家族遗传分析和变异鉴定
确定弱精子症家系的遗传病因和候选致病变异
对巴基斯坦近亲家系中的三名不育兄弟进行全外显子组测序和Sanger验证,鉴定DNAH17 c.G5408A纯合错义变异与弱精子症共分离。
A DNAH17 missense variant causes flagella destabilization and asthenozoospermia
包含家族遗传分析、全外显子测序、患者精子形态和超微结构分析、Dnah17M/M小鼠模型功能验证及附睾结扎实验,涉及体外和体内多层级验证。
人类精子样本(三个患者及对照) Dnah17M/M小鼠模型 Dnah17-/-小鼠模型
DNAH17 c.G5408A (p.C1803Y) 纯合变异与弱精子症的共分离 患者和Dnah17M/M小鼠精子鞭毛主段和末段MTD(s)4-7缺失频率 Dnah17M/M小鼠附睾储存时间对MTD(s)4-7缺失频率的影响(2天和4天结扎) Dnah17M/M小鼠精子活力和进行性活力降低 Dnah17在睾丸和精子中的表达定位
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定弱精子症家系的遗传病因和候选致病变异
对巴基斯坦近亲家系中的三名不育兄弟进行全外显子组测序和Sanger验证,鉴定DNAH17 c.G5408A纯合错义变异与弱精子症共分离。
验证DNAH17在睾丸和精子中的特异性表达和定位
通过RT-qPCR、免疫印迹和免疫荧光染色分析DNAH17在人类和小鼠组织及精子中的表达和定位。
评估DNAH17变异对精子形态和鞭毛轴丝结构的影响
对患者和对照精子进行Papanicolaou染色和透射电镜分析,检查鞭毛形态和轴丝超微结构。
验证患者突变对精子功能的影响
利用CRISPR/Cas9生成携带患者等效突变(c.G5360A)的Dnah17M/M小鼠,分析精子参数、形态和超微结构。
探究MTD(s)4-7缺失是否发生在附睾储存过程中
对Dnah17M/M小鼠附睾各段进行电镜分析,并进行附睾管结扎实验以模拟不同储存时间。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| RNA提取和实时定量PCR | Trizol试剂 | -- | -- |
| PrimeScript逆转录试剂盒 | TaKaRa | RR047A | |
| PrimeSTAR HS DNA聚合酶 | TaKaRa | R044A | |
| FastStart Universal SYBR Green Master(Rox) | Roche | 04913850001 | |
| 实时定量PCR | StepOne实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- |
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | HyClone | SH30022.01 |
| 胎牛血清 | GIBCO | 15140122 | |
| 青霉素-链霉素 | GIBCO | 16000044 | |
| 免疫印迹 | Bolt LDS样品缓冲液 | Invitrogen | B0008 |
| NuPAGE抗氧化剂 | Invitrogen | NP0005 | |
| PMSF蛋白酶抑制剂混合物 | Thermo Scientific | 36978 | |
| NuPAGE 3-8% Tris-醋酸蛋白胶 | Invitrogen | EA03785BOX | |
| 硝酸纤维素转印膜 | GE Healthcare | 10600002 | |
| Mini凝胶电泳槽 | Invitrogen | A25977 | |
| ImageQuant LAS 4000成像系统 | GE Healthcare | -- | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Sigma | F2168 | |
| 抗Lamin B1抗体 | Proteintech | 12987-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab8227 | |
| 抗β-微管蛋白抗体 | Abcam | ab6046 | |
| 抗ODF2抗体 | Proteintech | 12058-1-AP | |
| HRP标记的驴抗兔IgG | Biolegend | 406401 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | Biolegend | 405306 | |
| 免疫荧光染色 | VECTASHIELD封片剂 | Vector Laboratories | H-1000 |
| Hoechst 33342 | Invitrogen | H21492 | |
| Nikon ECLIPSE 80i显微镜 | Nikon | -- | |
| Nikon C2 Plus共聚焦激光扫描显微镜 | Nikon | -- | |
| Alexa Fluor 488山羊抗小鼠IgG | Molecular Probes | A-21121 | |
| Alexa Fluor 555驴抗兔IgG | Molecular Probes | A31572 | |
| 免疫组织化学 | 正常兔IgG | CST | 2729S |
| 精子形态分析 | 巴氏染色试剂盒 | Solarbio | G1612 |
| 小鼠模型构建 | gRNA模板 | Addgene | 51132 |
| 单链寡脱氧核苷酸 | Sangon Biotech | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 遗传变异分析 | DNAH17 c.G5408A纯合变异; 家系成员基因型 阅读提示:Methods: WES and linkage analysis; Filtering of candidate variants |
| 患者精子分析 | 精子样本来源; 精液参数; 精子形态和超微结构分析条件 阅读提示:Methods: The participants and semen analyses; Figure 4 legend |
| 小鼠模型 | Dnah17M/M小鼠构建方法; 小鼠品系和背景; 精子分析条件 阅读提示:Methods: Mouse models; Analyses of mouse sperm count, morphology, and motility |
| 附睾分析和结扎实验 | 附睾各段样本处理; 结扎位置和时间; TEM分析条件 阅读提示:Methods: Epididymal duct ligation; Figure 7 legend |
| 表达和定位分析 | 抗体特异性和来源; 组织样本和细胞系; 免疫染色条件 阅读提示:Methods: Generation of the polyclonal anti-DNAH17 antibody; Validation; Immunoblotting; IF staining; IHC |