粪居拟杆菌通过调节肠道菌群失调和抑制NLRP3信号通路在鱼藤酮诱导的帕金森病小鼠模型中保护多巴胺能神经元

Bacteroides coprocola protects dopaminergic neurons in rotenone-induced Parkinson's disease mouse model by modulating gut microbiota dysbiosis and inhibiting the NLRP3 signaling pathway

作者信息Zixian Liu, Jiabei Nie, Yimei Li, Maoxin Huang, Ziluo Chen, Shushang Yu, Jiaqi Zheng, Yuyan Tan, Shengdi Chen
PMID41761283
发布时间2026-02-28
DOI10.1186/s40035-026-00542-8

实验完整度

包含体内动物模型、体外细胞实验、组学测序等多层级证据,并进行功能验证和机制验证。

主要模型

鱼藤酮诱导的帕金森病小鼠模型 LPS诱导的骨髓来源巨噬细胞模型 小鼠原代巨噬细胞

重点核对

鱼藤酮腹腔注射剂量为2 mg/kg,每日一次,持续3周 B. coprocola口服灌胃剂量为108 CFU/只/天,持续3周 LPS浓度1 μg/ml,ATP浓度1 mM,刺激BMDMs 24小时 乙酸钠处理浓度5 mM,丁酸钠处理浓度0.5 mM 每组样本量为5或6(如动物实验每组5-15只)

摘要

背景:帕金森病(PD)是一种常见的神经退行性疾病,其发病机制尚不清楚。新出现的证据支持肠道起源假说,强调肠道菌群失调是PD发病的一个促成因素。我们之前的临床研究表明,粪居拟杆菌(B. coprocola),一种产生短链脂肪酸(SCFAs)的肠道细菌,在PD患者中显著减少。本研究旨在探讨B. coprocola在改善PD病理方面的潜力,并探讨其在鱼藤酮诱导的PD小鼠模型中的潜在机制。方法:通过口服给予B. coprocola治疗鱼藤酮诱导的PD小鼠模型三周。采用免疫荧光、Western blotting、流式细胞术、16S rRNA测序和代谢组学评估中脑和肠道变化、NLRP3炎症小体激活、巨噬细胞极化、肠道菌群和SCFA水平。在体外,使用LPS刺激的骨髓来源巨噬细胞,通过siRNA和分子实验验证乙酸钠和丁酸钠处理后NLRP3信号在巨噬细胞极化中的作用。结果:B. coprocola治疗减轻了鱼藤酮诱导的PD小鼠模型中与PD相关的运动缺陷、神经炎症、肠道菌群失调和肠道屏障通透性。机制上,B. coprocola重塑了肠道菌群组成并调节了巨噬细胞极化,这与NLRP3炎症小体信号通路的抑制有关。此外,体外实验证实,B. coprocola的关键代谢物乙酸和丁酸通过游离脂肪酸受体(FFAR)2/3受体减弱炎症反应并促进M2样巨噬细胞极化,从而抑制NLRP3激活。结论:总之,B. coprocola治疗可以改善鱼藤酮诱导的PD小鼠模型的运动缺陷、神经炎症和肠道功能。其作用与微生物群重塑、巨噬细胞极化调节和NLRP3炎症小体通路抑制有关。乙酸和丁酸是B. coprocola的关键代谢物,可能通过FFAR2/3受体在促进M2巨噬细胞极化中发挥重要作用。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
粪居拟杆菌能否改善鱼藤酮诱导的帕金森病小鼠模型的病理和症状,其潜在机制是什么?
核心机制
B. coprocola通过重塑肠道菌群、调节巨噬细胞极化,并经其代谢产物乙酸和丁酸激活FFAR2/3受体,抑制NLRP3炎症小体信号通路,减轻全身慢性炎症。
主要证据
在鱼藤酮诱导的PD小鼠模型中,B. coprocola治疗改善运动功能障碍、肠道功能、多巴胺能神经元存活、紧密连接蛋白表达,并减少LPS漏出;体内外实验证实其抑制NLRP3通路并调节M1/M2巨噬细胞极化。
研究意义
研究揭示了B. coprocola在PD中的保护作用,支持肠道菌群-肠-脑轴参与PD发病,提示B. coprocola作为一种有前景的微生物干预策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

建立鱼藤酮诱导的PD小鼠模型并给予B. coprocola治疗

评估B. coprocola对PD小鼠模型的影响

C57BL/6J小鼠随机分为对照组、模型组和B. coprocola组,模型组腹腔注射鱼藤酮(2 mg/kg)3周,随后B. coprocola组口服灌胃B. coprocola(108 CFU/只/天)3周,对照组和模型组给予溶剂。

