患者样本收集和临床特征分析
收集83例脊髓弥漫性星形细胞瘤患者的临床和病理资料,包括年龄、性别、肿瘤位置、切除程度和随访信息。
回顾性收集2011年至2018年间北京天坛医院神经外科收治的83例脊髓弥漫性星形细胞瘤患者的数据(表1)。
The molecular characteristics of spinal cord gliomas with or without H3 K27M mutation
基于83例脊髓星形细胞瘤的临床病理特征及分子标志物(H3 K27M、IDH1、BRAF V600E、TERT启动子)的检测,并进行预后分析;但主要为回顾性临床病理分析,缺乏功能性实验验证。
83例脊髓星形细胞瘤患者样本 H3 K27M突变型与野生型星形细胞瘤 组织学分级II、III、IV级星形细胞瘤
H3 K27M突变状态通过免疫组化检测(ABE419, Millipore, 1:800) 组织学分级依据2016 WHO分类标准判定 BRAF V600E和TERT启动子突变通过焦磷酸测序检测 MGMT启动子甲基化通过焦磷酸测序检测 生存分析采用Kaplan-Meier法和Cox回归分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
收集83例脊髓弥漫性星形细胞瘤患者的临床和病理资料,包括年龄、性别、肿瘤位置、切除程度和随访信息。
回顾性收集2011年至2018年间北京天坛医院神经外科收治的83例脊髓弥漫性星形细胞瘤患者的数据(表1)。
确定肿瘤的组织学分级和关键分子标志物状态(H3 K27M、Ki-67、IDH1、BRAF V600E、TERT启动子、MGMT启动子)。
对FFPE样本进行H&E染色评估组织学分级;免疫组化检测H3 K27M突变和Ki-67表达;焦磷酸测序检测IDH1、TERT启动子和BRAF V600E突变,以及MGMT启动子甲基化。
评估分子标记物和组织学分级对患者总生存期的影响。
使用Kaplan-Meier法和对数秩检验比较不同亚组的OS;使用单因素和多因素Cox回归分析确定与OS相关的临床病理特征。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组化 | ABE419 | Millipore | -- |
| MIB-1 | Labvision | -- | |
| DNA提取 | QIAmp DNA Mini Kit | Qiagen | -- |
| 焦磷酸测序 | PyroMark Q24 MGMT 试剂盒 | Qiagen | -- |
| PyroMarker Q24 仪器 | Qiagen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| H3 K27M突变检测 | H3 K27M突变状态通过免疫组化检测,抗体ABE419(Millipore)稀释比1:800。 阅读提示:见Materials and methods部分,Evaluation of histological and molecular pathological features |
| Ki-67增殖指数检测 | Ki-67表达通过免疫组化检测,抗体MIB-1(Labvision)稀释比1:50,阳性核比例由神经病理学家手动计算。 阅读提示:见Materials and methods部分,Evaluation of histological and molecular pathological features |
| IDH1/BRAF/TERT突变检测 | IDH1 R132H、BRAF V600E、TERT启动子C228T/C250T突变通过PCR后焦磷酸测序检测,需从FFPE样本提取DNA。 阅读提示:见Materials and methods部分,Evaluation of histological and molecular pathological features |
| MGMT启动子甲基化检测 | MGMT启动子甲基化通过PyroMark Q24 MGMT kit检测。 阅读提示:见Materials and methods部分,Evaluation of histological and molecular pathological features |
| 生存分析 | 采用Kaplan-Meier法和对数秩检验比较OS,单因素和多因素Cox回归分析需明确变量(年龄、性别、级别、H3状态、Ki-67、切除程度)。 阅读提示:见Materials and methods部分,Statistical analysis |