评估近端胰岛素信号(AKT磷酸化)
检测胰岛素抵抗脂肪组织中经典胰岛素信号通路是否受损。
在青少年肥胖队列和SODA队列中,通过免疫印迹检测脂肪组织AKT磷酸化,比较基础和胰岛素刺激状态。
Altered Molecular Regulation of TUG Is a Central Feature of Insulin-Resistant Human Adipose Tissue
包含三个独立人类队列(RNA测序、蛋白质组学、免疫印迹和qPCR),并进行了功能相关验证(GLUT4、TUG、TC10通路)和机制探讨(皮下脂肪组织特异性)。
RESOLVE队列皮下白色脂肪组织 青少年肥胖队列皮下白色脂肪组织 SODA队列皮下及网膜白色脂肪组织
胰岛素敏感性分组(HEC或M值/WBISI) GLUT4蛋白和mRNA表达(免疫印迹及RNA测序) TUG蛋白和mRNA表达(免疫印迹、蛋白质组、RNA测序) TC10通路蛋白(TC10、PIST、TRARG1)表达 AKT磷酸化水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测胰岛素抵抗脂肪组织中经典胰岛素信号通路是否受损。
在青少年肥胖队列和SODA队列中,通过免疫印迹检测脂肪组织AKT磷酸化,比较基础和胰岛素刺激状态。
验证胰岛素抵抗脂肪组织中GLUT4水平是否改变。
通过免疫印迹(青少年队列)、蛋白质组学(SODA队列)和RNA测序(RESOLVE队列)检测GLUT4蛋白及mRNA水平。
验证胰岛素抵抗脂肪组织中TUG蛋白及mRNA水平是否改变。
通过免疫印迹(青少年队列)、蛋白质组学(SODA队列)和RNA测序(RESOLVE队列)检测TUG蛋白及mRNA水平。
检测TC10–TUG信号通路中其他组分是否在胰岛素抵抗中改变。
通过RNA测序、蛋白质组学、qPCR和免疫印迹检测CBL、CRK、RHOQ/TC10、GOPC/PIST、GOLGA3、ASPSCR1/TUG、SLC2A4、ADRB1、ADRB2等基因或蛋白表达。
评估TC10–TUG通路改变是否具有脂肪库特异性。
在SODA队列中,比较皮下和网膜脂肪组织中GLUT4、TUG及TC10通路蛋白表达与胰岛素抵抗的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| RNA测序 | Ovation Ultralow System V2 | Tecan Group, Ltd. | -- |
| Illumina HiSeq 4000 | Illumina | -- | |
| 免疫印迹 | 聚偏二氟乙烯膜 | EMD Millipore | -- |
| HSP90抗体 | BD Biosciences | 610419 | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 2920 | |
| 磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| GLUT4抗体 | Bogan Laboratory | -- | |
| TUG抗体 | Bogan Laboratory | -- | |
| TC10抗体 | Sigma-Aldrich | SAB5701368 | |
| 定量PCR | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | 74106 |
| QuantiTect逆转录试剂盒 | Qiagen | 205311 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| RNA测序 | 队列:RESOLVE;样本数:24;测序平台:Illumina HiSeq 4000;比对参考基因组:hg38;读取深度:4.3-20百万reads/样本 阅读提示:Research Design and Methods: RNA Sequencing |
| 蛋白质组学 | 队列:SODA;样本数:16,使用两个TMTpro-18 plex;分组:MASLD状态;饮料:葡萄糖75g或果糖75g;分析:液相色谱-质谱联用蛋白质组学 阅读提示:Research Design and Methods: Proteomics |
| 免疫印迹 | 队列:青少年肥胖;组织:皮下脂肪活检;抗体:HSP90、AKT、pAKT、GLUT4、TUG、TC10(具体货号及稀释见原文);检测条件:基于免疫印迹 阅读提示:Research Design and Methods: Immunoblotting |
| 定量PCR | 队列:青少年肥胖;RNA提取:RNeasy Mini Kit;逆转录:QuantiTect Reverse Transcription Kit;内参:GAPDH 阅读提示:Research Design and Methods: Real-Time qPCR |
| 统计设计 | 组间比较:t检验、单因素方差分析;回归分析:简单线性回归;显著性阈值:P<0.05 阅读提示:Research Design and Methods: Statistical Analysis |