2

评估运动功能和胃肠道功能

检测B. coprocola对PD相关行为和胃肠功能的影响

通过转棒实验、爬杆实验、平衡木实验评估运动功能;测量肠道推进距离、结肠长度和粪便含水量评估胃肠功能。

3

分析脑和结肠病理变化

检测B. coprocola对多巴胺能神经元和α-突触核蛋白的影响

通过免疫荧光和免疫组化检测脑和结肠中TH阳性细胞、α-syn和pS129-α-syn的表达。

4

肠道菌群16S rRNA测序分析

评估B. coprocola对肠道菌群多样性和组成的影响

收集粪便样本,提取DNA,进行16S rRNA V3-V4区域扩增和Illumina MiSeq测序,分析α多样性和β多样性及菌属相对丰度。

5

评估肠道屏障完整性和内毒素渗漏

检测B. coprocola对紧密连接蛋白和LPS渗漏的影响

通过Western blot和免疫荧光检测ZO-1和occludin表达,ELISA检测结肠、血液和中脑中的LPS和LBP水平。

6

流式细胞术分析巨噬细胞极化

检测B. coprocola对肠道-血液-大脑轴中M1/M2巨噬细胞极化的影响

从结肠、血液和脑中分离单细胞,使用流式细胞术分析CD80+ M1和CD206+ M2巨噬细胞的比例。

7

检测NLRP3信号通路相关蛋白表达

验证B. coprocola对NLRP3炎症小体通路的抑制作用

通过Western blot检测中脑和结肠中TLR4, MyD88, p-IκB-α, NF-κB, NLRP3, caspase-1, IL-1β和IL-6蛋白水平;ELISA检测血液中IL-1β和IL-6。

8

粪便和细菌上清液SCFA代谢组学分析

鉴定B. coprocola产生的潜在活性代谢物

通过GC-MS和LC-MS/MS检测粪便和B. coprocola培养上清液中短链脂肪酸,并进行PCA和PLS-DA分析。

9

B. coprocola全基因组测序

提供B. coprocola的基因组见解,特别是脂肪酸合成相关基因

提取高质量DNA,使用Illumina和PacBio/Nanopore平台测序,组装环形基因组,进行COG和KEGG功能注释。

10

体外BMDM极化实验

验证乙酸和丁酸对巨噬细胞极化和NLRP3通路的影响

将BMDMs用LPS+ATP诱导,加入NaA或NaB,通过流式细胞术和Western blot检测极化标志物和NLRP3通路蛋白。

11

siRNA敲低FFAR2/3验证受体作用

验证FFAR2/3是乙酸和丁酸调节巨噬细胞极化和NLRP3通路的关键受体

使用siRNA Smart Pool转染BMDMs,敲低FFAR2/3,随后用NaA或NaB处理,通过流式细胞术和Western blot检测M1/M2极化和NLRP3通路蛋白。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
鱼藤酮Sigma-Aldrich83-79-4
二甲基亚砜BeyotimeST038
粪居拟杆菌Mingzhoubio--
PCR试剂Yeasen10102ES03
伊文思蓝Sigma-Aldrich314-13-6
羧甲基纤维素钠Sigma-Aldrich9004-32-4
三溴乙醇----
Fc受体阻断剂BD553141
Zombie Aqua™ 可固定活力试剂盒BioLegend423101
eBioscience™ Foxp3试剂盒Thermo Fisher Scientific00-5523-00
Cyto FLEX流式细胞仪Beckman Coulter--
裂解液BD555899
神经组织解离试剂盒Miltenyi Biotec130-107-677
胃蛋白酶MedChemExpressHY-P1635
RPMI-1640培养基Thermo Fisher Scientific11875093
胎牛血清CapricornFBS-26A
LiberaseSigma-Aldrich5401020001
脱氧核糖核酸酶IRoche11284932001
Percoll分离液Yeasen40501ES60
RIPA裂解液BeyotimeP1046
BCA蛋白定量试剂盒Thermo Fisher ScientificA55860
HRP偶联抗兔二抗AbclonalAS038
HRP偶联抗鼠二抗AbclonalAS003
ECL化学发光试剂盒EpizymeSQ201
NLRP3抗体AdipogenAG-20B-0014-C100
IL-6抗体AbclonalA0286
ZO-1抗体Proteintech21773-1-AP
Occludin抗体Proteintech27260-1-AP
NF-κB抗体AbclonalA19653
SIRT1抗体CST9475
caspase-1抗体CST24232
Iba-1抗体CST17198
磷酸化IκBα抗体HUABIOHA722770
FFAR2抗体Proteintech84544-1-RR
FFAR3抗体HUABIOER63606
TLR4抗体AbclonalA5258
MyD88抗体CST4283
IL-1β抗体Thermo Fisher ScientificP420B
β-肌动蛋白抗体AbclonalAC026
OCT包埋剂Sakura Finetek4583
Leica切片机Leica Microsystems--
微波炉MideaM1-211A
柠檬酸盐缓冲液ServicebioG1202
Triton X-100SigmaX100-5
正常山羊血清BeyotimeC0265
TH抗体Thermo Fisher ScientificP21962
α-突触核蛋白抗体CST4179
Iba-1/AIF-1抗体CST17198
Alexa 488偶联山羊抗兔IgGThermo Fisher ScientificA32723
HRP偶联驴抗兔AbclonalAS038
Alexa 594偶联山羊抗兔IgGThermo Fisher ScientificA11005
TRIzol试剂Vazyme BiotechR411-01
PrimeScript RT-PCR试剂盒AbclonalRK20433
SYBR Premix Ex TaqVazyme BiotechR433
QuantStudio 7平台Life Technologies--
引物GENEWIZ--
ELISA试剂盒Jianglai Industrial LimitedJL20691, JL29644, JL20268, JL18442
QIAamp DNA粪便迷你试剂盒QIAGEN51604
Illumina MiSeq测序系统Illumina--
重组小鼠巨噬细胞集落刺激因子PeproTech315-02-10UG
脂多糖Shandong Sparkjade BiotechnologySJ-MB0005
三磷酸腺苷Shandong Sparkjade BiotechnologySJ-MN0102A
乙酸钠Absinabs42027403
丁酸钠MedChemExpressHY-B0350A
Lipofectamine™ RNAiMAX试剂Invitrogen13778030
靶向FFAR2/3的siRNAGenePharma--
倒置显微镜NikonTi-S
荧光显微镜Nikon CSU-W1 Sora 2 Camera; Olympus CorporationVS120-S6-W

