构建NTCP表达调控模型
建立NTCP敲低、过表达和突变的人足细胞模型,以研究NTCP在HBV感染中的作用。
使用慢病毒质粒将shRNA-NTCP、shRNA-NC、WT-NTCP和MUT-NTCP转染至人足细胞,通过qPCR验证NTCP表达变化。
Hepatitis B virus-targeting sodium taurocholate cotransporting polypeptide mediates HBV infection and damage in human renal podocytes
包含体外细胞感染模型,通过基因敲低、过表达和突变进行功能验证,并检测病毒感染标志物、细胞凋亡、迁移和蛋白表达等多层次验证。
人足细胞(HPCs) HepG2.2.15细胞(HBV来源)
NTCP表达水平(正常、敲低、过表达、突变) HBV感染时间(16小时)和感染后检测时间点(1,3,5,7,9天) NTCP157-165位点突变(KGIVISLVL→GRIILSLVP) HBV感染标志物:HBV DNA、cccDNA、HBsAg、HBeAg、HBcAg
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立NTCP敲低、过表达和突变的人足细胞模型,以研究NTCP在HBV感染中的作用。
使用慢病毒质粒将shRNA-NTCP、shRNA-NC、WT-NTCP和MUT-NTCP转染至人足细胞,通过qPCR验证NTCP表达变化。
评估不同NTCP表达水平下HBV感染程度。
用含HBV的HepG2.2.15细胞上清感染处理后的足细胞,16小时后弃去上清,继续培养至9天,检测HBV DNA、cccDNA、HBsAg、HBeAg和HBcAg。
检测HBV感染对足细胞骨架蛋白、凋亡、增殖和迁移的影响。
通过Western blot检测nephrin、synaptopodin和CD2AP表达;通过流式细胞术检测凋亡;通过CCK-8检测细胞活力;通过划痕和Transwell实验检测迁移;通过Wright-Giemsa染色观察形态。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | GIBCO, Invitrogen Corporation | -- |
| 青霉素/链霉素 | Sigma | -- | |
| 支原体去除剂 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 胎牛血清 | Hyclone | -- | |
| 质粒转染 | Lipofectamine 2000 | Invitrogen, Thermo Fisher Scientific | -- |
| 质粒构建 | shRNA-NTCP1, shRNA-NTCP2, shRNA-NC, WT-NTCP, MUT-NTCP | Ribo Bio Co. | -- |
| HBV DNA提取 | QIAamp DNA Mini试剂盒 | Da An Gene Co., Ltd. | -- |
| ELISA检测 | HBsAg ELISA试剂盒 | Kehua | -- |
| HBeAg ELISA试剂盒 | Kehua | -- | |
| 免疫荧光 | 抗HBcAg抗体 (ab8639) | Abcam | -- |
| 山羊抗小鼠IgG H&L (Alexa Fluor 488) (ab150113) | Abcam | -- | |
| Western blot | NTCP兔多克隆抗体 (GTX 17693) | Gene Tex | -- |
| 抗GAPDH抗体 (ab8245) | Abcam | -- | |
| 山羊抗兔IgG H&L (HRP) (ab6721) | Abcam | -- | |
| CD2AP抗体 (2135) | Cell Signaling Technology | -- | |
| Nephrin抗体 (ab235903) | Abcam | -- | |
| Synaptopodin抗体 (ab224491) | Abcam | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin V/PI凋亡检测试剂盒 | Nanjing KeyGEN Biotech | -- |
| Transwell迁移 | 结晶紫溶液 | Sigma-Aldrich | -- |
| 显微镜观察 | 激光共聚焦显微镜 (Zeiss LSM) | Zeiss | -- |
| 相差显微镜 (Nikon Olympus) | Nikon | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与感染 | 人足细胞的分化状态;HepG2.2.15细胞培养上清的HBV滴度(10^3 GEq/细胞);感染时间16小时;感染后检测时间点(1、3、5、7、9天);培养条件(DMEM、10% FBS等) 阅读提示:见Materials and Methods中的“Cell culture and treatment” |
| 质粒转染 | shRNA-NTCP1、shRNA-NTCP2、shRNA-NC、WT-NTCP、MUT-NTCP的序列;转染试剂(Lipofectamine 2000)及转染时间(48小时) 阅读提示:见Materials and Methods中的“Plasmid transfection”及补充表S1 |
| HBV感染标志物检测 | HBV DNA提取方法(QIAamp DNA Mini Kit);RT-qPCR引物序列;HBV cccDNA提取与检测步骤;HBsAg/HBeAg ELISA试剂盒(Kehua)及操作 阅读提示:见Materials and Methods中的“Real-time quantitative PCR”和“Detection of HBsAg and HBeAg”及补充表S2、S3 |
| 足细胞功能检测 | 细胞凋亡检测(Annexin V/PI染色,流式细胞仪);细胞活力(CCK-8);迁移实验(划痕实验、Transwell);细胞骨架蛋白检测(Western blot,抗体稀释度) 阅读提示:见Materials and Methods中的相关小节及图5-7的图注 |