分析时间(48小时、7天) 骨移植实验中辐射剂量(5.25 Gy×2)与细胞数量(2×10^6)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Nck1和Nck2是否参与剪切应力诱导的内皮活化
通过siRNA或CRISPR/Cas9敲低或敲除HAECs中的Nck1/2,施加急性剪切应力或振荡剪切应力,检测NF-κB磷酸化、核转位及VCAM-1/ICAM-1表达
确定Nck1和Nck2在剪切应力诱导内皮活化中的差异作用
使用Nck1或Nck2特异性siRNA/shRNA敲低,以及从Nck1-KO或iEC-Nck2-KO小鼠分离的MAECs,检测剪切应力下NF-κB激活和炎症基因表达
评估Nck1缺失对体内扰动血流诱导的内皮活化和炎症的影响
对iEC-Control、Nck1-KO、iEC-Nck2-KO和iEC-DKO小鼠实施部分颈动脉结扎(PCL),术后48小时检测内皮mRNA表达,7天后检测炎症蛋白和巨噬细胞浸润
验证Nck1缺失对自发动脉粥样硬化斑块形成的影响
iEC-Control、Nck1-KO、iEC-Nck2-KO和iEC-DKO小鼠喂食高脂饮食12周,分析主动脉、颈动脉窦、头臂动脉的斑块面积、巨噬细胞和SMA含量
确定血管壁Nck1和造血细胞Nck1对动脉粥样硬化的相对贡献
将Nck1-WT或Nck1-KO小鼠的骨髓移植到辐照的Nck1-WT或Nck1-KO受体中,然后喂食高脂饮食12周,评估动脉粥样硬化病变
确定Nck1中介导剪切应力信号的关键结构域
在Nck1/2-DKO细胞中重新表达Nck1、Nck2或Nck1/Nck2嵌合体及Nck1点突变体,检测OSS诱导的NF-κB活化和VCAM-1表达
验证IRAK-1是否作为Nck1特异性结合蛋白并介导剪切应力诱导的NF-κB活化
通过免疫共沉淀检测剪切应力下Nck1与IRAK-1的相互作用;检测Nck1缺失对IRAK-1磷酸化的影响;在HAECs中敲低IRAK-1观察功能效应
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | MCDB131培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 牛脑提取物 | -- | -- | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 表达GFP或GFP-2A-iCre的腺病毒 | Vector Biolabs | -- | |
| 基因敲除 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 靶向Nck1的SMARTpool siRNA(L-006354) | IDT | -- | |
| 靶向Nck2的SMARTpool siRNA(L-019547) | IDT | -- | |
| 慢病毒载体pLV-(shRNA)-mCherry:T2A:Puro-U6 | VectorBuilder | -- | |
| pMD2.G质粒(12259) | Addgene | -- | |
| pRSV-Rev质粒(112253) | Addgene | -- | |
| pMDLg/pRRE质粒(112251) | Addgene | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | Bio-Rad | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| qRT-PCR | iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad | 1708890 |
| SYBR Green预混液 | Bio-Rad | 1708882 | |
| 动物实验 | 他莫昔芬 | MilliporeSigma | -- |
| 硫酸新霉素 | MilliporeSigma | -- | |
| 组织处理 | 甲醛 | -- | -- |
| 细胞因子检测 | LEGENDplex多因子检测试剂盒 | BioLegend | 740446 |
| 组织学 | 柠檬酸钠缓冲液 | Vector Biolabs | -- |
| 图像分析 | ImageJ软件 | NIH | -- |
| NIS Elements软件 | Nikon | -- | |
| 统计 | GraphPad Prism软件 | -- | -- |
| 动物手术 | VEV3100多普勒超声 | VisualSonics | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外剪切应力实验 | 剪切应力类型和参数:急性剪切应力12 dynes/cm2,时间0-45分钟;振荡剪切应力±5 dynes/cm2叠加1 dyne/cm2正向流,18小时;层流10 dynes/cm2,18小时 阅读提示:Methods 'Induction of acute-onset and chronic shear stress in vitro' |
| Nck1/2敲低/敲除 | siRNA敲低效率:Nck1 70-75%,Nck2 84-85%;shRNA敲低效率:Nck1 100%,Nck2 90%;CRISPR/Cas9敲除效率 阅读提示:Methods 'Cell culture, plasmids, and RNA interference' |
| 小鼠模型 | 小鼠基因型:iEC-Control (VE-cadherinCreERT2tg/?, ApoE-/-), Nck1-KO (Nck1-/-, ApoE-/-), iEC-Nck2-KO (Nck2fl/fl, ApoE-/-), iEC-DKO (Nck2fl/fl, Nck1-/-, ApoE-/-);性别:雄性;年龄:8-10周龄 阅读提示:Methods 'Mouse experiments' |
| 他莫昔芬诱导 | 剂量:1 mg/kg,连续5天腹腔注射 阅读提示:Methods 'Mouse experiments' |
| 部分颈动脉结扎 (PCL) 模型 | 结扎左颈外动脉、颈内动脉和枕动脉;分析时间:48小时(mRNA)和7天(组织学) 阅读提示:Methods 'Mouse experiments' |
| 高脂饮食诱导动脉粥样硬化 | 饮食类型:TD 88137(Harlan-Teklad);时间:12周 阅读提示:Methods 'Mouse experiments' |
| 骨髓移植 | 辐射剂量:5.25 Gy×2次;骨髓细胞数:2×10^6;恢复时间:4周后开始HFD 阅读提示:Methods 'Mouse experiments' |
| IRAK-1敲低 | siRNA SMARTPool处理浓度和效率 阅读提示:Methods 'Cell culture, plasmids, and RNA interference' |