Hippo信号在iNKT细胞中的表达和活性分析
确定Hippo信号是否参与iNKT细胞发育
通过流式检测pMob1在DP和iNKT细胞中的表达;分析Mst1/2敲除小鼠的iNKT细胞发育表型
Hippo/Mst signaling coordinates cellular quiescence with terminal maturation in iNKT cell development and fate decisions
研究包含多个独立证据层级:细胞模型(iNKT细胞发育阶段)、基因敲除小鼠(Mst1/2、Opa1、Rictor等)、转录组分析和生化实验,明确包含功能验证和机制验证。
小鼠胸腺iNKT细胞发育阶段S0-S3 小鼠iNKT效应亚群iNKT1、iNKT2、iNKT17 基因敲除小鼠(Cd4CreMst1fl/fl、Cd4CreOpa1fl/fl等) 混合骨髓嵌合小鼠
Mst1或Mst1/2缺失导致iNKT细胞数量减少,S3阶段减少,S2阶段增加 Mst1缺陷iNKT细胞中IL-15诱导的STAT5磷酸化减弱,Bcl-2表达降低 Mst1缺陷S3 iNKT细胞中Ki67和BrdU阳性细胞比例增加,细胞周期基因表达上调 Mst1缺陷S3 iNKT细胞中OCR、ECAR、线粒体质量、膜电位和ROS水平升高 Mst1缺陷增加iNKT17细胞,减少iNKT1细胞,依赖于ICOS-mTORC2信号
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Hippo信号是否参与iNKT细胞发育
通过流式检测pMob1在DP和iNKT细胞中的表达;分析Mst1/2敲除小鼠的iNKT细胞发育表型
探究Mst1是否通过IL-15信号影响iNKT细胞存活
检测IL-15诱导的pMob1和pSTAT5;体外培养检测存活和凋亡;检测Bcl-2表达
鉴定Mst1调控的发育阶段相关基因程序
对WT和Mst1缺陷S1-S3 iNKT细胞进行转录组分析,WGCNA聚类和功能富集分析
验证Mst1是否抑制iNKT细胞增殖和促进静默
通过Ki67染色和BrdU掺入检测各阶段iNKT细胞的增殖
评估Mst1对iNKT细胞代谢和线粒体稳态的影响
Seahorse分析OCR/ECAR;MitoTracker、TMRM、CellROX染色;荧光显微镜和STORM成像测量线粒体体积和直径
确定Mst1对iNKT1/iNKT17亚群分化的影响
通过转录因子(T-bet、RORγt、PLZF)和细胞因子(IFN-γ、IL-17A)分析效应亚群
验证Mst1缺失时iNKT17细胞发育是否依赖于ICOS-mTORC2信号
使用ICOS敲除和Rictor敲除小鼠与Mst1缺陷小鼠杂交,分析iNKT17细胞发育;检测ICOS诱导的Akt磷酸化
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI培养基 | -- | -- |
| 流式分析 | mCD1d-PBS57四聚体 | National Institutes of Health Tetramer Facility | -- |
| 抗TCRβ抗体 | Tonbo Biosciences | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin V | BD Biosciences | -- |
| 细胞因子刺激 | 重组小鼠IL-15 | Peprotech | -- |
| 重组小鼠IL-2 | Peprotech | -- | |
| 重组小鼠IL-7 | Peprotech | -- | |
| 刺激 | 佛波酯 | Sigma-Aldrich | -- |
| 离子霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 莫能菌素 | BD Biosciences | -- | |
| 流式分析 | Foxp3固定/破膜缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | 00-5523-00 |
| BrdU染色 | BD Biosciences | 552598 | |
| 活性caspase 3染色 | BD Biosciences | 550480 | |
| Annexin V染色 | BD Biosciences | 550474 | |
| 磷酸化蛋白检测 | Phosflow裂解/固定缓冲液 | BD Biosciences | 558049 |
| Phosflow通透缓冲液III | BD Biosciences | 558050 | |
| 抗磷酸化Akt (Ser473)抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗磷酸化S6 (Ser235/236)抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗磷酸化Mob1 (Thr35)抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗磷酸化STAT5 (Tyr694)抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 线粒体染色 | MitoTracker Green | Life Technologies | M7514 |
