发现并鉴定吲哚代谢物
鉴定弯曲杆菌分泌的潜在炎症相关小分子
通过非靶向HPLC-HR-MS分析弯曲杆菌分泌组,结合大规模培养、溶剂分配、反相柱色谱和制备型HPLC,分离并鉴定了19种吲哚类代谢物,包括新化合物和已知化合物,并通过NMR和HR-MS确定结构。
Elucidating the role of Campylobacter concisus-derived indole metabolites in gut inflammation and immune modulation
研究包含代谢物分离鉴定、体外细胞实验、抗菌实验和体内活体成像等多个实验层面,但缺乏基因敲除或通路抑制剂等机制验证。
人外周血单核细胞 小鼠模型 HT-29细胞 RAW264.7报告细胞系
化合物浓度:多种吲哚代谢物测试浓度5μM,剂量反应实验使用6.25μM和12.5μM的三吲哚啉 AHR活性检测:使用RAW264.7报告细胞系,测试浓度1-16μM 体内实验:C57BL/6小鼠,单次口服给药,6小时和24小时检测 抗菌实验:测试菌株包括脆弱拟杆菌、长双歧杆菌等,IC50值计算 细胞活力检测:HT-29细胞和人单核细胞,使用CytoTox-Glo™试剂盒
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定弯曲杆菌分泌的潜在炎症相关小分子
通过非靶向HPLC-HR-MS分析弯曲杆菌分泌组,结合大规模培养、溶剂分配、反相柱色谱和制备型HPLC,分离并鉴定了19种吲哚类代谢物,包括新化合物和已知化合物,并通过NMR和HR-MS确定结构。
测试吲哚代谢物是否影响宿主细胞活力并诱导细胞因子产生
用14种最丰富的代谢物处理HT-29细胞和新鲜分离的人血液单核细胞,评估细胞活力;随后在5 μM浓度下检测单核细胞产生的细胞因子,并对化合物1进行剂量反应分析。
探究吲哚代谢物是否通过芳香烃受体发挥作用
使用RAW264.7报告细胞系进行AHR刺激实验,测试所有化合物在1-16 μM浓度下的AHR活性。
测试吲哚代谢物对共生菌的抑制作用
测试最丰富的吲哚代谢物对多种肠道共生菌(包括脆弱拟杆菌、长双歧杆菌等)的生长抑制,计算IC50值。
验证吲哚代谢物在体内是否诱导炎症反应
使用小鼠模型,单次口服给予化合物1,通过活体成像检测结肠中CD31、Ly6G和F4/80的表达,评估中性粒细胞和巨噬细胞的募集。
探究外部药物能否增强弯曲杆菌产生吲哚代谢物
用770种FDA批准的药物处理弯曲杆菌,通过UPLC-qTOF-MS监测吲哚代谢物水平,筛选出显著增强三吲哚啉产生的药物,并验证了氨曲南、杆菌肽和头孢地尼等抗生素的作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 代谢物分离与结构鉴定 | 高效液相色谱 | -- | -- |
| 高分辨质谱 | -- | -- | |
| 核磁共振 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | CytoTox-Glo™ 细胞毒性检测试剂盒 | Promega | -- |
| 细胞因子检测 | LEGENDplex™ 人炎症因子检测试剂盒(Panel 1) | BioLegend | -- |
| AHR活性检测 | RAW264.7 报告细胞系 | -- | -- |
| 体内成像 | 视频级激光扫描共聚焦和双光子显微镜 | -- | -- |
| 药物筛选 | FDA批准药物库(770种化合物) | -- | -- |
| 超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 代谢物分离与结构鉴定 | 培养基成分、培养条件(温度、时间、厌氧环境) 阅读提示:详见SI Appendix中的详细方法 |
| 细胞活力检测 | 细胞系、细胞数量、化合物处理浓度和时间 阅读提示:SI Appendix,Fig. S20 |
| 细胞因子检测 | 单核细胞来源、处理浓度(5μM)和时间 阅读提示:Results 部分“Cytokine Profiling and Antimicrobial Activity”及SI Appendix |
| AHR活性检测 | 报告细胞系、化合物浓度范围、阳性对照FicZ浓度 阅读提示:Results 部分“Cytokine Profiling and Antimicrobial Activity”及Fig. 2D |
| 抗菌实验 | 菌株、接种量、化合物浓度范围、培养条件 阅读提示:Table 1及Methods部分 |
| 体内实验 | 小鼠品系、给药剂量(单剂量)、给药方式(口服)、观察时间点(6h和24h) 阅读提示:Results 部分“Intravital Imaging”及Fig. 3 |
| 药物筛选 | 药物浓度、处理时间、弯曲杆菌培养条件 阅读提示:Results 部分“Enhanced Production of Trisindoline by Antibiotics”及SI Appendix |