人甲状腺FNA标本免疫浸润特征分析
鉴定ICI甲状腺炎患者甲状腺组织中的免疫细胞组成和关键亚群
收集ICI甲状腺炎患者甲状腺FNA标本,通过流式细胞术和scRNAseq分析CD45+免疫细胞,并进行TCR测序分析克隆扩增
Clonally expanded, thyrotoxic effector CD8+ T cells driven by IL-21 contribute to checkpoint inhibitor thyroiditis
包含人甲状腺FNA标本的scRNAseq与TCR测序分析、体外功能实验(IL-21刺激人CD8+ T细胞及甲状腺细胞杀伤)、以及体内小鼠模型(IL-21R KO和T细胞过继转移)验证,多层级证据。
ICI甲状腺炎患者甲状腺细针穿刺(FNA)标本 桥本甲状腺炎患者甲状腺FNA标本 NOD小鼠ICI诱导自身免疫模型 NOD.SCID小鼠T细胞过继转移模型
ICI甲状腺炎患者甲状腺浸润中克隆扩增的CXCR6+ GZMB+ IFN-γ+ CD8+效应T细胞频率 IL-21体外刺激人CD8+ T细胞后GZMB和CXCR6表达增加及甲状腺细胞杀伤能力 NOD小鼠中ICI(抗PD-1+抗CTLA-4)处理诱导CD8+效应T细胞和IL-21+ Tfh/Tph细胞扩增 IL-21R敲除小鼠在ICI处理后甲状腺CD45+和CD3+浸润细胞减少
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定ICI甲状腺炎患者甲状腺组织中的免疫细胞组成和关键亚群
收集ICI甲状腺炎患者甲状腺FNA标本,通过流式细胞术和scRNAseq分析CD45+免疫细胞,并进行TCR测序分析克隆扩增
确定ICI甲状腺炎区别于桥本甲状腺炎和健康对照的免疫特征
整合ICI甲状腺炎、HT和健康对照的scRNAseq数据,分析CD8+ T细胞亚群、分化轨迹和克隆扩增
验证IL-21是否能驱动CD8+ T细胞向细胞毒性效应细胞分化并具有甲状腺杀伤能力
从健康供者PBMC分离CD8+ T细胞,用抗CD3/CD28磁珠和重组人IL-21刺激,流式细胞术检测GZMB和CXCR6表达;收集上清液与NThyOri3.1人甲状腺细胞共培养,评估细胞活力
在体内模型中验证ICI治疗是否诱导类似人类的CD8+效应T细胞和IL-21+ Tfh/Tph细胞扩增
NOD小鼠接受抗PD-1和抗CTLA-4单抗或同型对照治疗4周,流式细胞术检测脾脏中CD8+效应T细胞、Tfh/Tph细胞及IL-21+ CD4+ T细胞频率
确定IL-21信号是否为ICI诱导甲状腺自身免疫所必需
使用NOD.Il21r-/-(IL-21R KO)小鼠,经ICI处理后评估脾脏CXCR6+ CD8+ T细胞频率和甲状腺浸润细胞数量;并通过NOD.SCID小鼠过继转移实验验证T细胞IL-21R信号的作用
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 单细胞RNA测序 | 10x Genomics Chromium | 10x Genomics | -- |
| NovaSeq 6000 | Illumina | -- | |
| 细胞培养与刺激 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| Ficoll-Hypaque | -- | -- | |
| 抗CD3/CD28磁珠 | Invitrogen | -- | |
| 重组人IL-21 | PeproTech | -- | |
| 重组人IL-2 | -- | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 细胞分离 | EasySep试剂盒 | STEMCELL Technologies | -- |
| 动物实验 | 抗小鼠CTLA-4抗体(克隆9D9) | BioXCell | BE0164 |
| 抗小鼠PD-1抗体(克隆RPM1-14) | BioXCell | BE0146 | |
| 同型对照抗体(2A3, MPC-11) | BioXCell | BE0089, BE0086 | |
| NPH胰岛素 | -- | -- | |
| 组织处理 | IV型胶原酶 | -- | -- |
| 数据采集 | GraphPad Prism | -- | -- |
| RStudio | -- | -- | |
| Metascape | -- | -- | |
| STARTRAC | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人甲状腺FNA标本采集 | 患者入组标准、FNA采集时间(2个月内)、针规格(25或27号)、采集次数(4次) 阅读提示:材料与方法-研究设计 |
| 单细胞RNA测序 | CD45+细胞分选、10x Genomics Chromium protocol、测序平台(NovaSeq 6000)、数据过滤和聚类参数 阅读提示:材料与方法-单细胞RNA测序、补充材料和方法 |
| 体外T细胞刺激 | PBMC分离方法、CD8+ T细胞分离(磁珠)、培养密度(5×10^5/孔)、刺激物(抗CD3/CD28磁珠)、IL-21浓度(100 ng/mL)、IL-2浓度(50 U/mL)、培养时间(5天) 阅读提示:材料与方法-人原代免疫细胞体外评估 |
| 甲状腺细胞杀伤实验 | NThyOri3.1细胞系、上清液稀释比例(1:1)、DAPI染色、24小时分析 阅读提示:材料与方法-人原代免疫细胞体外评估 |
| 小鼠模型 | 小鼠品系(NOD、IL-21R KO)、年龄(4-6周)、给药剂量(10 mg/kg)、频率(每周两次)、疗程(4周)、给药途径(腹腔注射) 阅读提示:材料与方法-免疫检查点抑制剂治疗小鼠 |
| 流式细胞术 | 抗体克隆、染色方案、门控策略、细胞计数方法 阅读提示:材料与方法-流式细胞术、补充材料和方法、表S2和S3、图S5 |