环境研究中的马拉色菌源自人类输入

真菌马拉色菌是人类皮肤菌群中最普遍的成员，以其依赖脂质且无法合成长链脂肪酸而闻名。马拉色菌表现出显著的生态位广度，栖息于土壤、灰尘以及从极地到深海热泉的各种海洋环境中。马拉色菌在海洋栖息地（包括与海洋动物相关的栖息地）中的持续存在，表明该真菌能够在海洋生态系统中生长并发挥基本作用。在本研究中，我们探索了序列读取档案数据库中的宏基因组序列，以调查海洋生态系统中马拉色菌物种的存在、分布和起源，目标是组装马拉色菌基因组。使用各种搜索方法，我们发现所分析的鸟枪法和扩增子数据集中多达10%含有马拉色菌序列。然而，每个数据集中马拉色菌的相对丰度较低，并且海洋环境中人类与马拉色菌序列之间存在强相关性，这与污染一致。从最富含马拉色菌的数据集中，我们尝试生成宏基因组组装基因组。然而，马拉色菌重叠群共同显示出较低的基因组完整性水平，在样本中最高为2.2%。系统发育分析将这些重叠群鉴定为与人类相关的马拉色菌（Malassezia globosa）和限制马拉色菌（Malassezia restricta）密切相关，以及马拉色菌（Malassezia sympodialis）和厚皮马拉色菌（Malassezia pachydermatis），它们是所有研究环境中最常见的物种。我们的数据表明，环境中许多马拉色菌的观察结果源自人类来源，并且广泛的污染混淆了对海洋环境中马拉色菌多样性和生态作用的探索。