体外验证ANKH介导的ATP和柠檬酸盐释放
确定ANKH是否介导细胞释放ATP和柠檬酸盐
在HEK293细胞中过表达ANKHwt或ANKHL244S,检测培养液中PPi、AMP、柠檬酸盐浓度及ATP释放。
The membrane protein ANKH is crucial for bone mechanical performance by mediating cellular export of citrate and ATP
包含体外细胞实验(HEK293过表达ANKH,检测ATP、PPi、AMP和柠檬酸盐释放)、小鼠模型(Ankank/ank)的体内分析(血浆、尿、骨组织)及患者样本(尿液NMR),并有骨力学测试和多组学分析,构成多层验证。
HEK293细胞过表达ANKHwt或ANKHL244S Ankank/ank小鼠 人类患者尿液样本
HEK293细胞过表达ANKHwt或ANKHL244S,检测细胞培养液中PPi、AMP、柠檬酸盐浓度及ATP释放 Ankank/ank、Ankwt/ank和野生型小鼠的骨组织(胫骨、股骨)中PPi和柠檬酸盐含量 Ankank/ank、Ankwt/ank和野生型小鼠的血浆和尿液柠檬酸盐浓度 Ankank/ank、Ankwt/ank和野生型小鼠的股骨微CT和三点弯曲力学测试
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定ANKH是否介导细胞释放ATP和柠檬酸盐
在HEK293细胞中过表达ANKHwt或ANKHL244S,检测培养液中PPi、AMP、柠檬酸盐浓度及ATP释放。
全面鉴定ANKH依赖性释放的代谢物
对24小时培养液样本进行LC/MS为基础的全球代谢谱分析,检测NMP和TCA循环中间体。
确定Ank缺失对体内柠檬酸盐和PPi水平的影响
使用Ankank/ank、Ankwt/ank和野生型小鼠,检测血浆和尿液柠檬酸盐、骨组织PPi和柠檬酸盐含量。
评估Ank缺失对骨力学性能的影响
通过微CT和三点弯曲测试分析股骨几何和力学性能。
验证ANKH缺失对尿柠檬酸盐的影响
分析一名携带纯合ANKHL244S突变患者和年龄匹配对照的尿液样本的NMR谱。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | HyClone DMEM培养基 | GE | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| Pro293a培养基 | Lonza | -- | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 蛋白检测 | 抗ANKH抗体 | Aviva Systems Biology | OAAB06341 |
| 小鼠抗Na+/K+-ATPase抗体 | Abcam | ab7671 | |
| 代谢物检测 | ATP硫酸化酶 | NEB | -- |
| 腺苷5'-磷酸硫酸 | Cayman Chemicals | -- | |
| 焦磷酸盐 | Sigma-Aldrich | -- | |
| SL-ATP检测试剂 | BioThema | -- | |
| ATP去除试剂 | BioThema | -- | |
| 腺苷-5'-磷酸硫酸 | SantaCruz | -- | |
| Tris-EDTA缓冲液 | BioThema | -- | |
| 柠檬酸检测试剂盒 | Megazyme | -- | |
| ATP释放检测 | BactiterGlo试剂 | Promega | -- |
| LC/MS分析 | Masshunter定性分析软件 | Agilent Technologies | -- |
| LC/MS定量 | Masshunter Profinder定量分析软件 | Agilent Technologies | -- |
| NMR分析 | Bruker 500-MHz核磁共振波谱仪 | Bruker | -- |
| 微CT分析 | Bruker Skyscan 1275微型计算机断层扫描系统 | Bruker | -- |
| nRecon软件 | Bruker | -- | |
| CTan软件 | Bruker | -- | |
| 力学测试 | 定制的GNU Octave脚本 | -- | -- |
| 数据统计 | GraphPad Prism软件 | GraphPad Software Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与ANKH过表达 | HEK293细胞培养条件,ANKHwt和ANKHL244S质粒构建,稳定转染和筛选方法,ANKH蛋白表达验证 阅读提示:Materials and methods 部分:Cell culture, Mutagenesis and overexpression of ANKH |
| 代谢物释放检测 | 细胞接种密度(500,000细胞/孔)、培养液(Pro293a)、检测时间点(0-24小时)、PPi/AMP/柠檬酸盐检测方法 阅读提示:Materials and methods 部分:Enzymatic quantification of PPi, AMP and citrate; LC/MS-based global metabolite profiling |
| 小鼠模型 | 小鼠品系(C3FeB6 A/Aw-J-Ankank/J)、基因型(Ankank/ank, Ankwt/ank, 野生型)、年龄(11-14周龄)、血浆收集方法 阅读提示:Materials and methods 部分:Animals |
| 骨组织分析 | 骨组织处理(去除骨膜和骨髓,甲酸溶解)、PPi和柠檬酸盐检测方法、微CT参数(55kV, 181μA, 74ms暴露时间)、三点弯曲条件(跨度8.7mm, 0.1mm/s) 阅读提示:Materials and methods 部分:Enzymatic quantification of PPi, AMP and citrate; MicroCT; Three-point bending assay |
| 临床样本分析 | 患者基因型(ANKHL244S纯合)、尿液样本制备(离心、pH调节)、NMR参数(500MHz, 90°脉冲, 4s延迟, 256次扫描) 阅读提示:Materials and methods 部分:NMR spectroscopy |