建立MHC缺陷靶细胞模型
验证MHC缺陷细胞对NK细胞杀伤的敏感性。
利用CRISPR-Cas9敲除B2m和Ciita基因,生成B2m−/−Ciita−/− miPSCs和hiPSCs,并分化成内皮细胞。
The SIRPα-CD47 immune checkpoint in NK cells
包含体内小鼠模型、体外细胞杀伤实验、转录组测序、ELISpot等多种证据层级,并进行功能验证和机制验证。
小鼠iPSC及iEC 人类iPSC及iEC K562肿瘤细胞 原代NK细胞和小鼠模型
NK细胞经IL-2刺激后SIRPα表达上调 CD47过表达保护MHC缺陷靶细胞免受NK细胞杀伤 SIRPα阻断或缺陷可解除CD47介导的NK细胞抑制 CD47-SIRPα相互作用具有物种特异性 CD47表达需达到阈值(约3.5倍)才能抑制NK细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证MHC缺陷细胞对NK细胞杀伤的敏感性。
利用CRISPR-Cas9敲除B2m和Ciita基因,生成B2m−/−Ciita−/− miPSCs和hiPSCs,并分化成内皮细胞。
评估CD47过表达对NK细胞杀伤的抑制作用。
用CFSE标记或Fluc标记的靶细胞,与NK细胞共培养或注射小鼠体内,通过流式或BLI检测杀伤。
确定CD47的抑制效应由NK细胞表达的SIRPα介导。
使用SIRPα阻断抗体、SIRPα缺陷小鼠或NK细胞系,检测CD47过表达靶细胞的杀伤情况。
确定CD47抑制NK细胞所需的最小表达水平。
生成不同CD47表达水平的克隆,暴露于激活的NK细胞和巨噬细胞,观察杀伤情况。
检验CD47-SIRPα相互作用是否具有物种特异性。
交叉物种实验:小鼠、人类、恒河猴CD47与不同效应细胞组合,检测杀伤。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | KO DMEM培养基 | Gibco | -- |
| KnockOut血清替代物 | Gibco | -- | |
| Essential 8 Flex培养基 | Thermo Fisher | -- | |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | -- | |
| B-27无胰岛素添加剂 | Gibco | -- | |
| 细胞分化 | CHIR-99021 | Selleckchem | -- |
| 小鼠血管内皮生长因子 | R&D Systems | -- | |
| 小鼠碱性成纤维细胞生长因子 | R&D Systems | -- | |
| Y-27632 | Sigma-Aldrich | -- | |
| SB 431542 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞培养 | TrypLE消化液 | Gibco | -- |
| 基质胶 | BD Biosciences | -- | |
| Versene | Gibco | -- | |
| 细胞分选 | FACSAria II流式细胞分选仪 | BD Biosciences | -- |
| 流式分析 | FACSCalibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 细胞杀伤实验 | xCELLigence SP/MP平台 | ACEA Biosciences | -- |
| 细胞培养 | E-板 | ACEA Biosciences | -- |
| 细胞杀伤实验 | 胶原蛋白 | Sigma-Aldrich | -- |
| Triton X-100 | -- | -- | |
| D-荧光素 | Promega | -- | |
| 成像检测 | Ami HT成像系统 | Spectral Instruments Imaging | -- |
| 细胞培养 | Ficoll分离液 | -- | -- |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | PeproTech | -- | |
| 白细胞介素2 | PeproTech | -- | |
| 白细胞介素15 | PeproTech | -- | |
| 聚肌胞苷酸 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 动物实验 | 白喉毒素 | Lystlab | -- |
| 流式分析 | 抗Sirpα抗体(克隆P84) | BD Biosciences | -- |
| 重组小鼠Cd47蛋白Fc嵌合体 | R&D Systems | 1866-CD-050 | |
| FITC标记抗人IgG1二抗 | -- | -- | |
| CFSE | Thermo Fisher | -- | |
| DiO | Invitrogen | -- | |
| DiD | Invitrogen | -- | |
| Vybrant多色细胞标记试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| ELISpot | 丝裂霉素 | -- | -- |
| RT-PCR | RNeasy Plus Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| High-Capacity cDNA反转录试剂盒 | Applied Biosystems | -- | |
| TopTaq DNA聚合酶 | Qiagen | -- | |
| SYBR Premix Ex Taq II | Takara | -- | |
| QuantStudio6实时荧光定量PCR仪 | Agilent Technologies | -- | |
| 流式分析 | PE标记抗SIRPα抗体(克隆15-414) | BioLegend | -- |
| 重组CD47蛋白Fc嵌合体 | Abcam | ab216207 | |
| FITC标记抗CD47抗体(克隆CC2C6) | BioLegend | -- | |
| FITC标记小鼠IgG1,κ同型对照(MOPC-21) | BioLegend | -- | |
| 细胞杀伤实验 | 抗Cd47阻断抗体(克隆MIAP301) | BioXCell | -- |
| 抗CD47阻断抗体(克隆B6.H12) | BioXCell | -- | |
| 抗Sirpα阻断抗体(克隆P84) | BioLegend | -- | |
| 抗SIRPα阻断肽 | MyBioSource | MBS822365 | |
| 小鼠FcR阻断剂 | Miltenyi | 130-092-575 | |
| 人FcR阻断剂 | Miltenyi | 130-059-901 | |
| 抗Pirb抗体 | MyBioSource | MBS1489822 | |
| 抗LILRB1抗体(克隆GHI/75) | Abcam | -- | |
| 抗CD16抗体(克隆3G8) | BioLegend | -- | |
| 抗NKG2D抗体(克隆149810) | R&D Systems | -- | |
| 抗SIRPα抗体(克隆2H7E2) | antibodies-online | -- | |
| 抗CD56抗体(克隆NCAM1/784) | Abcam | -- | |
| 细胞培养 | 脂质体转染试剂 | -- | -- |
| 细胞分选 | 抗CD15单抗偶联磁珠 | Miltenyi | -- |
| MagniSort小鼠NK细胞富集试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| CD49b MACS分选 | Miltenyi | -- | |
| CD3 MACS分选 | Miltenyi | -- | |
| 细胞培养 | 恒河猴IL-2 | MyBioSource | -- |
| 恒河猴M-CSF | Biorhyt | -- | |
| 动物实验 | NSG小鼠 | Jackson Laboratories | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| NK细胞激活 | IL-2刺激浓度和时间 阅读提示:Materials and methods: NK cell culture, Human NK cell isolation; Figure S3 |
| CD47过表达水平 | CD47表达需达到约3.5倍以上 阅读提示:Results: CD47 delivers a threshold-dependent inhibitory signal; Figure 5 |
| 效应细胞类型 | 是否表达SIRPα 阅读提示:Results: SIRPα transmits the inhibitory CD47 signal; Figure 4 |
| 物种匹配性 | CD47和效应细胞需同种 阅读提示:Results: The CD47–SIRPα interaction is highly species specific; Figure 3 |