Paneth细胞与簇状细胞之间的串扰驱动肠道黏膜中的菌群失调和炎症

Cross talk between Paneth and tuft cells drives dysbiosis and inflammation in the gut mucosa

作者信息Nathalie Coutry, Julie Nguyen, Salima Soualhi, François Gerbe, Victoria Meslier, Valérie Dardalhon, Mathieu Almeida, Benoit Quinquis, Florence Thirion, Fabien Herbert, Imène Gasmi, Ali Lamrani, Alicia Giordano, Pierre Cesses, Laure Garnier, Steeve Thirard, Denis Greuet, Chantal Cazevieille, Florence Bernex, Christelle Bressuire, Douglas Winton, Ichiro Matsumoto, Hervé M Blottière, Naomi Taylor, Philippe Jay
PMID37307458
发布时间2023-06
DOI10.1073/pnas.2219431120

实验完整度

高

包含体内遗传小鼠模型(Sox9条件敲除、Pou2f3、SucnR1等基因敲除)、类器官培养、微生物组测序和免疫组化等多层级验证。

主要模型

Sox9LoxP/LoxP;Villin-CreERT2小鼠(诱导性肠上皮Sox9敲除) Sox9LoxP/LoxP;Villin-CreERT2;Pou2f3-/-小鼠(簇状细胞缺陷) Sox9LoxP/LoxP;Villin-CreERT2;SucnR1-/-小鼠 肠道类器官(organoids)

重点核对

Sox9敲除的诱导方式和时间(他莫昔芬口服,每日1 mg,连续5天) 簇状细胞缺陷(Pou2f3-/-)对菌群失调和2型炎症的影响 SucnR1信号在簇状细胞激活和2型炎症中的作用 肠道通透性检测(FITC-dextran灌胃) 微生物群落分析(16S rRNA测序和宏基因组测序)

摘要

肠道菌群失衡(菌群失调)越来越多地与胃肠道内外多种病理状况相关联。肠道Paneth细胞被认为是肠道菌群的守护者,但将Paneth细胞功能障碍与菌群失调联系起来的事件仍不清楚。我们报道了菌群失调起始的三步机制。Paneth细胞的初始改变(如肥胖和炎症性肠病患者的常见情况)导致菌群轻微重塑,并伴随琥珀酸产生菌群的扩增。SucnR1依赖的上皮簇状细胞激活触发2型免疫应答,该应答反过来加剧Paneth细胞的缺陷,促进菌群失调和慢性炎症。因此,我们揭示了簇状细胞在Paneth细胞缺陷后促进菌群失调的功能,以及Paneth细胞在维持菌群平衡以防止簇状细胞不适当激活和有害菌群失调方面未被重视的重要作用。这种琥珀酸–簇状细胞炎症回路也可能导致患者观察到的慢性菌群失调。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
Paneth细胞功能障碍如何导致肠道菌群失调和炎症?
核心机制
Paneth细胞缺陷导致菌群轻微改变,增加琥珀酸产生菌,琥珀酸通过SucnR1受体激活簇状细胞,触发2型免疫反应,2型细胞因子IL-13下调Paneth细胞中RegIII抗菌肽的表达,进一步加剧菌群失调,形成“Paneth细胞-琥珀酸-簇状细胞-免疫系统”回路。
主要证据
通过Sox9诱导敲除小鼠模型,结合Pou2f3和SucnR1基因敲除,利用16S rRNA和宏基因组测序、肠道通透性检测、免疫组化等,证明簇状细胞和SucnR1信号在菌群失调和2型炎症中的必要性。
研究意义
揭示了Paneth细胞和簇状细胞之间的串扰是菌群失调的关键驱动因素,为菌群失调相关慢性疾病的联合治疗(靶向宿主和菌群)提供了新视角。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

诱导Sox9敲除导致Paneth细胞异常

验证Sox9缺失对Paneth细胞分化和功能的影响

利用Sox9LoxP/LoxP;Villin-CreERT2小鼠,通过他莫昔芬诱导肠上皮Sox9敲除,观察Paneth细胞形态、标记物表达和抗菌肽水平。

2

检测菌群失调和肠道屏障功能

评估Paneth细胞缺陷对肠道菌群和通透性的影响

通过16S rRNA测序分析粪便菌群多样性,并通过FITC-dextran灌胃评估肠道通透性。

3

表征2型免疫应答

确定Paneth细胞缺陷诱导的免疫反应类型

通过RT-qPCR检测炎症相关基因表达,免疫组化检测免疫细胞浸润和上皮重塑标志物。

4

验证簇状细胞在菌群失调中的作用

确定簇状细胞是否介导Paneth细胞缺陷导致的菌群失调和炎症

在Sox9缺陷小鼠中敲除Pou2f3去除簇状细胞,比较肠道通透性、白细胞浸润和菌群失调表型。

5

鉴定激活簇状细胞的分子机制

确定菌群产生的琥珀酸是否通过SucnR1激活簇状细胞

通过宏基因组分析琥珀酸产生菌群的富集,并在SucnR1缺陷小鼠中检测簇状细胞激活和后续炎症反应。

6

体外验证IL-13对RegIII表达的调控

证实2型细胞因子IL-13下调Paneth细胞中RegIII抗菌肽的表达

从Sox9缺陷小鼠和对照组分离肠道隐窝进行类器官培养,并用重组IL-13处理,检测RegIII表达。

7

时间动力学验证三步机制

确认菌群失调和炎症发生的先后顺序

在Sox9敲除后第3、5、7天分析Paneth细胞改变、2型免疫反应和上皮重塑标志物。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
他莫昔芬Sigma-Aldrich--
β-萘黄酮MP Biomedicals--
TRIzol试剂Life Technologies--
LightCycler 480 SYBR Green I MasterRoche Diagnostics--
FITC-葡聚糖----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
动物模型
小鼠品系:Sox9LoxP/LoxP;Villin-CreERT2;他莫昔芬给药剂量和方案
阅读提示:Materials and Methods: Animal Strains
肠道通透性测定
FITC-dextran分子量(4-kDa)和给药方式
阅读提示:Materials and Methods: Intestinal Permeability Measurement Using FITC-Dextran
微生物组分析
样本来源(粪便或盲肠内容物)、测序平台(16S rRNA测序和宏基因组测序)
阅读提示:Materials and Methods: Fecal Bacterial DNA Isolation and 16S rRNA Sequencing; Cecal DNA Extraction and High-Throughput Metagenomic Sequencing
类器官培养
类器官培养条件(基质胶、生长因子)、4-OH-tamoxifen浓度和处理时间
阅读提示:Materials and Methods: Organoid Culture; SI Appendix Figure S7