罕见种系结构变异增加儿童实体瘤风险

Rare germline structural variants increase risk for pediatric solid tumors

作者信息Riaz Gillani, Ryan L Collins, Jett Crowdis, Amanda Garza, Jill K Jones, Mark Walker, Alba Sanchis-Juan, Christopher W Whelan, Emma Pierce-Hoffman, Michael E Talkowski, Harrison Brand, Kevin Haigis, Jaclyn LoPiccolo, Saud H AlDubayan, Alexander Gusev, Brian D Crompton, Katherine A Janeway, Eliezer M Van Allen
PMID39745975
期刊Science
发布时间2025-01-03
DOI10.1126/science.adq0071

摘要

儿童实体瘤是儿童疾病死亡率的主要原因。本研究通过分析1765名患病儿童、943名未患病父母及6665名成人对照的种系基因组测序数据,探讨了种系结构变异(SVs)与儿童颅外实体瘤风险的关联。我们发现超大型(>1兆碱基)种系染色体异常与男童实体瘤风险增加存在性别偏向性关联。种系SVs在神经母细胞瘤中的影响最为显著:我们发现了导致高表达、突变受限基因功能丧失的超罕见SVs负荷,以及可能破坏染色质结构域边界的非编码SVs。综合评估显示,罕见种系SVs可解释1.1%至5.6%的儿童癌症易感性,这确立了其作为疾病遗传易感性的重要组成部分。

实验方法

产品清单

名称品牌货号
C1000 Touch热循环仪Bio-RadC1000 Touch
液相色谱-质谱系统----