尼日尔重症急性营养不良住院患儿获得携带超广谱β-内酰胺酶和碳青霉烯酶基因大肠杆菌的研究

Acquisition of Escherichia coli carrying extended-spectrum ß-lactamase and carbapenemase genes by hospitalised children with severe acute malnutrition in Niger

作者信息Kirsty Sands, Aditya Kumar Lankapalli, Giulia Lai, Brekhna Hassan, Edward Ar Portal, Jordan At Mathias, Ian Boostrom, Mei Li, Kate Cook, Shonnette Premchand-Branker, Lim S Jones, Nathan Sayinzonga-Makombe, Sheila Isanaka, Rupa Kanapathipillai, Christopher Mambula, Isabelle Mouniaman, Céline Langendorf, Timothy R Walsh, Owen B Spiller
PMID40750762
发布时间2025-08-01
DOI10.1038/s41467-025-61718-w

摘要

对于患有复杂严重急性营养不良(SAM)的儿童,建议住院并接受常规抗生素治疗,但这可能加剧抗菌药物耐药性。本研究调查了尼日尔接受SAM治疗的5岁以下儿童携带革兰氏阴性菌的情况,比较了入院时、住院期间及出院时携带耐药基因细菌的定植频率。对携带blaNDM-5基因的大肠杆菌分离株进行了全基因组测序。结果显示,携带β-内酰胺酶基因的细菌直肠定植率较高:76%(1042/1371)的儿童携带blaCTXM-1组基因,25%(338/1371)携带blaNDM-5基因。超过三分之二入院时未携带碳青霉烯酶基因细菌的儿童,在出院时定植了携带碳青霉烯酶基因的细菌(503/729,69%)。11%(144/1371)的儿童体内检出携带blaNDM-5基因的大肠杆菌ST167型。本研究揭示了这一需要医疗救治的脆弱人群中存在的感染控制及细菌耐药性传播风险。

实验方法

产品清单

名称品牌货号
Amies加炭培养基COPAN Diagnostics--
Illustra PuReTaq即用型PCR磁珠GE Healthcare--
TS/72菌种保存珠Technical Service Consultants--
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪Bruker Daltonik GmbH--
QIAamp DNA提取试剂盒Qiagen--
QIAcube自动化核酸纯化仪Qiagen--
Qubit荧光定量仪(v3.0)ThermoFisher--
Nextera XT v2文库制备试剂盒Illumina--
Illumina MiSeq测序仪Illumina--
MinION纳米孔测序仪Oxford Nanopore Technology (ONT)--
96孔快速条形码建库试剂盒Oxford Nanopore Technology (ONT)SQK-RBK110.96
GridION测序仪Oxford Nanopore Technology (ONT)--