ENU诱变筛选与met突变体鉴定
鉴定加速衰老的斑马鱼突变体
使用ENU诱变雄性成体斑马鱼,F3胚胎在8 dpf进行SA-β-Gal染色,筛选肠道细胞衰老的隐性突变体。
Establishment and application of a zebrafish model of Werner syndrome identifies sapanisertib as a potential antiaging drug
包含ENU诱变筛选、CRISPR/Cas9基因敲除、热休克拯救、药物筛选、体内外功能验证及机制研究等多层级证据。
斑马鱼wrnKO突变体 斑马鱼met突变体 人类包皮成纤维细胞(HFF) 野生型老年斑马鱼
斑马鱼wrn基因突变位点及蛋白截短 CRISPR/Cas9敲除效率及表型一致性 sapanisertib处理浓度(10 μmol/L)及时间(4天) mTORC1/2信号通路活性(p-S6、p-4EBP、p-Akt) SA-β-Gal染色定量与样本量
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定加速衰老的斑马鱼突变体
使用ENU诱变雄性成体斑马鱼,F3胚胎在8 dpf进行SA-β-Gal染色,筛选肠道细胞衰老的隐性突变体。
确定met突变体的致病基因
通过SSLP标记定位、基因组测序、CRISPR/Cas9敲除和热休克拯救实验验证wrn突变。
评估斑马鱼wrnKO突变体是否再现WS患者特征
检测细胞衰老、寿命、脂质积累、身体长度、DNA损伤、表观遗传改变等。
寻找能改善wrnKO突变体早衰表型的药物
使用SA-β-Gal染色对化合物库进行筛选,验证sapanisertib效果。
探究sapanisertib改善早衰的机制
分析mTORC1/2信号通路相关蛋白表达,并比较sapanisertib与雷帕霉素及JR-AB2-011的效果。
验证sapanisertib在生理性衰老模型中的效果
检测老年斑马鱼和HFF细胞的衰老表型及sapanisertib处理效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物筛选 | 生物活性化合物库 (L2000-Z481077) | Selleck | L2000-Z481077 |
| FDA批准药物库 (HY-L022) | MCE | HY-L022 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶 | -- | -- | |
| 药物处理 | Sapanisertib | -- | -- |
| 雷帕霉素 | -- | -- | |
| JR-AB2-011 | -- | -- | |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| SA-β-Gal染色 | SA-β-Gal染色试剂盒 | -- | -- |
| 脂质染色 | 油红O | -- | -- |
| 肠道通透性检测 | FITC-葡聚糖 | -- | -- |
| 蓝色染料#1 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| ENU诱变与筛选 | ENU浓度3.5 mM,处理时间1小时,间隔5天,重复6次;F3胚胎筛选样本量至少60个;8 dpf作为观察终点。 阅读提示:Materials and Methods: ENU Mutagenesis and Screening |
| CRISPR/Cas9敲除 | 靶向外显子4和外显子35的gRNA序列;大片段删除效率;确认敲除后表型与met一致性。 阅读提示:SI Appendix, Fig. S1 |
| 药物筛选 | 药物浓度10 μmol/L,处理时间4天(4 dpf至8 dpf),24孔板每孔6只幼虫,溶剂对照(DMSO或水)和阳性对照(雷帕霉素)。 阅读提示:Materials and Methods: Chemical Screening; Figure 3A |
| 信号通路检测 | p-S6、p-4EBP(mTORC1)和p-Akt S473(mTORC2)的表达水平;sapanisertib和雷帕霉素处理浓度及时间。 阅读提示:Figure 4 A-D, G; SI Appendix, Fig. S9 |
| 生理性衰老模型 | 老年(3岁)和年轻(6个月)斑马鱼年龄;HFF细胞传代数(passage 20, 30)和sapanisertib浓度(5 nM)。 阅读提示:Figure 5; Materials and Methods: Cell Culture and Cell Lines |