| MitoTracker Deep Red | Life Technologies | MM22426 | |
| 膜电位染色 | TMRM | ImmunoChemistry Technologies | 9105 |
| ROS染色 | CellROX Deep Red | Life Technologies | C10422 |
| 葡萄糖摄取 | 2-NBDG | Thermo Fisher Scientific | N13195 |
| 细胞分选 | LSRII或LSR Fortessa | BD Biosciences | -- |
| 富集iNKT细胞 | 抗PE磁珠 | Miltenyi | -- |
| CD8+磁珠 | Miltenyi | -- | |
| 细胞分选 | Sony SY3200分选仪 | Sony | -- |
| 荧光显微镜 | 抗Tom20抗体 | Abcam | 186735 |
| AF647标记驴抗兔二抗 | Jackson Immunoresearch | -- | |
| AF488标记鬼笔环肽 | Thermo Fisher Scientific | A12379 | |
| 共聚焦显微镜 | Marianis转盘共聚焦显微镜 | Intelligent Imaging Innovations | -- |
| STORM成像 | N-STORM系统 | Nikon Instruments | -- |
| 代谢分析 | XF96细胞外流量分析仪 | Seahorse Bioscience | -- |
| 免疫印迹 | Opa1抗体 | Novus | NB110 |
| VDAC抗体 | Cell Signaling Technology | D73D12 | |
| Mst1抗体 | Cell Signaling Technology | 3682 | |
| β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 8H10D10 | |
| LI-COR Odyssey FC成像系统 | LI-COR | -- | |
| RNA提取 | RNeasy Micro试剂盒 | Qiagen | -- |
| cDNA合成 | High Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4368814 |
| RT-qPCR | Fast Start Universal Probe Master (Rox) | Sigma-Aldrich | 4913949001 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | 基因敲除小鼠品系:Cd4CreMst1fl/fl、Cd4CreMst2fl/fl、Cd4CreMst1fl/flMst2fl/fl、Cd4CreOpa1fl/fl、Cd4CreRictorfl/fl、ICOS−/−等;年龄和性别匹配 阅读提示:Materials and methods 的 Mice 部分 |
| 流式细胞术 | 抗体克隆号、荧光素标记、细胞表面和细胞内染色方案;iNKT细胞阶段定义:S0-S3;效应亚群定义:iNKT1 (T-bethiPLZFlo), iNKT2 (RORγtloPLZFhi), iNKT17 (RORγthiPLZFint) 阅读提示:Materials and methods 的 Flow cytometry 部分 |
| 细胞培养 | 培养基:Complete Click's medium;细胞浓度:2×10^6细胞/孔;rmIL-15浓度:20 ng/ml;培养时间:1-3天 阅读提示:Materials and methods 的 iNKT cell in vitro cultures 部分 |
| 刺激条件 | PMA浓度:1 µM;离子霉素浓度:1 µM;刺激时间:4-5小时;细胞因子刺激浓度和时间:IL-2、IL-15、IL-7均10 ng/ml,时间点需明确 阅读提示:Materials and methods 的 In vitro stimulation for cytokine and phospho-flow 部分 |
| 代谢分析 | Seahorse分析中每孔细胞数:2.5×10^5;基础培养基:DMEM Seahorse XF medium + 10 mM D-glucose;药物浓度:oligomycin 1 µM, FCCP 1.5 µM, rotenone 500 nM 阅读提示:Materials and methods 的 Seahorse analysis 部分 |
| 转录组分析 | 样本量和重复数:WT和Mst1缺陷各3个样本(部分实验6-7个);差异表达基因筛选标准:fold-change >1.5, FDR <0.05;WGCNA参数 阅读提示:Materials and methods 的 Gene expression profiling and bioinformatic analysis 部分 |