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
动物模型建立
鱼藤酮腹腔注射剂量为2 mg/kg,每日一次,持续3周;溶剂为2% DMSO;C57BL/6J雄性小鼠6周龄,体重20-22g
阅读提示:Materials and methods: Animals and experimental design; Rotenone model induction and administration
B. coprocola处理
B. coprocola规格为108 CFU/只/天,口服灌胃,每日一次,持续3周;菌液溶解在PBS中,灌胃在15分钟内完成
阅读提示:Materials and methods: B. coprocola identification, culture and administration
行为学测试
转棒实验初始速度4 rpm,加速至30 rpm,最大时间120s;爬杆实验记录从杆顶到平台的时间;平衡木实验记录通过时间;每个实验重复3次,间隔30分钟
阅读提示:Materials and methods: Behavioral tests
胃肠功能评估
肠道推进距离使用2.5% Evans blue(0.3 ml)经口给予,麻醉后测量;结肠长度从盲肠末端到肛门
阅读提示:Materials and methods: Intestinal transit distance and colon length measurement
流式细胞术
抗体组合:CD11b-APC, CD45-Percp/Cy5.5, CD86-BV421, CD206-PE, F4/80-BV650, CD80-FITC;使用FMO对照设置门;样本制备方法需遵循方案
阅读提示:Materials and methods: Flow cytometry; Figure S5 for gating strategy
Western blot
抗体稀释比例:anti-NLRP3 1:1000, anti-IL-6 1:1000, anti-ZO-1 1:5000, anti-Occludin 1:5000, anti-NF-κB 1:1000, anti-SIRT1 1:1000, anti-caspase-1 1:1000, anti-Iba-1 1:1000, anti-p-IκBα 1:5000, anti-FFAR2 1:1000, anti-FFAR3 1:1000, anti-TLR4 1:1000, anti-MyD88 1:1000, anti-IL-1β 1:1000;β-actin 1:100000;二抗1:5000
阅读提示:Materials and methods: Western blotting
肠道菌群测序
每只小鼠收集5个粪便颗粒;DNA提取使用QIAamp DNA Stool Mini Kit;PCR扩增V3-V4区,引物357F/806R;测序平台Illumina MiSeq
阅读提示:Materials and methods: Fecal DNA extraction and 16S RNA sequencing
体外BMDM实验
BMDMs在20 ng/mL M-CSF下培养7天;LPS(1 μg/ml)+ATP(1 mM)刺激24h诱导M1;NaA 5 mM或NaB 0.5 mM处理24h;siRNA转染使用Lipofectamine RNAiMAX,转染48h后刺激
阅读提示:Materials and methods: Polarization of mouse BMDMs and SCFA treatment; siRNA transfection
SCFA分析
粪便样本400 mg,预处理包括研磨和超声;使用GC-MS和LC-MS/MS检测;B. coprocola培养上清液也进行分析
阅读提示:Materials and methods: Fecal sample collection and SCFA level measurement
统计分析
多组比较采用单因素方差分析,后采用Tukey's检验或Games-Howell检验;两组比较采用Mann-Whitney U检验或非配对t检验;显著性水平P<0.05
阅读提示:Materials and methods: Statistical analysis