血浆抗体结合和中和活性分析
评估老年人与年轻人接种加强疫苗后血浆对SARS-CoV-2原始株及变异株的抗体结合和中和能力。
采用ELISA检测血浆IgG对WT和Omicron BA.4/5 RBD的结合滴度;使用HIV-1假病毒系统测定对多种变异株(WT、BA.1、BA.2、BA.4/5、BA.2.75.2、XBB.1.5)的中和滴度。
Memory B cell development elicited by mRNA booster vaccinations in the elderly
研究包含人体队列、血浆中和试验、流式细胞术、单细胞抗体测序、单克隆抗体制备及功能验证等多个独立证据层级。
老年人外周血记忆B细胞 年轻人外周血记忆B细胞 HIV-1假病毒中和实验体系
参与者年龄范围:老年人75-91岁,年轻人23-66岁 疫苗接种方案:三剂或四剂mRNA疫苗(mRNA-1273或BNT162b2) 血液采集时间:老年人三剂后8.5个月或四剂后3个月,年轻人三剂后6.5个月 SARS-CoV-2 RBD特异性记忆B细胞通过流式细胞术(RBD-PE和RBD-AF647双阳性)检测 中和活性通过HIV-1假病毒(含WT或变异株刺突蛋白)测定
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估老年人与年轻人接种加强疫苗后血浆对SARS-CoV-2原始株及变异株的抗体结合和中和能力。
采用ELISA检测血浆IgG对WT和Omicron BA.4/5 RBD的结合滴度;使用HIV-1假病毒系统测定对多种变异株(WT、BA.1、BA.2、BA.4/5、BA.2.75.2、XBB.1.5)的中和滴度。
测定外周血中RBD特异性记忆B细胞的频率和绝对数量。
通过流式细胞术检测RBD-PE和RBD-AF647双阳性的CD20+ B细胞,并计算绝对B细胞数量。
分析RBD特异性记忆B细胞的抗体序列,评估克隆性和多样性。
对分选的单个B细胞进行RT-PCR和Sanger测序,获得IGH和IGL/IGK序列,使用Change-O工具进行克隆分型、多样性和克隆性分析。
验证记忆B细胞产生的抗体的结合特异性、表位和中和活性。
从每个供体中选择代表性克隆抗体和至少15个单克隆抗体,克隆表达并纯化,通过ELISA检测对多种RBD的结合,通过生物层干涉测量(BLI)进行表位竞争实验,通过ELISA检测KD和EC50。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| ELISA | 高结合力96半孔板 | Corning | 3690 |
| 吐温-20 | Sigma-Aldrich | -- | |
| HRP标记的抗人IgG二抗 | -- | 109-036-088 | |
| 酶标仪 | BMG Labtech | FluoStar | |
| 细胞培养 | 293T细胞 | ATCC | CRL-11268 |
| 病毒包装 | pSARS-CoV-2-SΔ19质粒 | -- | -- |
| 假病毒中和试验 | HT1080/Ace2 cl14细胞 | -- | -- |
| 荧光素酶细胞裂解液5x | Promega | -- | |
| Nano-Glo荧光素酶检测系统 | Promega | -- | |
| ClarioStar多功能酶标仪 | BMG | -- | |
| 流式细胞术 | 生物素-蛋白连接酶-BIRA试剂盒 | Avidity | -- |
| EZ-Link Sulfo-NHS-LC生物素化试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 链霉亲和素-BV711 | BD biosciences | 563262 | |
| 链霉亲和素-PE | BD Biosciences | 554061 | |
| 链霉亲和素-AF647 | BioLegend | 405237 | |
| 泛B细胞分选试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-101-638 | |
| Zombie NIR活/死染料 | BioLegend | 423105 | |
| 抗CD20-PECy7抗体 | BD Biosciences | 335793 | |
| 抗CD3-APC-eFluor 780抗体 | Invitrogen | 47-0037-41 | |
| 抗CD8-APC-eFluor 780抗体 | Invitrogen | 47-0086-42 | |
| 抗CD16-APC-eFluor 780抗体 | Invitrogen | 47-0168-41 | |
| FACS Aria III流式细胞分选仪 | Becton Dickinson | -- | |
| 抗IgD-BV650抗体 | BD | 740594 | |
| 抗CD27-BV786抗体 | BD biosciences | 563327 | |
| 抗CD19-BV605抗体 | BioLegend | 302244 | |
| 抗CD71-PerCP-Cy5.5抗体 | BioLegend | 334114 | |
| 抗IgG-PECF594抗体 | BD | 562538 | |
| 抗IgM-AF700抗体 | BioLegend | 314538 | |
| 抗IgA-Viogreen抗体 | Miltenyi Biotec | 130-113-481 | |
| 抗CD11c-BV711抗体 | BD biosciences | 563130 | |
| 抗CD21-PerCPCy5.5抗体 | BioLegend | 354908 | |
| 抗CD38-BV421抗体 | BD biosciences | 562445 | |
| 抗体测序 | SuperScript III逆转录酶 | Invitrogen | 18080-044 |
| RNasin核糖核酸酶抑制剂 | Promega | N2615 | |
| 10x Genomics | Chromium Single Cell 5'文库与凝胶微珠试剂盒 | 10x Genomics | PN-1000014 |
| Chromium Single Cell V(D)J富集试剂盒(人B细胞) | 10x Genomics | PN-1000016 | |
| NovaSeq 6000 S1测序试剂盒 | Illumina | 20012865 | |
| NextSeq 500/550 Mid输出试剂盒v2.5 | Illumina | 20024905 | |
| BLI竞争实验 | Octet Red仪器 | ForteBio | -- |
| 蛋白A生物传感器 | ForteBio | 18-5010 | |
| BLI亲和力测定 | 蛋白A生物传感器 | ForteBio | 18-5010 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 血浆ELISA | 血浆样本起始稀释度(1:66)和系列稀释倍数(三倍) 阅读提示:Materials and methods: ELISAs |
| 假病毒中和试验 | 血浆或单克隆抗体的稀释倍数(5倍系列)和共孵育时间(1小时) 阅读提示:Materials and methods: Pseudotyped virus neutralization assay |
| 流式细胞术分选 | B细胞富集方法和分选抗体组合(CD20, CD3, CD8, CD16, CD14等) 阅读提示:Materials and methods: Flow cytometry and single-cell sorting; Figure S2 (gating strategy) |
| 单细胞测序 | PCR引物和测序方法(Sanger) 阅读提示:Materials and methods: Antibody sequencing, cloning, and expression |
| 10x Genomics | 单细胞文库制备和测序平台(NovaSeq 6000, NextSeq 500/550) 阅读提示:Materials and methods: 10x Genomics |
| BLI竞争实验 | 参考抗体类别(Class 1-5)和浓度(10 μg/ml) 阅读提示:Materials and methods: Biolayer interferometry |